11月7日 本地blast (二)

参考
http://blog.csdn.net/flyfrommath/article/details/52945586
http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/

安装blast软件到服务器上

1.下载打包好的文件ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

11月7日 本地blast (二)_第1张图片
选择一个你需要的

2.上传到服务器上
使用scp命令


上传中

3.解压软件

tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz

蓝色这个文件是解压好的

4.设置路径,使得哪里都可以使用
我的服务器上是在自己目录下面

cd
ls -all
vim .bash_profile

增加一行

export PATH=$PATH:/public/home/you/path/to/ncbi-blast-2.7.1+/bin

使其生效

source .bash_profile

OK,检查一下

blastn -version

出现这个说明装好了

OK ,软件装好了,明天配置本地库

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