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Ubuntu16.04 借助 Docker 安装 Caffe

Ubuntu16.04 借助 Docker 安装 Caffe

1 Reply

最近在 Ubuntu 上安装 Caffe 总是有各种各样的问题，尽管因为系统版本的问题没有安装 CUDA ，少了不少麻烦，但在 make 的时候总是缺这个.o文件或者少那个.h文件。Docker 常用命令请查看参考部分的第一个。

本文目录

  1. 0. 安装 Docker
  2. 1. 获取 Caffe 的 Docker 镜像
    1. 1.1 通过 Dockerfile 来创建 Docker 镜像
    2. 1.2 搜索并下载 Caffe 的 Docker 镜像
  3. 2. 查看当前运行的容器
  4. 3. 由 Docker 镜像创建并运行一个容器
  5. 4. 进入容器内
  6. 5. 退出并停止容器
  7. 6. 进入 Caffe 容器尝试使用 Python
  8. 7. 启动和其它问题
    1. 7.1 Ubuntu14.04启动失败
    2. 7.2 无法从仓库下载到镜像
    3. 7.3 容器内无法访问外网
  9. 参考
  10. 更多参考
 

0. 安装 Docker

在 Ubuntu 上安装 Docker 的命令十分简单：

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sudo apt - get install docker .io

1. 获取 Caffe 的 Docker 镜像

恰巧有群友说到 Docker，以前看过，现在还依稀记得。现在提供两种方法来获取 Docker 镜像，大家二选一（1.1 或者 1.2）即可。考虑到有的同学没有 git 下 caffe 的源码，我们这里推荐第二种方法（跳过1.1，开始1.2 搜索并下载 Caffe 的 Docker 镜像）。

1.1 通过 Dockerfile 来创建 Docker 镜像

发现 Caffe 从 Github 上下载下来的压缩包中，根目录就有一个名为 Docker 的文件夹，可以进去后选择 CPU 文件夹或者 GPU 文件夹，根据Dockerfile来 build 不同版本的 Docker Caffe 镜像。使用如下命令来 build 镜像：

镜像保存的地方我也不知道在哪儿，查书也没查到，不过到找到了 Docker 安装的部分文件在用户根目录的某个文件夹里面。反正镜像在我们的镜像仓库里（后文会说到）。

1.2 搜索并下载 Caffe 的 Docker 镜像

使用如下命令，可以在 Docker Hub 上搜索所有用户上传的镜像，一般来说选择点星星（Star）最多的镜像。输入命令（docker search caffe）后，显示如下：

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root @ spark : / home / yuens # docker search caffe
NAME                               DESCRIPTION                                     STARS     OFFICIAL   AUTOMATED
tleyden5iwx / caffe - cpu - master                                                        42                    [ OK ]
tleyden5iwx / caffe - gpu - master                                                        27                    [ OK ]
kaixhin / caffe                       Ubuntu Core 14.04 + Caffe .                        14                    [ OK ]
kaixhin / cuda - caffe                 Ubuntu Core 14.04 + CUDA + Caffe .                14                    [ OK ]
nvidia / caffe                       Caffe images from github .com / NVIDIA / nvidia . . .    4                     
neowaylabs / caffe - cpu               Caffe CPU based on :    https : / / hub .docker .co . . .    2                      [ OK ]
mbartoli / caffe                     Caffe , CPU - only                                  1                      [ OK ]
ruimashita / caffe - gpu - with - models   ubuntu 14.04 cuda 7.0 caffe   bvlc_referenc . . .    0                      [ OK ]
tingtinglu / caffe                   caffe                                            0                      [ OK ]
kavolorn / caffe                     Caffe image based on OpenCV image .                0                      [ OK ]
suyongsun / caffe - gpu                 Caffe image with gpu mode .                        0                      [ OK ]
chakkritte / docker - caffe             Docker caffe                                      0                      [ OK ]
ruimashita / caffe - gpu               ubuntu 14.04 cuda 7 ( NVIDIA driver version . . .    0                      [ OK ]
kaixhin / caffe - deps                  ` kaixhin / caffe ` dependencies .                    0                      [ OK ]
ruimashita / caffe - cpu - with - models   ubuntu 14.04 caffe   bvlc_reference_caffene . . .    0                      [ OK ]
kaixhin / cuda - caffe - deps              ` kaixhin / cuda - caffe ` dependencies .                0                      [ OK ]
haoyangz / caffe - cnn                 caffe - cnn                                        0                      [ OK ]
ruimashita / caffe - cpu               ubuntu 14.04 caffe                                0                      [ OK ]
alfakini / caffe - cpu                 Docker container with Ubuntu Core 14.04 , C . . .    0                      [ OK ]
ypandit / caffe                       BLVC Caffe with PyCaffe                          0                      [ OK ]
mtngld / caffe - gpu                   Ubuntu + caffe ( gpu ready )                        0                      [ OK ]
suyongsun / caffe - cpu                 Caffe image with cpu mode only .                  0                      [ OK ]
nitnelave / caffe                     Master branch of BVLC / caffe , on CentOS7 wi . . .    0                      [ OK ]
elezar / caffe                       Caffe Docker Images                              0                      [ OK ]
patdiscvrd / caffe                                                                    0                      [ OK ]

