【函数】R语言System {base}函数简介
以下翻译自：Rdocumentation：system {base}
R语言System {base}函数简介
描述
函数system的作用是，调用由参数command指定的操作系统命令。
用法
system(command, intern = FALSE,
ignore.stdout = FALSE, ignore.stderr = FALSE,
wait = TRUE, input = NULL, show.output.on.console = TRUE,
minimized = FALSE, invisible = TRUE)参数
| 参数 | 说明 |
|---|---|
| command | 待执行的系统命令，是一个字符串 |
| intern | 逻辑值（非NA值），声明是否将执行系统命令得到的结果，作为R的字符向量输出 |
| ignore.stdout, ignore.stderr | 逻辑值（非NA值），声明是否忽略stdout或stderr信息 |
| wait | 逻辑值（非NA值），声明R解释器是否需要等待系统命令执行完毕，还是可以异步（不同时）执行。如果参数intern = TRUE，那么参数wait将会被忽略（R解释器会一直等到系统命令执行完成，即wait总是等于TRUE） |
| input | 如果提供了一个字符向量，则会按照每行一个字符串的格式，将其复制到一个临时文件中，并将command的标准输入形式重定向到该文件 |
| show.output.on.console | 逻辑值（非NA值），声明是否将执行系统命令得到的结果，显示在R控制台中（不是使用Rterm，除非参数wait = FALSE，否则Rterm是将结果显示在终端） |
| minimized | 逻辑值（非NA值），声明是否将CMD窗口最小化显示 |
| invisible | 逻辑值（非NA值），声明是否在屏幕上显示CMD窗口 |
【注】：show.output.on.console、minimized、invisible都是在Windows系统下才能使用的参数，在本平台使用将会被忽略，并抛出警告。
细节
多年来，这个接口已经变得相当复杂：请参阅system2，以获得更适合新代码的便携式和灵活接口。
command将被解析为一个命令加上由空格分隔的参数。所以如果命令的路径（或单个参数，如文件路径）包含空格，则必须由（例如）shQuote引用。在Windows上只允许使用双引号：详见示例。（注意：Windows路径名不能包含双引号，所以我们不需要担心转义嵌入的引号。）
command必须是可执行文件（扩展名为.exe，.com）或批处理文件（扩展名为.cmd和.bat）：如果没有提供，则会依次尝试这些扩展名。这意味着不能使用重定向、管道、DOS内部命令等：如果你想传递一个shell命令行，请参阅shell。
command的搜索路径可能与系统有关：它将包含Rbin目录、在PATH之前的工作目录和Windows系统目录。类似Unix的操作系统会将命令行传递给shell（通常是/bin/sh，而POSIX需要这个shell），所以command可以是shell认为可执行的任何东西，包括shell脚本，它可以包含多个命令，以;区分开。
在Windows系统中，函数system不会使用shell，有另外一个独立的函数shell可以将命令行传递给shell。
若intern = TRUE，则会使用popen来调用命令，并将结果以R的字符向量形式逐行输出；若intern = FALSE，则使用C函数system来调用命令。
wait是通过在命令后面附加&得以执行的：这在原理上是依赖于shell的，也是POSIX的要求，并得到了广泛支持。
前两个参数之后的其他参数在排序时，顺序会不时发生变化：因此建议对首个参数之后的所有参数进行命名。
用函数system来确定一个命令是否可以运行有很多缺陷，推荐使用Sys.which。
值
若intern = TRUE，命令结果是一个字符向量，按照每个字符串一行的格式将其输出。（输出结果超过8095字节的行将被拆分）如果命令无法运行，则会生成错误提示（R error）。在Rgui控制台中，除非设定ignore.stderr = TRUE，否则 intern = TRUE会捕获stderr信息。如果运行command，但得到一个非零的退出状态，则将抛出一个警告，并在结果属性status中提示：属性errmsg可能也适用。
若intern = FALSE，给定invisible = TRUE，返回值将是一个错误代码（0代表成功）（因此需要设置显式输出）。若命令始终无法运行，返回值是127。此外，若wait = TRUE，执行命令后返回的值是退出状态，若wait = FALSE，返回值为0（常规成功值）。某些Windows命令会返回超出范围的状态值（例如-1），因此只使用该值的后16位。
