Circos-Windows实战笔记（安装篇）

既然从头开始学习Circos,就得了解Circos到底是啥，首先可以去Circos的官网看看http://circos.ca/

一言以蔽之：Circos是一个circos是用于可视化数据和信息的软件包。 它以圆形布局可视化数据。

具体的可以参照circos官方教程 - http://circos.ca/intro/tabular_visualization/。

官网图

话不多说，开始实战！

（1）circos这个软件是依托于Perl的，如果没有安装的话，得先需要安装perl这个软件，我按照教程，下载了strawberry perl.网址：http://strawberryperl.com/

strawberry perl下载网页

（2）下载后之后，解压--->安装，如何检验安装之后有没有成功呢？可以按win+R键，输入cmd进入命令行模式，然后输入perl -v

perl测试

（3）接下来，配置perl~
输入一下代码：首先点开perl

perl界面

然后在命令行里输入以下命令

Config::General (v2.50 or later)
Font::TTF
GD
List::MoreUtils
Math::Bezier
Math::Round
Math::VecStat
Params::Validate
Readonly
Regexp::Common
Set::IntSpan (v1.16 or later)
Text::Format

perl安装模块

在等它下载的时候，我们可以把Circos下载了。

image.png

我安装的时候把它装在了perl文件夹底下。然后直接解压，这个时候可以运行示例文件，看看下载安装是否有问题。(ps:我的Perl和Circos都没有装在C盘)

F:\perl>cd  F:\perl\circos-0.69-6\example

F:\perl\circos-0.69-6\example>perl ..\bin\circos -conf.\etc\circos.conf

华丽丽的报错了，看看是哪里有问题：有的模块还没安装上（如箭头所示）

报错信息

（4）模块安装
直接进入网站 https://metacpan.org/
输入你需要下载的模块名字

image.png

然后可以直接下载到本地（最好下载到perl/lib/ 这个路径下，然后直接解压到lib文件夹下）

image.png

然后在命令行底下输入
1:perl Makefile.PL
2:gmake
3:gmake test
4:gmake install

下载安装模块

image.png

（5）再次尝试，测试画图

测试画图代码

F:\perl\circos-0.69-6\example>perl ..\bin\circos -conf .\etc\circos.conf

测试代码跑完

测试结果