我们选择星星最多的镜像并下载，命令如下：

我们这里选择 cpu 版本。下载完成后镜像就会在我们的镜像仓库里，可以通过命令（docker images）来查看，显示如下：

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root @ spark : / home / yuens # docker images
REPOSITORY             TAG                 IMAGE ID              CREATED             SIZE
build_repo / caffe - cpu   latest               e740a499ed4b          46 hours ago          1.307 GB
docker - caffe - cpu       latest               e740a499ed4b          46 hours ago          1.307 GB
ubuntu                  14.04                90d5884b1ee0          11 days ago          188 MB

2. 查看当前运行的容器

首先，我们先来使用命令（docker ps）看看当前有哪些容器正在运行：

可以看到，当前没有正在运行的容器，这个命令还可以带一个参数 -a （代表全部，docker ps -a），查看所有的容器状态，可以看到有的容器我们退出了的时间，创建了的时间等等信息：

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root @ spark : / home / yuens # docker ps -a
CONTAINER ID          IMAGE                   COMMAND              CREATED             STATUS                         PORTS               NAMES
a27e67f5757a         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          36 minutes ago       Exited ( 137 ) 29 minutes ago                         happy _roentgen
0665dbc54249          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          36 minutes ago       Exited ( 0 ) 36 minutes ago                           lonely _yalow
8d3f3fed703c          e74                      "/bin/bash"          37 minutes ago       Exited ( 0 ) 37 minutes ago                           sad _wescoff
49363061600e          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          37 minutes ago       Exited ( 0 ) 37 minutes ago                           high_lamarr
b1e3c1784a49         docker - caffe - cpu        "-itb"                38 minutes ago       Created                                             jovial_dubinsky
e46fc2828e48         docker - caffe - cpu        "-ibt"                38 minutes ago       Created                                             reverent_dubinsky
bbf7ff03611f         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          39 minutes ago       Exited ( 0 ) 39 minutes ago                           happy _chandrasekhar
15aa31c5ad8f          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          About an hour ago   Exited ( 130 ) 58 minutes ago                         condescending _brattain
2fe7b65c69c7          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          About an hour ago   Exited ( 0 ) About an hour ago                       small_meninsky
a025ec63fe9f         build_repo / caffe - cpu    "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 130 ) 28 hours ago                           big_keller
f89e0ebf7f2d         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 0 ) 28 hours ago                             cranky_rosalind
fddf20df7d91         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 0 ) 28 hours ago                             stupefied_shaw

3. 由 Docker 镜像创建并运行一个容器

既然没有正在运行的容器，那么我们根据镜像来创建一个容器吧！使用命令（docker run -tdi REPOSITORY）来创建，之后再查看当前运行的容器有哪些。

创建容器并运行的命令（docker run -tdi REPOSITORY）中，REPOSITORY 名称是镜像仓库中镜像的名字，可以通过使用命令 （docker images）来查看当前本地镜像仓库有哪些镜像，并根据要创建镜像的 REPOSITORY 名来创建容器。

4. 进入容器内

在创建运行了容器后，我们进入容器。进入容器的命令（docker attach CONTAINER_ID，其中CONTAINER_ID只要开头一点可以和其他的CONTAINER_ID区分就可以），执行结果如下：

