菌类植物fungi，植物体内不含色素，不能光合作用，大部分营异养生活。
细菌门（Schizomycophyta）
细胞是单细胞的原核生物，无色素，异养型，一般没有真正的核结构。可以分为球菌、杆菌和螺旋菌三大类。球菌一般没有鞭毛，杆菌和螺旋菌某一个阶段有鞭毛，可以游动。营寄生或者腐生生活。也存在诸如铁细菌和硝化细菌的自养细菌。生殖方式为细胞分裂生殖，环境不适宜的时候可以形成芽孢（原生质体凝缩，其外包被着一层含脂肪的、坚硬而不透水的壁）。放线菌类属（Actinomycetes）是一类不具有鞭毛的杆状细菌，在一定条件下可以分枝形成丝状体，有人认为放线菌是出于真菌和细菌之间的过渡状态。放线菌可以产生诸如链霉素、四环素、土霉素、氯霉素等抗菌素。
粘菌门（Myxomycophyta）
在生长期或营养阶段，菌体裸露、无细胞壁，呈多核的原生质团，无叶绿素、异养，类似于变形虫式的运动和吞食固体食物的方式，繁殖时节或在劣境条件下，发育为具有纤维素的孢子，而似真菌。因此粘菌是一种介乎动物和真菌之间的一种生物。
发网菌属（Stemonitis）：是黏菌中最常见的、最广泛分布的一类。其营养体为裸露的原生质团，称为变形体。呈现不规则的网状，在无性繁殖的时候，变形体爬到干燥光亮的地方，形成很多的发状突起，每个突起发展为一个具有柄的孢子囊（子实体）。一般为长筒形、紫灰色，外有包被peridium。孢子囊柄深入囊中的部分称为囊轴，囊内有孢丝交织为孢网。然后原生质团中的许多核进行减数分裂，原生质团被割裂为许多单核的小原生质，每块小原生质分泌出细胞壁，形成一个孢子，藏在孢丝的网眼之中。成熟时，包被破裂，借助孢网的弹力孢子弹出。之后孢子在适宜的环境下，萌发为具两条不等长鞭毛的游动细胞，游动细胞的鞭毛可以收缩为变形体状的细胞，称为变形菌胞。有性生殖时由游动细胞或变形菌胞两两结合，形成合子，不经过休眠，合子核进行多次有丝分裂，形成多数双倍体核，构成一个多核的变形体。
真菌门（Eumycophyuta）
真菌是一类不含叶绿素、异养的真核生物。都有细胞壁，细胞壁含几丁质（chitin），也有的含有纤维素。多数植物体由细丝组成，每一细丝叫做微丝（hypha），菌丝有的分隔称有隔菌丝（septet hypha），有的不分隔呈非细胞结构状态，称无隔菌丝（nonseptet hypha）,生殖阶段由分支的菌丝组合而成的菌丝团称为菌丝体（mycelium）常见的有根状菌索、菌核和子座等。高等种类的菌丝体，可以发育为不同的子体。
真菌因其不含光合色素而营异养生活绝大多数为腐生或者寄生。
真菌的生殖方式多种多样，无性生殖极为发达，可以产生多种类型的孢子。孢子有的内生生于孢子囊之中，或者外生。同时还可以通过菌丝断裂进行营养生殖。有性生殖有同配、异配和卵式生殖。低等真菌多为同配或者异配。
在真菌的生活史中，单倍体无性生殖占的时间较长，而有性生殖形成的二倍体合子很快进行减数分裂，形成单倍体的繁殖孢子。因此真菌没有世代交替，但有单倍体和二倍体的核相交替。主要分为如下几个亚门：
鞭毛菌亚门（Mastigomycotina）
除少数单细胞个体外，绝大多数为分枝的丝状体。菌丝多核，繁殖期菌丝的基部产生横隔，形成一个能产生单鞭毛或者双鞭毛游动孢子的特定细胞。有性生殖时产生卵孢子或休眠孢子；低等的种类为同配或者异配。
代表：水霉属（Saprolegnia）
