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如何给pajek中的节点和边着色？

 

 如何给pajek中的节点和边着色？_第1张图片

                                                      如何给pajek中的节点和边着色？

http://blog.csdn.net/lyh_shzu/article/details/55236817

 

今天用了pajek画了网络图，如下图：

如何给pajek中的节点和边着色？_第2张图片

但是，边的颜色不知道怎么加上去，找了很多网上的资料都没有详细说明的，后来在软件中测试一下，直接在.net文件中定义好颜色，然后在图的Options——>Colors——>Edges选项中勾选AsDefined on Input File。

 

.net文件中的数据如下（数据来源于http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/SignedNetworks/SampsonT4.paj）：

*Vertices18
 1 "John_Bosco" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown 
 2 "Gregory" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown 
 3 "Basil" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 4 "Peter" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 5 "Bonaventur" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 6 "Berthold" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 7 "Mark" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 8 "Victor" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
 9 "Ambrose" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
10 "Romuald" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
11 "Louis" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
12 "Winfrid" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
13 "Amand" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
14 "Hugh" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
15 "Boniface" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
16 "Albert" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
17 "Elias" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
18 "Simplicius" 0.0 0.0 0.0 ic Green bc Brown
*Edges
1 2 -2 c  Red（如果是无向边，则需要正反两个方向的边都要写颜色，否则，这条边是没有颜色的，eg:节点a和节点b之间）
1 3  3 c Black（有一条无向边，要让这条边显示为Green，则，需要这样写：a b ic Green  ；b a ic Green；这样才可以显示出颜色）
1 7 -3 c  Red（如果单独在a b 后面写 ic Green 而没在b a 后写ic Green，则，这条边不会显示为Green）
1 10 -1 c  Red
1 12  1 c Black
1 14  2 c Black
2 1  3 c Black
2 4 -3 c  Red
2 7  1 c Black
2 8 -2 c  Red
2 12  2 c Black
2 13 -1 c  Red
3 1  3 c Black
3 2 -2 c  Red
3 4 -3 c  Red
3 6 -2 c  Red
3 13  2 c Black
3 16 -1 c  Red
3 17  1 c Black
3 18  2 c Black
4 1 -2 c  Red
4 2 -3 c  Red
4 5  3 c Black
4 6  1 c Black
4 11  2 c Black   
4 14 -1 c  Red
5 4  3 c Black
5 9  1 c Black
5 11  2 c Black
6 2 -1 c  Red
6 3 -3 c  Red
6 4  3 c Black
6 5  1 c Black
6 7 -2 c  Red
6 9  2 c Black
6 17 -2 c  Red
7 2  3 c Black
7 4 -3 c  Red
6 -2 c  Red
7 8 -1 c  Red
7 12  1 c Black
7 16  2 c Black
8 2 -3 c  Red
8 3 -2 c  Red
8 4  3 c Black
8 6  2 c Black
8 9  1 c Black
8 14 -1 c  Red
9 3 -3 c  Red
9 5  1 c Black
9 8  3 c Black
9 12  2 c Black
9 17 -2 c  Red
9 18 -1 c  Red
10 4  3 c Black
10 5  1 c Black
10 9  1 c Black
10 13  2 c Black
11 1 -1 c  Red
11 2 -3 c  Red
11 3 -2 c  Red
11 5  2 c Black
11 8  3 c Black
11 14  1 c Black
12 1  3 c Black
12 2  2 c Black
12 7  1 c Black
13 2 -3 c  Red
13 5  2 c Black
13 6 -2 c  Red
13 7  1 c Black
13 12 -1 c  Red
13 18  3 c Black
14 1  3 c Black
14 4 -3 c  Red
14 8 -2 c  Red
14 12  1 c Black
14 15  2 c Black
14 17 -1 c  Red
15 2  3 c Black
15 3 -2 c  Red
15 4 -1 c  Red
15 7  1 c Black
15 12  2 c Black
15 13 -3 c  Red
16 2  3 c Black
16 3 -1 c  Red
16 4 -3 c  Red
16 7  2 c Black
16 15  1 c Black
16 17 -2 c  Red
17 2  1 c Black
17 3  2 c Black
17 4 -1 c  Red
17 6 -3 c  Red
17 8 -2 c  Red
17 18  3 c Black
18 2  1 c Black
18 3  2 c Black
18 4 -1 c  Red
18 8 -3 c  Red
18 10 -2 c  Red
18 17  3 c Black

我自己的例子：

*Vertices  59

1                                                   "0"

2                                                   "1"

3                                                   "2"