若intern = FALSE，wait = TRUE，show.output.on.console = TRUE，命令（控制台应用程序）输出的stdout和stderr信息将会呈现在R控制台（Rgui）或正在运行R的窗口（Rterm）（除非ignore.stdout = TRUE或ignore.stderr = TRUE）
并非所有的Windows可执行文件都能正确遵循输出的重定向，或者只能满足从Rterm等控制台应用程序（而不是从Rgui）执行重定向：例如，fc.exe就是其中之一，但我们最近取得了更大的成功。
Stdout和Stderr
对于GUI，当intern = FALSE时，发送到stdout或stderr的输出结果是接口特定的，如果这些消息出现在GUI控制台中，将很不安全。（在macOS的GUI控制台上确实是如此执行的，但在其他一些控制台上没有这么做）
对于命令行R，除非设置ignore.stderr = TRUE，否则写入stderr的错误消息将被发送到终端，可以通过如下代码（在最有可能的shell中）获得消息内容：
system("some command 2>&1", intern = TRUE)与命令的交互
准确地说，不论Rgui或Rterm是否正在使用，不论控制台命令或GUI应用程序是否正在运行，用户可见的取决于可选参数。
默认情况下，在命令结束并显示输出前，前端不会显示任何信息。
对于控制台命令Rgui会打开一个新的控制台，因此若设置invisible = FALSE，在命令持续期间，会出现一个命令窗口。对于Rterm，只有当wait = FALSE和invisible = FALSE时，才会出现一个单独的命令窗口。
除非invisible = FALSE，否则GUI应用程序不会在任何前端显示。
可以通过键盘操作（Rgui中使用Esc键，或Rterm中使用Ctrl+C）或在Rgui菜单里，中断正在运行（等待中）的命令：这个操作会将控制权返回给R控制台。R会试图完全中断该过程，但可能需要强制终止，并有可能丢失未保存的工作等。
要求用户从Rgui输入设置intern = TRUE或设置show.output.on.console = TRUE的控制台应用程序是不起作用的，无须尝试运行。
Unix和Windows的不同之处
Windows和类Unix操作系统的启动过程基本上是不同的，在R函数所在的高级操作系统函数中也是如此。所以在操作系统之间，函数system的表现有许多不同也不足为奇。为满足程序员的便利需求，本节总结了较为重要的部分。
最重要的不同之处是，在类Unix系统中，函数
system会启动一个（稍后将）运行command的shell。而在Windows系统中，则是直接运行命令——用函数shell通过一个shell界面运行commad（默认情况下Windows shell是cmd.exe，其与POSIX shell有很大区别）。
这意味着，重定向或管道命令在函数system中不起作用（重定向有时可以运行，但发生过安装完Windows安全补丁后就停止运行的情况），Windows系统上必须使用函数system2（或函数shell）当未捕获信息时，stdout和stderr会如何变化，取决于R是如何运行的：Windows系统下的批处理命令就像类Unix系统一样，但在Windows GUI中信息通常会丢失。除非设置
ignore.stderr = TRUE，否则在Windows GUI控制台的运行中，system(intern = TRUE)将会捕获stderr信息错误（error）提示在细节方面有所不同（不同的R版本之间也不同）
command的引用约定各不相同，但shQuote是一个便携式接口参数
show.output.on.console、minimized、invisible仅在Windows系统下使用（这些参数与Windows系统的Rgui关系最为密切）
另外参见
查看非原始的接口：shell或shell.exec。查看man system和man sh了解这个过程如何在操作系统上实现。
查看.Platform了解平台特定的变量。
使用pipe建立管道连接。
例子
# 使用-F标记列出当前目录中的所有文件
system("ls -F")
# t1是一个字符向量，其中各个元素分别对应于who输出的每一行（假设该平台存在对象who）
t1 <- try(system("who", intern = TRUE))
try(system("ls fizzlipuzzli", intern = TRUE, ignore.stderr = TRUE))
# 返回结果长度为0，因为文件不存在，并会抛出警告# 启动一个编辑器, 等待其退出
## Not run: system("notepad myfile.txt")
# 打开最常用的shell:
## Not run: system(Sys.getenv("COMSPEC"))
## Not run:
## 注意如下两种引用方式:
system(paste('"c:/Program Files/Mozilla Firefox/firefox.exe"',
'-url cran.r-project.org'), wait = FALSE)
## End(Not run)