元码卫星会
免疫治疗
390gene TMB 300x FoundationDX
CTC 单细胞IHC
16S跟免疫疗法预后
免疫组库 TCR PCR，与somatic mut数量相关
MSI 一管血 0.1%LOD amplicon加NGS？
诺禾卫星会
赵征 陕西省肿瘤
NSCLC BRAF V600E 双TKI同时用药(前后通路一起上) FDA批准，也有一个新药
日本96例GGN 60%以上EGFR阳性
ctdna 非腺癌 脉管侵犯 Ki67 肿瘤大小1cm0.1% 10cm10%
早期肺癌 ctDNA EGFR IGF1R TP53最多
肺癌TKI响应率 709x，19ins RR都超过50%
肿瘤负荷与分期，预后
组织FFPE T790M 阳性50%左右，ctdna 50%到70%，异质性
组织T790M AF 与9291，法国人，丰度低疗效更好！
ctdna跟9291 T790M跟退缩率并不能直接反应，ddpcr灵敏度有很大的意义，跟用药节点可能有意义
脑脊液 脑转移？病炤异质性，NGS跟ddpcr要互相补充
马杰教授 河南省肿瘤病理
674例肺腺癌FFPE，NGS 20%双基因突变
磷癌 TP53高，免疫治疗重要marker
血液T790M，ddpcr 与组织比SN45%，但是原因有血检阳性二次组织活检低(二次活检率只有个位数n%，普通活检率20%)，原因病人不愿意活检
耐药是精准医疗的重中之重，但是组织qpcr，血浆ctdna ddpcr，NGS的一致率，分析前错误50%(保证材料有效组织跟ctdna是qc好的，片段化，ctdna温度时间要避免白细胞破裂gdna稀释ctdna，避免交联，ffpe要用中性，cfdna投入量非常重要太多太低都不行)，分析错误<20%，报告错误<20%
辛婧 诺禾
NCCN 8个基因
oncomine 23个基因，覆盖FDA所有获批药物
NCI match 24个bsk trials，2000个患者
诺禾也报证NX500
3D pcr 封闭芯片不被污染
ddpcr T790M阴性，建议NGS血检
诺禾解决方案：样本量少，外送样本；区域大型中心共建平台。样本QC还是在医院本地。2017年9月阳性率与文献一致
公建实验室：提供proton加3dpcr(7联间)，或nx500加3dpcr(8联间)，建设要求组织与血浆要分开房间，如果合区所有血液样本准备与试剂配置检测要在专用生物安全柜中完成
产品注册报告：美国510k如果没有先例可以走PMA，CFDA在改进。时间点“不会太久的时间期待”
要建立NGS与用药响应一致，不能仅从检测本身来建立，要与病理学上结果一致，举例fish与cnv，用细胞系制造cnv 阳性spike in sample。用120例乳腺癌阴性样本做划线(2.1 NGS copy阴性划线)，190例乳腺癌cnv fish阳性样本划NGS copy阳性线
原来研究，原发T790M 4%，现在临床发现其实高很多。
一天三个节点，EGFR敏感突变AF波动不一致，中位5%；T790M中位数1%以下，40%都是1%以下，21%在0.2%以下；诺禾自己一个小数据，有3/40是ffpe af很好，ctdna非常低；尿液ctdna，跟qiagen合作。
QA
周彩存 上海市肺科医院 & 林冬梅 北京大学肿瘤医院
FFPE白片的固定的SOP不一样，固定液，固定时间，固定时限都没有。没有严格QC的第三方公司。
磷癌ctdna阳性率比腺癌高很多？why？磷癌的突变可能更多passager mut
TMB全球都没有一个cutoff，各家panel不一样，QC也不一样，可能是一个很艰难的一个过程，一共有200多家NGS公司，没有拿出cutoff值没有可能弯道超车，还是最重要是临床数据，医生首要选择是数据
诺禾试剂注册冲疗效走！
睿昂
主题ddpcr在实体瘤中应用
马杰 肺癌 河南省肿瘤医院
3dpcr 1536个孔，但是发的伯乐的图？？？
qiagen arms sn 25%，ddpcr sn 50%
2017年 45例ctdna，阳性50%，19del af>1% 50%，af<1% 21%