菌丝体由一个细胞发育而来，无隔壁、多核，呈白色多分枝的绒毛状。由短的根状菌丝（钻入宿主组织，吸取寄主养料）和众多细长、分枝繁茂的菌丝组成。无性生殖时，菌丝的顶端稍膨大，在膨大部分的基部产生横隔壁，形成一个长筒形的流动孢子囊，其中产生球形的游动孢子，顶生两条鞭毛，为初生孢子。流动不久，鞭毛收缩，变为球形的静孢子。之后在新寄主上萌发，再发育为新菌丝。这种具有两种游动孢子的现象称为双游现象（diplanetism）
在营养不良的时候，水霉进入有性生殖，菌丝顶端分别膨胀为精囊和卵囊，在精囊和卵囊内分别产生精子和卵，精卵结合产生厚壁的合子或者卵孢子；卵孢子休眠后经减数分裂和有丝分裂，发育为新的无隔丝菌体。
接合菌亚门（Zygomycotina）
营养体由无隔、多核菌丝所组成，无性生殖产生不动孢囊孢子，有性生殖产生接合孢子。接合菌是由鞭毛菌类向无鞭毛菌类演变的类群，也是从水生到陆生过渡的类群。
代表：根霉属（Rhizopus）
本属为腐生，常见的是黑根霉，又名面包酶。菌丝体由分支、不具横隔壁的菌丝组成，含多个细胞核。菌丝时常横生，向下有假根；向上可生出孢子囊梗，其先端分隔形成孢子囊，其中生有许多孢子（内生孢子）。孢子成熟后呈黑色，当散落在适宜的机制上时，就萌发为新菌丝。
黑根霉的有性生殖为接合生殖。在异性菌丝接触处产生短枝，两短枝的顶端膨大，产生横壁，使短丝与菌丝隔开，顶端形成配子囊（gametangium），横壁下部是配子囊柄。两个配子囊成熟后，它们之间接触的壁溶解，使得原生质体融合为合子，之后其外壁加厚，合子休眠，经过减数分裂，开始萌发，长出菌丝，顶端形成一个孢子囊，孢子囊内产生孢子，由孢子再发育为新的个体。
根霉和毛霉都是属于这个亚门，在酿酒业和羊毛软化脱脂中都会使用。
子囊菌亚门（Ascomycotina）
本门真菌除酵母菌为单细胞外其余为多细胞有机体，菌丝有隔，无性繁殖时，单细胞的种类出芽繁殖，多细胞的种类产生分生孢子，有性生殖时产生子囊，子囊两性结合后的核经减数分裂，一般形成8个子囊孢子。
本亚门子实体称为子囊果（ascocarp），其周围包被着由交织的菌丝构成的子囊果的壁，子囊果内排列着子囊层（子实层hymenium）和与之相连的侧丝（paraphysis），子囊果有3类：闭囊果（子囊果为球形，无孔口，完全闭合。子囊壳：子囊果为球形，顶端有孔口，这种子囊果常埋于子座（stroma）中。子囊盘：为杯碟状，子实层常露在外。
代表属种：酵母菌属（Saccharomyces），为本亚门较为原始的种类，植物体为单细胞，卵形，有大液泡，核很小。主要繁殖方式为出芽繁殖，母细胞的一端产生一个小芽——芽生孢子。之后脱离母体称为新的酵母菌。于是芽生孢子可以相连成为假菌丝。有性生殖时合子不转变为子囊，以芽植法生二倍体的细胞，由二倍体的细胞转变为子囊，减数分裂后形成4个子囊孢子。酵母能无氧发酵，将糖类分解为二氧化碳和乙醇。
青霉属（Penicillium）本属真菌最为普遍，常滋生于水果、蔬菜以及潮湿的有机质上。主要以分生孢子繁殖，从菌丝上产生很多分生孢子梗，梗的前端先分枝数次，最后的分枝为小梗。生小梗的枝称为梗基。小梗上有一串分生孢子，青绿色。有性生殖仅在少数种中发现，形成闭囊壳。黄青霉和点青霉均可分泌青霉素。