4                                                   "3"

5                                                   "4"

6                                                   "5"

7                                                   "6"

8                                                   "7"

9                                                   "8"

10                                                 "9"

11                                                 "10"

12                                                 "11"

13                                                 "12"

14                                                 "13"

15                                                 "14"

16                                                 "15"

17                                                 "16"

18                                                 "17"

19                                                 "18"

20                                                 "19"

21                                                 "20"

22                                                 "21"

23                                                 "22"

24                                                 "23"

25                                                 "24"

26                                                 "25"

27                                                 "26"

28                                                 "27"

29                                                 "28"

30                                                 "29"

31                                                 "30"

32                                                 "31"

33                                                 "32"

34                                                 "33"

35                                                 "34"

36                                                 "35"

37                                                 "36"

38                                                 "37"

39                                                 "38"

40                                                 "39"

41                                                 "40"

42                                                 "41"

43                                                 "42"

44                                                 "43"

45                                                 "44"

46                                                 "45"

47                                                 "46"

48                                                 "47"

49                                                 "48"

50                                                 "49"

51                                                 "v0"ic Green bc Brown（注意："v0"和ic之间需要有空格，颜色的单词必须首字母大写，且，只写 ic Green 画出来的也是Green，但是，）

52                                                 "v1"ic Green bc Brown（如果只写bc Brown  则，画出来的不是Brown ,我现在也不知道这个bc 的功能是什么）

53                                                 "v2"ic Green bc Brown

54                                                 "v3"ic Green bc Brown

55                                                 "v4"ic Green bc Brown

56                                                 "v5"ic Green bc Brown

57                                                 "v6"ic Green bc Brown

58                                                 "v7"ic Green bc Brown

59                                                 "v8"ic Green bc Brown

*Edges

1                                                   42       42 l "42，6"

1                                                   14       8 l "8，1"

1                                                   8         6 l "6，10"

1                                                   7         40 l "40，5"

1                                                   2         43 l "43，1"

1                                                   3         12 l "12，7"

1                                                   4         27 l "27，7"

1                                                   5         22 l "22，9"

2                                                   47       5 l "5，5"

2                                                   41       23 l "23，10"

2                                                   40       2 l "2，8"

2                                                   14       22 l "22，5"

2                                                   42       46 l "46，9"

2                                                   26       48 l "48，8"

2                                                   25       9 l "9，3"

2                                                   23       3 l "3，2"

2                                                   15       36 l "36，2"

2                                                   3         5 l "5，3"

2                                                   4         36 l "36，8"

2                                                   5         38 l "38，1"

3                                                   15       32 l "32，9"

3                                                   34       13 l "13，4"

3                                                   36       32 l "32，5"

3                                                   29       32 l "32，5"

3                                                   27       29 l "29，6"

3                                                   4         40 l "40，7"

3                                                   5         17 l "17，4"

4                                                   43       12 l "12，6"

4                                                   41       33 l "33，6"

4                                                   36       46 l "46，8"

4                                                   34       14 l "14，3"

4                                                   5         9 l "9，3"

5                                                   42       1 l "16，4"

5                                                   48       7 l "7，1"

5                                                   45       21 l "21，8"

6                                                   7         6 l "6，1"

8                                                   9         21 l "21，2"

8                                                   10       2 l "2，8"

9                                                   10       1 l "1，7"

10                                                 38       2 l "2，2"

11                                                 12       31 l "31，9"

11                                                 13       41 l "41，1"

11                                                 14       28 l "28，4"

12                                                 13       14 l "14，10"

12                                                 14       31 l "31，8"

13                                                 14       9 l "9，8"

15                                                 40       28 l "28，6"

15                                                 16       38 l "38，6"

17                                                 18       13 l "13，8"

17                                                 19       40 l "40，9"

17                                                 20       33 l "33，3"

17                                                 21       14 l "14，6"

17                                                 22       7 l "7，3"

17                                                 23       8 l "8，3"

17                                                 24       12 l "12，6"

18                                                 19       18 l "18，4"

18                                                 20       47 l "47，1"

18                                                 21       34 l "34，5"

18                                                 22       18 l "18，9"

18                                                 23       25 l "25，6"

18                                                 24       8 l "8，4"

19                                                 20       40 l "40，9"

19                                                 21       1 l "1，5"

19                                                 22       21 l "21，5"

19                                                 23       44 l "44，3"

19                                                 24       7 l "7，1"

20                                                 21       17 l "17，9"

20                                                 22       41 l "41，6"

20                                                 23       22 l "22，8"

20                                                 24       27 l "27，2"

