有关ATAC-seq

TAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放性）的方法。

ATAC-seq使用改造后的Tn5转座酶，并将转座DNA设计为测序接头，这样通过“剪切”和“粘贴”的方式，直接将测序接头引入开放染色质中，进行捕获测序。

ATAC-seq与其他开放性染色质研究的区别？

常见染色质开放性检测技术比较

如图，事实上针对染色质开放性的研究已经持续了几十年，相关技术包括基于核酸酶切割的MNase-seq和DNase I，基于抗体富集的ChIP-seq和基于酚氯仿抽提的FAIRE-seq等。相比于这些传统的技术，ATAC-seq具有以下显著优势：

01. 操作简单省时，建库步骤简化，因此提高了可重复性并降低错误率；02. 不依赖抗体，可实现对无ChIP级别抗体转录因子的结合位点分析；03. 样本起始量大大降低，只需要105左右的细胞即可完成一次实验。

ATAC-seq是否适用于我的研究领域？

ATAC-Seq 作为一种高性价比、获取信息全面、起始量低的研究方法，在动植物表型差异、复杂疾病、肿瘤研究中都具有广泛的应用前景。具体研究领域包括但不限于以下方面：

1. 染色体开放性图谱绘制 2. 作物表观修饰差异研究 3. 胚胎发育表观遗传修饰 4. 肿瘤发生表观机制研究 5. 疾病潜在标志物的预测 6. 肿瘤异质性或分型研究