麦角菌属（Claviceps）子囊壳为瓶状，主要寄生在麦类的子房中，形成黑色坚硬的菌核，形状像较。麦角制剂可以用来做止血剂。
担子菌亚门（Basidiomycotina）
担子菌都是多细胞有隔菌丝体，有初生菌丝和次生菌丝之分。由担孢子萌发成的单核、有隔而且多分枝的菌丝为初生，由部分初生菌丝经有性结合后的双核细胞分裂而来的双核菌丝称为次生菌丝，由次生菌丝发育为子实体（又称为担子果）担子菌的营养繁殖产生节孢子、厚壁孢子或芽孢，无性繁殖可以产生分生孢子、粉孢子，有性生殖产生担子，担子经过减数分裂形成担孢子，担孢子萌发后形成新的单核菌丝。
代表属种：锈菌目（Uredinales）：主要寄生在种子植物和蕨类植物上，初生菌丝可以形成性孢子，次生菌丝产生秋孢、夏孢子、冬孢子。冬孢子萌发时减数分裂产生担孢子。各种孢子有一定的产生顺序。禾病锈菌有两个寄主，一为禾本科植物，二为小檗属或十大功劳属。
伞菌目（Agaricales）：子实体肉质，少革质、木栓质或膜质。均有菌盖和菌柄。菌柄大多中间生。菌盖腹面有放射状的菌褶gill，子实层位于菌褶的两面，担子果幼嫩时有内菌幕partial veil遮盖着菌褶。成熟后内菌幕破裂，菌柄上残留的部分形成菌环annulus，有些种类有外菌幕包围子实体，菌柄延长时外菌幕破裂后在菌柄基部的残留为菌托volva。著名的有蘑菇属。
多孔菌目（Polyporales）子实体无菌褶，形状多种多样。担子单细胞，无分隔，担孢子四个。如灵芝
半知菌亚门（Deuteromycotina）
本亚门的菌类多为有隔菌丝体。生活史上还只知道其无性繁殖不知其有性繁殖。半知菌亚门大多数为子囊菌亚门的无性阶段，少数为担子菌亚门的无性阶段。棉花炭疽病
而对于另一种植物地衣lichenes，是真菌和藻类的共生植物。共生的真菌绝大多数为子囊菌，少数属于担子菌，个别为藻状菌。共生的藻为蓝藻和绿藻。一般情况下，菌占地衣的绝大部分，藻则在复合体的内部，呈一层或基干状。藻类为整个植物体制造养分，而菌类则吸收水分和无机盐，为藻类制造养分提供原料，并包围和保护藻类细胞。可以分为壳状地衣、叶状地衣、枝状地衣（如石蕊），根据藻体分布也可以分为同层地衣（上下均由紧密交织的菌丝构成，下皮层深入基质之中，具有吸收和固着作用，中部菌丝稀疏，藻细胞分布其中）和异层地衣（藻细胞位于皮层，可以形成绿色藻层。其繁殖方式为营养繁殖（自行断裂或者地衣植物表面形成粉芽和珊瑚芽，粉芽是几根菌丝缠绕着藻细胞而成的团块。珊瑚芽是地衣植物上皮层局部突起形成的结构，也是菌丝包围着藻细胞而成。有性生殖，是以共生的真菌独立进行的，产生子囊孢子或者担孢子。在一定条件下萌发，在适宜的基物上，并遇到一定的藻细胞，才能与藻细胞共同形成地衣。
参考：
https://en.wikipedia.org/wiki/Bacteria
https://en.wikipedia.org/wiki/Fungus
https://en.wikipedia.org/wiki/Mastigomycotina
https://en.wikipedia.org/wiki/Rhizopus
https://en.wikipedia.org/wiki/Agaricales
https://en.wikipedia.org/wiki/Basidiomycota
https://en.wikipedia.org/wiki/Lichen