初步使用Rstudio绘制Heatmap

初步用R做聚类分析热图（heatmap）

原始数据如下图：

导出到 txt,会得到一个以制表符\t 分割每一行的文本文档；

下载安装好R环境，安装好Rstudio；

打开Rstudio，在console处依次输入命令：

rt<-read.table("F://nano2.txt",header=T,sep="\t")

（对应修改为文件实际地址）

nano <- c("#00FF00",rep("#0000FF",4),rep("#CC00FFFF",5),rep("#00FFFF",2))

（对应自己有不同种基因，用多少张颜色，rep为重复的一个指令）

heatmap(as.matrix(rt[,2:ncol(rt)]),labRow = rt[,1],cexRow = 0.7,cexCol = 0.9,ColSideColors = nano)

（设置矩阵绘制热图，分别设置注释标签等的大小数值调整即可）

按回车执行命令；即可得到热图；

按Export即可导出热图。