该博文记录在Ubuntu中配置安装Anaconda的过程
环境介绍
先查看待安装的机器Linux版本,机器号等。
getconf LONG_BIT
# `64` 为64位机器,`32`则为32位机器
cat /proc/version
# `Linux version 4.2.0-c9 (gcc version 4.9.2)`
cat /etc/issue
# `Ubuntu 14.04.3 LTS \n \l`
配置软件介绍
Anaconda is the leading open data science platform powered by Python. The open source version of Anaconda is a high performance distribution of Python and R and includes over 100 of the most popular Python, R and Scala packages for data science.
Additionally, you'll have access to over 720 packages that can easily be installed with conda, our renowned package, dependency and environment manager, that is included in Anaconda.
via Anaconda
安装过程
下载对应的Anaconda文件:
wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda2-4.1.1-Linux-x86_64.sh
执行相关文件:
bash Anaconda2-4.1.1-Linux-x86_64.sh
测试过程
该部分主要参看Conda test drive milestones
TIP:我们想要查询某个命令的具体文档时,可以在这个命令之后添加--help
查看,例如:
conda update --help
Managing conda
conda
既是环境管理器也是包管理器。这个特性使得一些依赖不同python版本的包的管理也不再那么棘手。
Verify that conda is installed
conda --version
# conda 4.1.6
若出现错误信息,可以尝试检查:
- 是否是安装了Anaconda的环境
- 在安装之后是否重新启动了终端
Update conda to the current version
conda update conda
conda
将比较版本号,并提醒你是否需要更新、更新之后会发生的相关变化。
Managing environments
Create and activate an environment
conda create --name snowflakes biopython
上述命令将创建一个名为biopython
的新环境,该环境将安装包biopython
。conda
默认将环境安装在envs
文件夹下(故上述环境对应的文件夹为~/envs/snowflakes
),可以通过设置create
命令选项进行配置;并且默认也使用与当前python版本相同的版本号。
Activate the new environment
source activate snowflakes
# Windows: `activate snowflakes`
执行上述命令之后,可以通过conda list
进行检验;对应的“关”命令为source deactivate
。
Create a second environment
conda create --name bunnies python=3 astroid babel
上述命令将创建一个名为bunnies
的新环境,配置有包astroid
和babel
,并且python的版本号将变为3。
TIP:最好一次性将需要的包全都说出来,这样conda
可以处理一些依赖冲突。
List all environments
conda info --envs
# # conda environments:
# #
# bunnies /home/ubuntu/anaconda2/envs/bunnies
# snowflakes /home/ubuntu/anaconda2/envs/snowflakes
# root * /home/ubuntu/anaconda2
上述命令将列出当前所有的环境,并在当前使用的环境标志上*
。
Verify environment added
在使用某个环境之后,当前环境将显示在命令行的最前面,例如:
(snowflakes) user:~ $
Deactivate this environment
source deactivate
# Windows: deactivate
上述命令将退出当前环境。
Make an exact copy of an environment
conda create --name flowers --clone snowflakes
上述命令将克隆一个跟snowflakes
完全相同的环境出来,可以通过conda info --envs
检查是否创建成功。
Delete an environment
conda remove --name flowers --all
上述命令将删除环境flowers
,可以通过conda info --envs
来检查是否删除成功。
Managing Python
conda
将python视为一个包,从而简化了管理。
Check Python versions
conda search --full-name python
该命令是用来查找python的可用版本。使用full-name
是为了仅对包名为python
的包进行搜索,否则也将会显示包含python
的包。
Install a different version of Python
conda create --name python3 python=3
该命令将创建一个python版本为3的环境,名为python3
。该环境的激活与关闭的方法与上面所述部分相同。
Verify Python version in new environment
(snowflakes) user:~ $ python --version
# Python 2.7.12 :: Continuum Analytics, Inc.
Managing packages
View a list of packages and versions installed in an environment
conda list
该命令将可以看到当前已安装的包及其版本,当然也可以看到python的版本。
View a list of packages available with the conda install command
conda
可以安装的包可参看该链接。
Search for a package
conda search beautifulsoup4
该命令用来检查是否有相应的包。
Install a new package
conda install --name bunnies beautifulsoup4
注意,省略name
后beautifulsoup4
将默认在当前环境中。
Install a package from Anaconda.org
Anaconda.org也提供了一些公共的、甚至私有的包,我们将介绍如何使用它。
我们先在浏览器中输入http://anaconda.org,之后在 “Search Anaconda Cloud”搜素感兴趣的包,并相应的输入安装指令,如下:
conda install -c pandas bottleneck=0.8.0
Install a package with pip
我们也可以借助pip
来安装一些包,先是要进入到待安装的环境中,之后执行安装指令:
pip install see # 安装包see
Removing packages, environments, or conda
Remove a package
conda remove --name bunnies iopro
# 从环境[bunnies]中删除包[iopro]
Remove an environment
conda remove --name snakes --all
# 删除包与删除环境的不同之处在于`all`
Remove conda
rm -rf ~/miniconda # 删除Miniconda
rm -rf ~/anaconda # 删除anaconda
Windows环境下可以使用控制面板
进行删除。
参考资料
Anaconda
Get Started - Test drive
Conda cheat sheet