PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具

PROTTER是一个交互式的蛋白质序列,拓扑和注释工具。使用Protter网页应用你可以轻松的创建高质量的蛋白拓扑图,其具有高的定制和交互功能。
如图所示:

PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第1张图片

官方网址为:http://wlab.ethz.ch/protter/start/
其用户界面如图这样子:

PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第2张图片

其菜单功能如下,我们可以依次选择进行交互,交互修改是即时修改的,所以非常方便:

1.输入蛋白

输入蛋白有两种方式,一种是输入UniProt,另外一种为直接输入FASTA格式的序列。

PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第3张图片

当然也可以批量输入蛋白。
PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第4张图片

2.拓扑

PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第5张图片

主要是设置跨膜区域,可以分别使用 UniProtPhobius来自动设置膜区域,当然也可以用户自定义设置。
具体的功能同样也可以查看官方演示:

更多原创精彩内容敬请关注生信杂谈

PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具_第6张图片

你可能感兴趣的:(PROTTER:蛋白质序列,拓扑和注释工具)