经典ddpcr与super ddpcr对比，与活检arms对比，一致性38%升到56%，更多数据对比sn50%vs89%，sp71%vs43%，一致性57%vs71%
QA
ddpcr cutoff 临床有效：1%治疗非常吻合；0.1%甚至0.0几%对耐药有很大帮助而且提示影像进展；临床其实用药还是以影像金标准，分子目前只是用于提醒辅助影像
样本一般用10ml全血，实际一般是5ml跟8ml
目前最低10ng检测一个位点
经典突变LOD满意是5%，报告0.1%以上，0.1%以下不报。1%以上要用arms有证的盒子验证，特别是微滴数不够的样本！看来是伯乐的？
庄武 福建省肿瘤医院
液态活检不仅T790M，也不止ctdna，也不止血液
T790M阳性病人不用做组织活检，阴性尽量做
BRAF V600E 达拉菲尼+西美菲尼联合用药，30%vs60%，FDA批准
met exon14 skipping mut 靶药OS提高8倍，3月vs21月
NGS对异质性很有意义，但成本高周期长，ddpcr周期短，NGS有很大降价空间(临床上对cost的需求估计是2k级别)
ddpcr ctdna cnv 5copy amp以上才报
动态监控平均每患者4次以上检测点。？
迈基诺 215
丁培荣 中山大学附属肿瘤医院 crc主任
遗传性结直肠癌的系统性分子筛查
JCO 文章 1000例盲筛 germline screen，10%阳性，一半是高外显风险
息肉病，Armstrong标准找不到相关基因。NGS 大panel可以找到一些相关基因
NCCN lynch与息肉病，几个标准
息肉病曾经用100个息肉诊断为FAP，但是实际临床很可能不会这么典型，要结合病理形态。家族史，息肉，既往病史(口腔，眼等等)
分子检测筛查？OSU 500例Lynch，MSI检测，排除APC启动子甲基化，阳性，再做germline screen，18例确诊，只有44%小于50岁，Armstrong标准可能漏掉一半
本地尝试，MSI，启动子，14基因NGS，基因型与遗传规律(家族史有特殊肿瘤，提示个人出现某肿瘤概率大)来作为管理。MLH1/MSH2表型更严重(例如腹腔肿块)，要更加关注。
阳性突变者，<20岁风险很低，成年后再做
经典FAP手术时机，例如APC远端突变(硬纤维瘤高危，这是FAP手术死亡高风险因素)，推迟手术。FAP患者
APC突变位置，表型不一样，严重程度也不一样，例如APC中部阳性突变，结肠常有密密麻麻的息肉
Lynch风险，多切10cm会有更好的预后。未知基因型，切除后筛查肠镜还是有更好的预后。
基因型指导手术目前不成熟。对家属风险管理非常有用。
伍建 迈基诺
Gencap基因捕获技术在肿瘤转化研究中的应用
LOD 1%，fusion, CNV
278基因，driver mut 20%个体有超过10个mut，界线在哪？免疫治疗数据不多
燃石 B4
胡志皇 复旦大学附属肿瘤医院(常建华)
有时能预测、常常去检测、总是要透彻--1 例晚期肺腺癌全程管理病例及思考
67岁女性，无吸烟史，肺腺癌
15年右肺多结节，CT全身转移，病理穿刺腺癌
cT1N2M1c
PS=1
原发炤小，无法组织基因检测
一线AP+，SD无PR
维持A，PD
ctdna ngs driver mut阴性
PD-L1低表达
胸水arms egfr确定阴性，入组一个trial，用PD1
二线PD1，最佳疗效SD+，但是还是全面进展
指南三线，用化疗单药
16年入组燃石
ctdna ngs 19del阳性，AF 19%
cfdna定量qc ok
讨论1
是什么原因，免疫治疗对驱动基因有影响？
a克隆选择？
b肿瘤进展，ctdna释放？
c肿瘤负荷致ctdna增加？
胸水没有形态学验证？ 做了，排除
组织没有NGS，是最大问题，ctdna ngs假阴性？无法排除
ctdna本身不稳，无法排除
结论：全程监控的重要性
继续进展
16年9月TKI特罗凯PR，19del af下降
5月后反弹，19del af又上升，出现T790M af 0.13%
使用9291，疗效不好，
讨论2
19del阳性疗效影响因素有哪些？
