【Kaggle笔记】良/恶性乳腺肿瘤数据（线性分类）

系统环境

• win10
• Anaconda3

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数据集

• 良/恶性乳腺肿瘤数据集

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代码

# -*- coding: utf-8 -*-
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良/恶性乳腺肿瘤数据线性分类

模型对比：
LogisticRegression (计算时间长，模型性能略高)
SGDClassifier      (计算时间段，模型性能略低)
"""
# 导入pandas与numpy工具包。
import pandas as pd
import numpy as np

# 创建特征列表。
column_names = ['Sample code number', 'Clump Thickness', 'Uniformity of Cell Size', 'Uniformity of Cell Shape', 'Marginal Adhesion', 'Single Epithelial Cell Size', 'Bare Nuclei', 'Bland Chromatin', 'Normal Nucleoli', 'Mitoses', 'Class']

# 使用pandas.read_csv函数从互联网读取指定数据。
data = pd.read_csv("breast-cancer-wisconsin.txt", names = column_names )

# 将?替换为标准缺失值表示。
data = data.replace(to_replace='?', value=np.nan)

# 丢弃带有缺失值的数据（只要有一个维度有缺失）。
data = data.dropna(how='any')

# 输出data的数据量和维度。
# print(data.shape)


# 使用sklearn.cross_valiation里的train_test_split模块用于分割数据。
from sklearn.cross_validation import train_test_split

# 随机采样25%的数据用于测试，剩下的75%用于构建训练集合。
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(data[column_names[1:10]], data[column_names[10]], test_size=0.25, random_state=33)


# 从sklearn.preprocessing里导入StandardScaler。
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 从sklearn.linear_model里导入LogisticRegression与SGDClassifier。
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.linear_model import SGDClassifier

# 标准化数据，保证每个维度的特征数据方差为1，均值为0。使得预测结果不会被某些维度过大的特征值而主导。
ss = StandardScaler()
X_train = ss.fit_transform(X_train)
X_test = ss.transform(X_test)

# 初始化LogisticRegression与SGDClassifier。
lr = LogisticRegression()
sgdc = SGDClassifier()

# 调用LogisticRegression中的fit函数/模块用来训练模型参数。
lr.fit(X_train, y_train)
# 使用训练好的模型lr对X_test进行预测，结果储存在变量lr_y_predict中。
lr_y_predict = lr.predict(X_test)

# 调用SGDClassifier中的fit函数/模块用来训练模型参数。
sgdc.fit(X_train, y_train)
# 使用训练好的模型sgdc对X_test进行预测，结果储存在变量sgdc_y_predict中。
sgdc_y_predict = sgdc.predict(X_test)


# 从sklearn.metrics里导入classification_report模块。
from sklearn.metrics import classification_report

# 使用逻辑斯蒂回归模型自带的评分函数score获得模型在测试集上的准确性结果。
print('Accuracy of LR Classifier:', lr.score(X_test, y_test))
# 利用classification_report模块获得LogisticRegression其他三个指标的结果。
print(classification_report(y_test, lr_y_predict, target_names=['Benign', 'Malignant']))


 # 使用随机梯度下降模型自带的评分函数score获得模型在测试集上的准确性结果。
print('Accuarcy of SGD Classifier:', sgdc.score(X_test, y_test))
# 利用classification_report模块获得SGDClassifier其他三个指标的结果。
print(classification_report(y_test, sgdc_y_predict, target_names=['Benign', 'Malignant']))

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线性分类模型比对结果

• LogisticRegression (计算时间长，模型性能略高)
• SGDClassifier (计算时间段，模型性能略低)