医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程

前期准备

下载3DSlicer并安装:

3DSlicer官网(http://www.slicer.org)或者直接下载(https://download.slicer.org),需要注意目前该插件只支持最新的3DSlicer Preview版本(4.11.x)

官网下载速度慢,直接百度网盘:

链接:https://pan.baidu.com/s/1WqaIQEWaMXgHVp4QkxwlFQ
提取码:cms1

 

安装插件(扩展工具)

如图:医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第1张图片

 

 

 点击【Install Slicer Extensions】按钮进入安装插件页

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第2张图片

 

 在右上角搜索我们需要的插件,然后安装,安装完成点击【Restart】按钮重启3DSlicer,插件安装完毕

图像切割

如图:按步骤导入我们要处理的医学图像(此处我们以分割单个nii格式图像为例)

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第3张图片

 

 点击【Segment Editor】按钮,进入图像分割页

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第4张图片

 

 然后找到【Effects】栏,选择【Nvidia AIAA】,如图:然后在【Auto-segmentation】栏的Model栏选择【segmentation_ct_liver_and_tumor】,在点击【start】按钮开始自动切割

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第5张图片

 

 切割结果如图:

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程_第6张图片

 

 需要注意:在【Nvidia AIAA Server】栏,默认使用3DSlicer远程服务器,有时候会连接不上,你可以设置自己的服务器,参见我其他教程。

3Dslicer中文网站:https://www.slicercn.com/?p=7633

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