mORCA: sailing bioinformatics world with mobile devices

我们之前一提到生物信息学,首先映入脑海的大概就是各种计算机、服务器等等。生物信息学处理的数据主要是生物医学数据,这些数据都非常大,例如全基因组测序原始数据大概有几十G,这种大小的数据必须要放到服务器中处理。当然,部分生信的分析可以在个人电脑上完成,比如说RNA-Seq的后续分析,比如富集分析等等。我相信应该没有人会将生信与手机联系起来。

But

2017年『Bioinformatics』杂志刊出了一篇文章『mORCA: sailing bioinformatics world with mobile devices』,题目就直接点出了『将生信带入手机世界』。


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我一看到这篇文章,整个人都惊了。 赶紧看一下文章,文章中提到,这个课题组开发了一个手机软件mORCA,能进行一些序列分析,例如序列搜索、序列下载、序列比对等等任务。

软件思路

以Blast为例,runEBIBlast中有多个参数,可以自己设置,序列可以通过这个软件到NCBI等数据库下载,也可以手机本地上传。等一切设置好后,将序列和参数提交到EBI中的Blast软件,EBI比对好后,再将结果处理返回。


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软件版本

这个手机软件有ios版和Android版,ios版直接通过App Store下载,Android版则需要到google play store下载。国内下载google play store下载很麻烦,部分手机需要先安装google play store再下载。
该软件也有一个类似与web qq的版本『http://bitlab-es.com/morca/app』,大家可以点击看看

感想

首先,我要说的是,这个软件的功能有点鸡肋。这些Blast、多序列比对、序列搜索等等功能都可以直接在个人电脑上完成,根本不存在什么配置问题。这个软件的可能用途就是在远离电脑的时候,可以应急处理一些简单的任务。
我觉得,这个软件是生信一个有趣的发展方向,当然这个方向并不主流。


如果有喜欢折腾的朋友,可以尝试从App store或者Google Play Store下载,也可以登录『http://bitlab-es.com/morca/app』看看。

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