21                                                 22       27 l "27，4"

21                                                 23       15 l "15，5"

21                                                 24       23 l "23，10"

22                                                 23       46 l "46，1"

22                                                 24       13 l "13，2"

23                                                 24       45 l "45，9"

28                                                 29       17 l "17，1"

28                                                 30       47 l "47，4"

28                                                 31       38 l "38，8"

28                                                 32       1 l "1，9"

29                                                 30       46 l "46，9"

29                                                 31       5 l "5，7"

29                                                 32       2 l "2，1"

30                                                 31       11 l "11，8"

30                                                 32       39 l "39，9"

31                                                 32       21 l "21，1"

33                                                 34       49 l "49，6"

35                                                 36       12 l "12，3"

35                                                 37       48 l "48，8"

35                                                 38       5 l "5，9"

35                                                 39       23 l "23，10"

36                                                 37       17 l "17，6"

36                                                 38       49 l "49，9"

36                                                 39       33 l "33，3"

37                                                 38       11 l "11，2"

37                                                 39       6 l "6，2"

38                                                 39       43 l "43，8"

40                                                 41       29 l "29，2"

41                                                 49       44 l "44，4"

42                                                 43       10 l "10，3"

42                                                 44       31 l "31，4"

43                                                 44       20 l "20，8"

44                                                 48       14 l "14，8"

46                                                 47       9 l "9，5"

46                                                 48       10 l "10，10"

46                                                 49       10 l "10，4"

46                                                 50       50 l "50，5"

47                                                 48       26 l "26，5"

47                                                 49       41 l "41，9"

47                                                 50       27 l "27，3"

48                                                 49       22 l "22，4"

48                                                 50       50 l "50，8"

49                                                 50       8 l "8，5"

51                                                 39       58 l "58"

52                                                 6         4 l "4"

53                                                 24       47 l "47"

54                                                 19       80 l "80"

55                                                 30       70 l "70"

56                                                 22       50 l "50"

57                                                 13       41 l "41"

58                                                 32       34 l "34"

59                                                 49       47 l "47"

