主要参考文献：
深入理解Android，卷１
Android 5.0 源码
http://blog.csdn.net/sodino/article/details/41946607
学识尚浅，错误之处请指正。
为什么需要JNI?
JNI(Java Native Interface的简称)，中文翻译为java本地调用接口，名字已经很形象的说明了这个技术的作用，就是支持java这种高级编程语言对本地函数的调用，主要包括C/C++等语言编写的函数。
那么对于Java而言，为什么设计这样一种技术去调用本地函数呢？理由是显而易见的：
- 操作系统是由C/C++实现的。
- 作为Java语言跨平台支持的Java虚拟机是由C/C++实现的,它使用C/C++屏蔽不同平台的实现，使用JNI提供Java编程接口。
- 因为虚拟机的存在，Java语言在性能要求较高的场景下并不适用，很多情况下要求整合C/C++模块一同使用。
- Java语言存在之初已经存在C/C++实现的优秀的功能和应用，没必要重复造轮子。
与此可见，JNI技术的出现是由于Java语言所处的境地和其自身的局限性必然要求。
对于Android而言，所有的android的学习者都曾经接触过这样的一张经典的android体系结构图。JNI是连接java层代码和Native层的关键桥梁，想要了解android，就无法避免时时处处与JNI打交道。
Android Studio中JNI的简单使用
1. java代码加载库和声明
首先不得不说，JNI对Java程序员来说是非常宽容和仁慈的，因为在Java中使用JNI调用本地函数非常简单。
(1) System.loadLibrary("Native");加载库文件
(2) 使用Native声明本地函数。
package com.jiesean.jnidemo;
import android.app.Activity;
import android.os.Bundle;
public class MainActivity extends Activity {
@Override
protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
super.onCreate(savedInstanceState);
setContentView(R.layout.activity_main);
}
static {
//加载本地动态库
//JNI为本地动态库的名称，在win中会自动扩展为.dll,在linux中会自动扩展为.so
System.loadLibrary("jnidemo");
}
//使用native声明本地set函数
private native void set(int i);
//使用native声明本地get函数
private native int get();
}
2. javah静态注册,生成.h头文件
Make这个工程，找到MainActivity生成的.class文件，目录在本工程目录下的build/intermediates/classes/debug/包名这个目录下，以我的为例：
build/intermediates/classes/debug/com/jiesean/jnidemo/MainActivity.class
退回到工程的main目录下，进行javah生成.h头文件
命令的格式为
javah-d jni -classpath : com.jiesean.jnidemo.MainActivity
特别注意：:中间的冒号为linux下的用法，windows平台下使用分号。
以我的为例：
javah -d jni -classpath ../../../../../bin/Android/Sdk/platforms/android-24/android.jar:../../build/intermediates/classes/debug com.jiesean.jnidemo.MainActivity
这样在android工程目录下看到：
/* DO NOT EDIT THIS FILE - it is machine generated */
#include
/* Header for class com_jiesean_jnidemo_MainActivity */
#ifndef _Included_com_jiesean_jnidemo_MainActivity
#define _Included_com_jiesean_jnidemo_MainActivity
#ifdef __cplusplus
/*
* Class: com_jiesean_jnidemo_MainActivity
* Method: set
* Signature: (I)V
*/
JNIEXPORT void JNICALL Java_com_jiesean_jnidemo_MainActivity_set
(JNIEnv *, jobject, jint);
/*
* Class: com_jiesean_jnidemo_MainActivity
* Method: get
* Signature: ()I
*/
JNIEXPORT jint JNICALL Java_com_jiesean_jnidemo_MainActivity_get
(JNIEnv *, jobject);
#ifdef __cplusplus
}
#endif
#endif
3. 配置NDK
(1) local.properties中填写NDK路径
ndk.dir=/home/tstz4/bin/Android/Sdk/ndk-bundle
sdk.dir=/home/tstz4/bin/Android/Sdk
(2) jnidemo/build.gradle中加入ndk
defaultConfig {
applicationId "com.jiesean.jnidemo"
minSdkVersion 17
targetSdkVersion 24
versionCode 1
versionName "1.0"
ndk {
moduleName "jnidemo"
ldLibs "log", "z", "m"
abiFilters "armeabi", "armeabi-v7a", "x86"
}
}
(3) gradle.properties文件中添加,如果不存在在工程根目录下创建他。
android.useDeprecatedNdk=true
4. 生成动态库
配置好ndk后，再次make工程，如果显示没有错误，说明生成动态库成功。
注意：在linux下为.so文件，在windows下为.dll文件
android studio的动态库的输出目录为：
/build/intermediates/ndk/debug/lib
5. 安装运行，得到输出结果
09-05 09:18:41.744 2378-2378/com.jiesean.jnidemo D/MainActivity: 得到native函数的返回值11
6. 总有些坑要我们去踩
(1) javah命令使用时，前面不添加SDK_android.jar path，会导致Activity.class找不到的错误。
(2) javah命令使用时，SDK_android.jar path和APP_classes path之间冒号和分号的误用，这里前面已经提到。
(3) linux下动态库会是libjnidemo.so,但是加载的时候不能根据写这个名字，应该根据ndk中声明的来写。
ndk {
moduleName "jnidemo"
ldLibs "log", "z", "m"
abiFilters "armeabi", "armeabi-v7a", "x86"
}
否则会出现
java.lang.UnsatisfiedLinkError: com.android.tools.fd.runtime
小结
本文主要说明了在android studio中使用JNI调用native方法的简单实例。
还有一点不得不说，遇到问题stackoverflow中去查，大部分很快就解决了，中文资料真的很浪费时间。