NPB的安装和运行简介

NPB全称为NAS  Parallel  Benchmark，与linpack一样是最常用的并行计算机基准测试程序。可以从
http://www.nas.nasa.gov/Resources/Software/npb.html
下载自己需要的版本。本文以NPB2.4为例简单介绍了NPB的安装与运行要点。
1。下载NPB2.4.tar.gz，解压。
2。cp conf/make.def.template conf/make.def
3。修改conf/make.def文件：
    33行：MPIF77＝mpif77 ＃设定编译器
    35行：FLINK   = mpif77
    40行：FMPI＿LIB ＝ －L/data2/software/mpich-gcc/lib -lmpich ＃连接器会到这里找MPICH库
    45行：FMPI_INC = -I /data2/software/mpich-gcc/include ＃mpif.h在该路径下
    80行： MPICC = mpicc
    82行：CLINK   = mpicc
    87行： CMPI_LIB  = -L/data2/software/mpich-gcc/lib/ -lmpich
    93行：CMPI_INC = -I /data2/software/mpich-gcc/include   ＃mpi.h在该路径下
4。编译
以IS程序为例，在解压缩后的NPB2.4－MPI目录下执行：
 make IS CLASS=A NPROCS=16  ＃问题规模为A，处理器个数为16
即会在NPB2.4-MPI/bin/目录下生成is.A.16可执行文件。也可以将所有程序全部一次性编译出来，这里不做介绍。
5。执行
假设机器上安装了torque（没有的话直接mpiexec或mpirun），则编写如下脚本(假设脚本名为test.sh)：
#!/bin/sh

#PBS -N IS_TEST //指定任务名
#PBS -o IS_TEST.log//指定标准输出
#PBS -e IS_TEST.err//指定标准出错
#PBS -q batch //指定任务队列
#PBS -l nodes=16//指定进程数

cd /home/xx/NPB2.4/NPB2.4-MPI/bin
echo TIME is `date`
echo DIRECTORY is $PWD
echo This job runs on following nodes:
cat $PBS_NODEFILE
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
echo This job has been allocated $NPROCS nodes
mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS ./is.A.16 //执行


执行：qsub test.sh
执行：qstat，即可以看到任务状态
执行完毕后，打开 IS＿TEST.log，就可以得到结果了。