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    因为论文要用小世界网络和无标度网络，之前一直用matlab代码生成小世界无标度网络。老板说不好引用，要用一个权威的软件来生成网络。原来只用过write_to_pajek把matlab邻接矩阵导入pajek来画图（有大量帖子讲这个）。然而没有pajek->matlab的，捣鼓了一下午，发现用如下步骤就可以了。下面以pajek生成小世界网络导入matlab为例：1.net->randomNetwork
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    前言：研究生期间主要做复杂网络聚类，也称为社区检测。临毕业前，老师让之前发表的论文里的算法代码C化，并写出界面进行可视化。由于之前虽然做过可视化，但基本上都是将聚类结果导入到pajek或者gephi这类专门的软件里进行绘制的。想要将社区检测结果实时的进行绘制并且要通过C\C++直接绘制，确实没有什么头绪。后来，通过浏览博客知道igaph这个包可以使用，由于想要熟悉下python，于是选择了Pyth
  • 利用Pajek软件批量处理excel数据，批量生成网络关系图 zhou_wei_xin
    利用Pajek软件批量处理excel数据，批量生成网络关系图Pajek软件大家想必都不陌生，但是我很陌生，因为我用它不是进行网络分析，而是用它来画关系图（类似网络图）。但是Pajek软件手工操作时一次只能导入一个数据文件（如:.net文件）生成相应的1张关系图，而我需要生成450张关系图，逐个数据文件手工操作是不现实的。查阅资料显示R语言或Python与Pajek混合编程可能实现这种功能，但是笔者
  • 复杂网络常用数据集网站 Mordor Boy 资料搜集
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    网络文件的创建Vertices151"m02"0.18570.27810.5000box2"m03"0.54820.61690.50003"w07"0.22190.45260.5000ellipse*Arcs210129121313101*Edegs*Vertices151"m02"0.18570.27810.5000box2"m03"0.54820.61690.50003"w07"0.22190
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  • 利用Gephi生成可视化拓扑图 lymh 其它记录可视化工具拓扑图csvDephi
    突然发现好久没更文章了，先写一篇记录一下近期的工作吧。近期有很多工作都要在图上进行优化，虽然可以写代码做统计，但是缺少一种比较直观的可视化工具。通过搜索找到了这三个工具：Graphviz，Gephi和Pajek。比较了一下，觉得Gephi操作最简单，所以就用它啦。一、安装：网上很好下载到。打开后界面有“概览”、“数据资料”和“预览”三栏。主要的绘图工作在“概览”中完成，“数据资料”以表格形式存储了
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    随着大数据时代的到来，大数据分析也应运而生。大数据分析是指对规模巨大的数据进行分析，大数据通常数据量大，速度大（高性能），因此大数据分析工具的产生尤其重要。Pajek是目前用于分析大数据的有力工具。Pajek是大型复杂网络分析工具，是用于研究目前所存在的各种复杂非线性网络的有力工具。Pajek在Windows环境下运行，用于带上千乃至数百万个结点大型网络的分析和可视化操作。Pajek的主要工作项在
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    好久没更新博客了，水一篇：名称项目链接属性Cytoscapehttp://www.cytoscape.org/开源软件Gephihttps://gephi.org/开源软件Pajekhttp://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/免费软件TouchGraphhttp://www.touchgraph.com/navigator商业软件30天免费UCINE
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  • 介绍几个图论和复杂网络的程序库 —— BGL，QuickGraph，igraph和NetworkX phay
    引自：http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=297233刚加入复杂网络圈子，暂时还没有成熟的研究内容，先发个资料性的东西占坑：）作复杂网络研究离不开对各种实际或模拟网络的统计、计算、绘图等工作。对于一般性的工作，我们可以用Pajek、Netdraw和Ucinet等软件完成。但对一些特殊应用（比如自己开发了一个新模型），现有的软件不能提供相应
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    ucinet介绍UCINET为菜单驱动的Windows程序，可能是最知名和最经常被使用的处理社会网络数据和其他相似性数据的综合性分析程序。与UCINET捆绑在一起的还有Pajek、Mage和NetDraw等三个软件。UCINET能够处理的原始数据为矩阵格式，提供了大量数据管理和转化工具。该程序本身不包含网络可视化的图形程序，但可将数据和处理结果输出至NetDraw、Pajek、Mage和Krack
  • 复杂网络的数据集 电击小子_ea1b
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  • 复杂网络常用数据集网站 Hdevin
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  • 实操心得 Sugwa
    在机房中上课时，我们一般都会看一些与本节课有关的视频内容，不过演讲人的语速太快或者没有字幕的情况下，理解能力就会变得慢，很多时候都要经常回宿舍后再看两三遍视频，去猜测去理解该视频的意义。有时会有实操，例如以前有实操过的pajek。当导入数据后生成的三维图很是令人惊讶，对互联网越来越好奇了。也试过修改一个网页的语言，你可以在范围内选择任何你想要的语言，这个学习方便了以后我们访问外国网站。实操课上也会
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    全网独家[下文有视频教程]《CiteSpace、Ucinet、Vosviewer、gephi等文献计量与可视化软件同时处理知网、万方、维普数据库》，结果更加客观、科学、权威！目前，我们利用可视化软件，诸如CiteSpace、Ucinet、Vosviewer、gephi、pajek等处理中文文献时，往往只能处理一个数据库，这就具有局限性了，因为一个数据库往往收集的数据有遗漏，导致结果往往有些偏颇。综
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    Netdraw作为Ucinet内置插件，其在画图和可视化分方面应用广泛，它作为Ucinet数据分析后画图的软件，也是唯一可以添加属性文件的画图软件，另外，与其他软件互动方面也具有天然优势，既可以作为Bibexcel软件的画图软件，也在与Pajek，Citespace等知识图谱软件互动方面表现优异，比如，3D画图。我们在Ucinet进行凝聚子群分析，QAP等分析之前先推出Netdraw课程，目的在于
  • 复杂网络研究数据集 Li_Michael 开发准备
    复杂网络研究数据集作者：Hdevin来源：http://www.jianshu.com/p/9313bc75c94b2016.09.2108:36复杂网络的研究很多都离不开数据集，下面这些是个人在做科研的过程中在互联网上搜集到的一些数据集网站，列举出来也方便同行们去使用。1、http://vladowiki.fmf.uni-lj.si/doku.php?id=pajek:data:urls:ind
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    面向对象：把要完成的一件事，通过对象间的协作实现。 面向过程：把要完成的一件事，通过循序依次调用各个模块实现。 我把大象装进冰箱这件事为例，用面向对象和面向过程实现，都是用java代码完成。 1、面向对象 package bigDemo.ObjectOriented; /** * 大象类 * * @Description * @author FuJian
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      openjdk上关于hotspot将移除永久带的描述非常详细，http://openjdk.java.net/jeps/122   JEP 122: Remove the Permanent Generation Author Jon Masamitsu Organization Oracle Created 2010/8/15 Updated 2011/
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