伴随其他driver mut的PFS更短
该患者还有一个EGFR cn2.7
讨论3
T790M阳性患者使用9291的疗效影响因素？
多基因多克隆因素大，耐药点负荷太低很有可能预后不好。但是血检不是标准跟组织不能相关。有报道血检790的af<0.5%疗效不佳。
但看一个790，不能反映影像学总体变化
在肿瘤快速进展期，driver mut突变af进展斜率跟肿瘤进展一致。
张国伟 河南省肿瘤医院
双管齐下，还是各表一枝？--1 例双驱动基因晚期肺腺癌的治疗思考
63岁 男性 无吸烟史，右肺肿块，左肺也有肿块，考虑转移
右肺低分化腺癌
一线化疗PR
维持化疗
组织NGS L858R AF 45%，MET cn 4.7
MET CNV 获得性耐药占20%。denovo 出现MET cnv 3%左右。
CNV的原因：多倍体(非肿瘤驱动基因)，真拷贝(月chr7 基线对比)
MET 扩增定义为GCN>5 吴一龙教授研究
疑问
MET的界限
MET扩增与EGFR敏感点同时存在，TKI效果？
MET抑制剂(例如BPI097？)的效果？
cobas研究，分子完全缓解，OS更长
燃石数据原发双驱动突变：
早期可手术肺腺癌患者EGFR sens mut合并MET CNV 1/257=0.39%
早期可手术肺腺癌患者EGFR sens mut合并其他可用药driver mut 0/257=0%
晚期血检肺腺癌初治患者EGFR sens mut合并MET CNV 5/181=2.76%
晚期血检肺腺癌初治患者EGFR sens mut合并其他可用药driver mut 2/181=1.01%
讨论：
对双驱动基因是否重视不足？NGS是否应该一线？
双靶点，如何用药？
如何看待分子层面完全缓解意义(单个基因清零与所有基因清零的临床意义)？以及ctdna的清零的临床意义？
梁乃新 北京协和医院
山穷水复疑无路，柳暗花明又一村--1 例 IV 期肺癌十线治疗的真实世界引发的思考
起始：男性 56岁，重度吸烟 肺原发炤3cm 穿刺病理肺腺癌 PET提示脊柱及多发骨转移
目前：带病生存57个月，正在接受11线联合伊立替康序贯BRIGATINIB+AVASTIN联合治疗
大时代背景：sanger到NGS；穿刺到液态活检；精准医学概念从无到有；生物信息解读与临床决策从简单到复杂。
重点数字：历经11线治疗，使用8种药物，4次联合用药，57个月仍然带瘤生存。
总结
精准医学理念管理患者
全程化管理患者
数字化管理患者
全球化管理患者
实时化管理患者
MDT应该加入
检测机构的生信部门/AI
思考
理念：精准-经验医学互补
眼界：精准-转化医学两端有多近
趋势：精准医学打破医师专业界限
逻辑：检测结果解读-临床决策
动态：检测技术-频度-节点的选择
数字化：精确管理病情全程的钥匙
QA
MDT讨论
宋勇(主席，第二军医大，南京军区总院，呼吸与危重症医学科) 胡兴胜 林冬梅 马智勇 乔贵宾 吴世凯 杨衿记 张绪超 张沂平
慧渡 C4
主持 李惠萍 北京大学肿瘤医院乳腺肿瘤内科主任
愿景 CR PR SD ORR总共大于50%
沈志荣 百济神舟 BeiGene
题目：PARP研发进展(BGB290)
“做中国人用得起的全球领先的抗癌新药”，目前国内16个trial
BTK抑制剂
PD-1
PARP抑制剂
RAF二聚体
BGB290 CTR20160828 trial II
闻丹忆 上海立迪生物技术有限公司
PDX 生物样本活库
mini-PDX，把原代细胞放到纳米膜袋(500kd，药物分子可以自由进出，类器官培养)中进老鼠
只需要很少的穿刺细胞，QC后，细胞少预扩增，在细胞量足够下成功率100%
co-clinical trial与mini-PDX，转化伴随诊断
立闻-promega联合实验室，医检所
吉西他滨 国内唯一批的胰腺癌用药？
贾士东慧渡（上海）医疗科技有限公司
液态活检在肿瘤免疫治疗和临床药物开发中的应用
p110b 首次发现，nature，trial II
参与CDK4/6(诺华)，AKT(genotech)
第一个 ctdna与ctrna液态活检(gene RADAR)
0.1% LOD