Python处理fa文件的1/N种尝试

Part1 ：计算fasta的序列的长度
建立一个测试文件

>chr1
ATCTTCCCGGGGGGGGGAA

#!/user/bin/python

with open ("test1.fa") as fasta:
    next(fasta)
    length =0
    for line in fasta:
        #print(line)
        line = line.rstrip()
        length = length +len(line) 
        print(length)

注意点：
line.rstrip() 去掉换行吧符，因为不去掉换行符，在文本文件里，换行符/n，new line 会占据字符长度。