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root @ spark : / home / yuens # docker ps -a
CONTAINER ID          IMAGE                   COMMAND              CREATED             STATUS                           PORTS               NAMES
7b3bf6742deb          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          7 seconds ago       Up 6 seconds                                         silly _euclid
673de646bf70          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          21 seconds ago       Exited ( 0 ) 20 seconds ago                             furious_mclean
a27e67f5757a         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          38 minutes ago       Exited ( 137 ) 31 minutes ago                           happy _roentgen
0665dbc54249          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          38 minutes ago       Exited ( 0 ) 38 minutes ago                             lonely _yalow
8d3f3fed703c          e74                      "/bin/bash"          39 minutes ago       Exited ( 0 ) 39 minutes ago                             sad _wescoff
49363061600e          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          39 minutes ago       Exited ( 0 ) 39 minutes ago                             high_lamarr
b1e3c1784a49         docker - caffe - cpu        "-itb"                40 minutes ago       Created                                               jovial_dubinsky
e46fc2828e48         docker - caffe - cpu        "-ibt"                40 minutes ago       Created                                               reverent_dubinsky
bbf7ff03611f         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          41 minutes ago       Exited ( 0 ) 41 minutes ago                             happy _chandrasekhar
15aa31c5ad8f          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          About an hour ago   Exited ( 130 ) About an hour ago                       condescending _brattain
2fe7b65c69c7          docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          About an hour ago   Exited ( 0 ) About an hour ago                         small_meninsky
a025ec63fe9f         build_repo / caffe - cpu    "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 130 ) 28 hours ago                             big_keller
f89e0ebf7f2d         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 0 ) 28 hours ago                               cranky_rosalind
fddf20df7d91         docker - caffe - cpu        "/bin/bash"          28 hours ago         Exited ( 0 ) 28 hours ago                               stupefied_shaw
root @ spark : / home / yuens # docker attach 7b3
root @ 7b3bf6742deb : / workspace #

一般在执行进入容器前，我们都会输入查看当前正在运行的容器的命令（docker ps 或 docker ps -a），看着 CONTAINER_ID 来进入指定的容器。

有时候会出现命令行伪假死状态（进入命令输入完成后，等半天命令行不动，似乎卡死了），其实没有，你输入键盘上的回车敲击几下，发现好着呢（一般而言，当输入docker attach命令完成后，瞬间就进入了容器，输入回车键就跳出命令行伪假死状态）。

5. 退出并停止容器

进入容器后，我们进行我们需要的作业，完成后或者设置完成后我们可以退出当前的容器，在容器里使用命令exit（或者直接键盘Ctrl+D）即可退出并暂停当前容器。

退出后，当我们需要再次启动该容器，我们同样是先查看刚刚退出暂停的容器的CONTAINER_ID（可以用命令docker ps -a来查看），然后容器开始执行的命令（docker start CONTAINER_ID）。

对于正在运行中的容器，我们停止其运行，可以使用停止命令（docker stop CONTAINER_ID），结果如下：

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root @ spark : / home / yuens # docker images
REPOSITORY             TAG                 IMAGE ID              CREATED             SIZE
build_repo / caffe - cpu   latest               e740a499ed4b          47 hours ago          1.307 GB
docker - caffe - cpu       latest               e740a499ed4b          47 hours ago          1.307 GB
ubuntu                  14.04                90d5884b1ee0          11 days ago          188 MB
root @ spark : / home / yuens # docker run -idt ubuntu
Unable to find image 'ubuntu:latest' locally
root @ spark : / home / yuens # docker run -idt 90d5
9ce93c6664f3d936704949b8ded91b158492088c3727e77f5cccf9c65fc5407d
root @ spark : / home / yuens # docker ps
CONTAINER ID          IMAGE               COMMAND              CREATED             STATUS               PORTS               NAMES
9ce93c6664f3          90d5                  "/bin/bash"          9 seconds ago       Up 8 seconds                             naughty _rosalind
74f5856efa76          docker - caffe - cpu      "/bin/bash"          51 minutes ago       Up 21 minutes                           silly_davinci
root @ spark : / home / yuens # docker stop 9ce
9ce
root @ spark : / home / yuens # docker ps
CONTAINER ID          IMAGE               COMMAND              CREATED             STATUS               PORTS               NAMES
74f5856efa76          docker - caffe - cpu      "/bin/bash"          52 minutes ago       Up 22 minutes                           silly_davinci

