医疗信息化及医学影像处理开源包

本文是参考博客园(http://www.cnblogs.com/kesalin/),及自己在工作中经常要接触到的医疗术语进行整理。这些都是医疗行业最常用的行业术语。

 医疗信息化:


1. HIS: hospital informationsystem 医院信息系统,在国际学术界已公认为新兴的医学信息学(Medical Informatics)的重要分支。美国该领域的著名教授Morris.Collen于1988年曾著文为医院信息系统下了如下定义:利用电子计算机和通讯设备,为医院所属各部门提供病人诊疗信息和行政管理信息的收集、存储、处理、提取和数据交换的能力,并满足所有授权用户的功能需求。

2. RIS: Radiology informationsystem 放射信息管理系统,RIS是优化医院放射科工作流程管理的软件系统,一个典型的流程包括登记预约、就诊、产生影像、出片、报告、审核、发片等环节。RIS系统内含PACS系统,配合医学分类和检索、放射物资管理、影像设备管理和科室信息报表等外围模块,实现了患者在整个流程中的质量控制和实地跟踪,差错统计,为医患纠纷的举证倒置提供依据,从而使得放射科室的管理进入到清晰的数字化管理阶段。

3. EMR:electronicmedical record 电子病历,也即计算机化的病案系统或基于计算机的病人记录。它是用电子设备(计算机、健康卡等)保存、管理、传输和重现的数字化的病人的医疗记录,取代手写纸质病历。EMR是基于一个特定系统的电子化病人记录,该系统提供用户访问完整准确的数据、警示、提示和临床决策支持系统的能力。

4. PACS: picture archiving andcommunication systems,医学影像存档与通讯系统。是近年来随着数字成像技术、计算机技术和网络技术的进步而迅速发展起来的、旨在全面解决医学图像的获取、显示、存贮、传送和管理的综合系统。 PACS在医院影像科室中迅速普及开来。PACS的主要作用有:联接不同的影像设备(CT/MR/X/超声/核医学等);存储与管理图像;图像的调用与后处理。虽然不同的PACS在组织与结构上有很大的差别,但都必须完成这三类型的功能。不管是大型、中型或小型PACS,其建立不外乎由医学图像获取、大容量数据存储及数据库管理、图像显示和处理以及用于传输影像的网络等多个部分组成,保证PACS成为全开放式系统的重要的网络标准和协议DICOM3.0。

5. DICOM: Digital imaging andcommunications in medicine,医学数字成像和通信标准,DICOM标准详细定义了影像及其相关信息的组成格式和交换方法,利用这个标准,人们可以在影像设备上建立一个接口来完成影像数据的输入/输出工作。

 

医学影像处理开源包:


1. ITK: Insight segmentation and registrationtoolkit是一种开源的、跨平台的影像分析扩展软件工具。ITK的开发过程中采用了先进的多模态数据分割配准算法。它提供一些主流算法,如区域生长、阈值分割、基于分水岭的分割、Fast Marching算法、Level Set等多种分割算法,并将这些用于医学图像处理的算法和程序的开发过程屏蔽起来。ITK没有实现可视化的功能,在VTK中可以实现可视化,所以医学影像系统中,在用ITK进行分割的基础上,结合VTK对图像进行可视化处理。

2. VTK: Visualization toolkit是一个开放资源的免费软件系统,主要用于三维计算机图形学、图像处理和可视化。Vtk是在面向对象原理的基础上设计和实现的,它的内核是用C++构建的,包含有大约250,000行代码,650多个类,还包含有几个转换界面,因此也可以自由的通过Java,Tcl/Tk和Python各种语言使用vtk。

3. MITK: the medical imaginginteraction toolkit is a free open-source software system for development ofinteractive medical image processing software. MITK combines the ITK and VTKwith an application framework. As a toolkit, MITK offers those features thatare relevant for the development of interactive medical imaging softwarecovered neither by ITK or VTK.

4. MITK: Medical imaging toolkit,中科院自动化所开发,集成化的医学影像处理与分析C++类库。开发目的是为医学影像领域提供一套整合了医学图像分割、配准和可视化等功能的,具有一致接口的、可复用的、灵活高效的算法开发工具。和VTK的风格类似,MITK采用传统的面向对象的设计方法,而没有采用ITK的范型编程风格。

5. DCMTK: 德国offis公司开发的,提供实现DICOM协议的一个平台,在其基础上,可以轻松地完成图像处理的工作,而不必把太多的精力放在实现dicom协议的细节问题上。

DCMTK is a collection of libraries and applicationsimplementing large parts the DICOM standard. It includes software forexamining, constructing and converting DICOM image files, handling offlinemedia, sending and receiving images over a network connection, as well asdemonstrative image storage and worklist servers.

 

医学影像处理:


1. MPR:Multiplanarreconstruction, allows images to be created from the original axial plane ineither the coronal, sagittal, or oblique plane. 可沿一个任意平面进行重建处理,从而获得冠状面、矢状面、斜矢状面或任意角度的重建图像。

2. CPR:Curve planarreconstruction, 曲面重建。

3. MIP/minIP/aveIP: maximum/minimum/averageintensity projection最大/最小/平均密度投影。 MIP是在可视化平面之上投射三维空间数据的一种计算机可视化方法;其中,沿着从视点到投影平面的平行光线,各个体素密度值所呈现的亮度将以某种方式加以衰减,并且最终在投影平面上呈现的是亮度最大的体素。

4. VR: Volume Rendering体绘制

5. SR:SurfaceRendering 面绘制

6. LUT: Look up-table,实际上就是一张像素灰度值的映射表,它将实际采样到的像素灰度值经过一定的变换,如阈值、反转、二值化、对比度调整、线性变换等,变成了另外一个与之对应的灰度值,这样可以起到突出图像的有用信息,增强图像的光对比度的作用。常用于VR/SR(体绘制/面绘制)后对重建结果进行颜色转换,使其更接近于真实物体的颜色;或者用于在fMRI中标记不同的功能区等。

7. Window width/Window level: 窗宽/窗位。窗宽表示所显示信息强度值的范围,窗位是窗的中心位置。窗技术是CT检查中用以观察不同密度的正常组织或病变的一种显示技术。由于各种组织结构或病变具有不同的CT值,因此欲显示某一组织结构细节时,应选择适合观察该组织或病变的窗宽和窗位,以获得最佳显示。

8. Zoom/Pan/Inverse/Fit/Rotate/Reverse/Flip

(本文转载自http://blog.csdn.net/inter_peng/article/details/25077667)

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