Day 10 多任务并行投递

多任务并行投递：

第一步

vim  trim_galore.sh 
cat $1 |while read id
do
        arr=(${id})
        fq1=${arr[0]}
        fq2=${arr[1]}
#        echo $fq1 $fq2
 echo "trim_galore --phred33 -q 25 -e 0.1 --length 36 --stringency 3 --paired  -o ./ $fq1 $fq2"
done

第二步

bash  trim_galore.sh config >tmp   ###############config 为病人的ID号

image.png

image.png

第三步

split -l 2 tmp  #######默认生成xaa，xab
ll -trh

image.png

第四步 分别bash xaa xab就可以

nohup bash xaa &
nohup bash xab &