可发现，我们在创建并运行某个容器的时候，可以用其 IMAGE ID （镜像ID）来创建。

6. 进入 Caffe 容器尝试使用 Python

下面是在Shell里操作，大致含义：

  • 首先查看现在是否有正在运行的容器，发现没有，那我们由 docker-caffe-cpu 的镜像 ID 创建一个容器，然后观察当前是否增加了一个运行中的容器，发现有的，那么我们就连接 attach 进这个容器中。
  • 进去后，我们到根目录的opt文件夹下，看到 caffe 安装文件在这里。
  • 输入 Python 进入，尝试 import caffe，第一次初始化中，第二次成功。

若发现输入 python 后，尝试 import caffe 失败，提示如下：

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[ root @ 0b98cab20445 home ] # python
Python 2.7.5 ( default , Jun 24 2015 , 00 : 41 : 19 )
[ GCC 4.8.3 20140911 ( Red Hat 4.8.3 - 9 ) ] on linux2
Type "help" , "copyright" , "credits" or "license" for more information .
>>> import caffe
Traceback ( most recent call last ) :
   File "" , line 1 , in < module >
ImportError : No module named caffe

那是因为没有编译 pycaffe ，那就切换到 root 目录的 caffe 下（cd ~/caffe 或 cd /root/caffe），然后编译 pycaffe（貌似编译有点问题，后面import caffe不行，这里先Mark一下）。

7. 启动和其它问题

7.1 Ubuntu14.04启动失败

后来我在Ubuntu14.04上安装后，运行时出现如下信息的报错：

执行如下命令后，问题解决：

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2
sudo apt - get install apparmor
service docker restart

7.2 无法从仓库下载到镜像

使用 docker pull 命令报错信息如下：

目前就是反复使用该命令，总会有一次成功的。但这不是个办法，所以可以考虑或者国内的一些仓库，比方说使用 DaoCloud 的仓库或者是阿里的。我们这里提供一个阿里的镜像（专门做DeepLearning和HPC，里面已经集成了CUDA7.0，Caffe，Thean，Torch7等）。

可以使用该命令直接把镜像 pull 下来：

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docker pull registry .aliyuncs .com / alicloudhpc / toolkit

由于阿里提供的镜像比较大，将近9个G，下载下来后，用 docker images 命令查看当前的镜像信息：

其中，是笔者尚未下载完被强制暂停的（只包含） caffe 的镜像。

7.3 容器内无法访问外网

注：本小节是2017年02月20日追加的博客内容。重新安装系统后把docker按照官方教程安装了，但是从网上docker pull下来的镜像，进入容器无法访问外网导致无法安装软件。下面给出解决方案和参考链接。

根据后文的参考，我属于的问题是默认的docker配置文件没有修改，需要改dns server就好了。

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vi / etc / default / docker

去掉“docker_OPTS=”–dns 8.8.8.8 –dns 8.8.4.4″”前的#号。

参考的这个，总结了Docker容器内不能联网的6种解决方案：http://blog.csdn.net/yangzhenping/article/details/43567155

参考

  1. Docker 4 — 总结（Docker常用命令）：https://blog.tankywoo.com/docker/2014/05/08/docker-4-summary.html
  2. linux – FATA[0000] Get http:///var/run/docker.sock/v1.17/version: dial unix /var/run/docker.sock – Stack Overflow  http://stackoverflow.com/questions/29294286/fata0000-get-http-var-run-docker-sock-v1-17-version-dial-unix-var-run-doc
  3. 阿里开发者平台（DL+HPC的docker镜像）  https://dev.aliyun.com/detail.html?spm=5176.1972343.2.20.C16rVe&repoId=2
  4. Pulling Docker images: i/o timeout – Open Source Projects / Open Source Registry API – Docker Forums （用处可能不大） https://forums.docker.com/t/pulling-docker-images-i-o-timeout/740/11
  5. （写的很详细）Docker容器内不能联网的6种解决方案 – 每一天都有新的希望 – 博客频道 – CSDN.NEThttp://blog.csdn.net/yangzhenping/article/details/43567155

更多参考

  1. Docker —— 从入门到实践：http://udn.yyuap.com/doc/docker_practice/index.html

  2. 国内首个 Docker Hub 镜像服务 DaoCloud 上线 – 开源中国社区  http://www.oschina.net/news/57894/daocloud
This entry was posted in  学习笔记·杂 and tagged  Ubuntu,  docker,  Caffe on  2016年5月16日.

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