labrador1986
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chipseq 分析中macs2安装的一个debug过程

conda create -n chipseq python=2
source activate chipseq
conda install macs2s

macs2 callpeak -c IgGold.bam -t RYBP.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n RYBP

运行macs2的时候出现了报错，试了几种方法，把MACS单独安装在一个环境变量，升级下python3,结果都还是报错


chipseq 分析中macs2安装的一个debug过程_第1张图片
image.png

经过jimmy大神的协助，安装了libgfortran==1,进行版本降级

conda install libgfortran==1

然后成功debug

macs2 callpeak -c IgGold.bam -t ring1B.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n ring1B 2/ring1B.macs2.log
chipseq 分析中macs2安装的一个debug过程_第2张图片
image.png

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