如何画热图(heatmap)

本人在做芯片数据分析的时候遇到这种情况:

筛出来差异表达的基因如何可视化成了问题,一般情况下不同软件对待差异表达基因的可视化有不同处理,这里重点讨论一下常见heatmap图的绘制。

传统的方法采用R语言包里面的heatmap()函数对其进行绘制,方法比较简单,如果要求较高可以采用这种方法来画图,但是操作起来会比较麻烦,可以参照这个网址进行操作


http://flowingdata.com/2010/01/21/how-to-make-a-heatmap-a-quick-and-easy-solution/

这里我介绍另外一个方法来绘制,采用现成的软件来画,可能图的效果不是很清楚,但至少达到我要求的目的

这个软件叫HeatmapBuider 是由stanford大学用.net开发的一个gui的画图工具

在安装这个软件之前首先得要安装..NET Framework Redistributable 1.1 (or later)(window xp以上系统)

网址如下http://msdn.microsoft.com/netframework/downloads/redist.aspx.

安装完以后 根据你的数据直接可以画图,基本是傻瓜式操作,点两下就明白了



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