如何配置R Markdown以及在R Markdown中配置python

       R Markdown是R语言中的一个包，其作用是基于markdown语法生成高质量的文档，虽然其是R语言的一个包，但是R markdown支持多种编程语言，可以通过对R markdown的配置实现对不同语言的支持。

      本文的介绍是基于RStudio的，读者最好在RStudio中直接安装r markdown，不然还需要安装pandoc，而RStudio中已经包含了pandoc，pandoc的作用是将各种不同的标记语言转成最终的文档，因此这里就是将md文件（markdown文件）转成最终的文档。直接执行install.packages("rmarkdown")即可，其中会先安装rmarkdown的依赖包，等待安装完成即可。

       要注意的是，如果要生成PDF文件，则要么已经安装了latex，要么就需要安装tinytext这个包，如下所示进行安装，这两条命令执行比较久，需要大概几分钟左右。如果没有这个包也没有安装latex，则生成PDF文件时会报错。

       接下来是中文的问题，目前建议是用英文编写，不要用中文，如果是用默认的pdflatex引擎的话，则如果文档中有中文就会报错，这时可以换成xelatex或者lualatex，虽然这样可以成功生成PDF文件，但是并不会显示中文，所以这里的办法仅仅是针对把中文作为用户自己的注释，而不是重要的内容这样的情况；对于确实要显示中文的需求，读者可以自己在网上查相关的解决办法。

       经过上面的设置，你已经可以在RStudio中用R Markdown生成PDF文件了，但是如果要基于python代码生成文件，还有必要的一步就是安装reticulate包，该包的作用是实现在R中使用python接口，代码的编译刚开始是基于这个包实现的，在生成文件的时候，需要用到这个包来转换，因此还需要执行install.packages("reticulate")语句。       

       目前，所有的外部准备工作已经做完。下面是内部设置，新建一个rmd文件，可通过如下的语句在该rmd文件中把编程语言设置为python。其中engin.path表示的是你python解释器的路径，如果没有显式设置的话，则就会默认在你系统的PATH路径下寻找python解释器，而后你的python代码将会以该路径下的版本为准进行编译执行；要注意的是，如果进行显式设置的时候报错，可能是因为R Markdown的安装路径和目标解释器路径不在同一个盘，这时直接跨盘执行cmd命令不成功。其下面的import语句和print语句只是为了显式你设置后的python版本而已。

       经过以上的安装和配置，你已经可以在RStudio的rmd文件中基于python代码编写文档了，注意文档的编写分为几块，标题部分、代码部分和文本部分，代码部分以'''开头和结尾进行标记，文本部分遵循markdown语法。其中具体的细节可看相关文档，下面的各个相关文档的地址：

1、R Markdown介绍和文档地址：https://rmarkdown.rstudio.com/lesson-1.html    https://bookdown.org/yihui/rmarkdown/

2、R Markdown语法地址：https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/03/rmarkdown-reference.pdf

3、R Markdown cheatingsheet:https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2016/03/rmarkdown-cheatsheet-2.0.pdf

4、在R中使用Python包：https://rstudio.github.io/reticulate/

5、在Python中使用R包：https://rpy2.bitbucket.io/