生信菜鸟团——专题学习目录

之前有简单整理生信菜鸟团最近发布的测序平台、质量控制等文章链接，今天生信菜鸟团的小编也已经把最近发布的推文整理成目录了，这里我记录一下，方便有需要的朋友检索和学习。如果以后再推出相关专题目录，我也在这里更新吧。大家有急切学习需求的可以关注公众号。

数据库专题

一文看懂NCBI的refseq

浅谈Entrez ID

带你认识GEO数据库

NCBI数据库专题之Taxonomy

基础数据库之dbSNP

pubmed

OMIM数据库

Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同

基础概念专题

浅谈RPKM,FPKM,RPM,TPM的区别

二代测序的barcode/index

De Novo sequencing vs resequencing

浅谈FastQ和FastA格式

NGS基础概念-depth and coverage

名词package

paired-end Reads

中心法则专题

中心法则-DNA

中心法则-RNA

中心法则-蛋白质

DNA复制

NGS与转录

中心法则之翻译

逆转录

测序平台专题

1.Sanger测序

2.illumina测序

3.罗氏454测序

4.SOLiD测序

5.Ion Torrent测序

6.pacbio测序

7.纳米孔测序

数据格式专题

1.FastQ和FastA格式

2.SAM格式

3.gff/gtf格式

4.Bigwig/Wiggle格式

5.bed格式

6.vcf格式

7.Blast&Blat

测序数据质量控制专题

1.测序数据质量控制之FastQC

2.测序数据质量控制之cutadapt

3.测序数据质量控制之sickle

4.测序数据质量控制之Trimmomatic

5.测序数据质量控制之fastx Toolkit

6.测序数据质量控制之RSeQC

7.测序数据质量控制之CHIPQC

组学专题

转录组学

表观基因组学

蛋白质组学

微生物组学

变异形式专题

参考基因组

基因结构

SNP多态性

SNV

CNV