将numpy二维数组中的np.nan值替换为指定的值

基础知识
(1)np.nan表示该值不是一个数,比如数据中收入、年龄的缺失值;np.inf表示无穷大
(2)np.nan == np.nan 的结果为False
(3)nan与任何数的操作结果均为nan,例如sum((np.nan,4)) 的结果为nan
(4)一个ndarray数组t1,可以用np.isnan(t1) 定位到nan值的位置,再用t1[np.isnan(t1)] = 指定值 将nan替换为指定值
(5)np.nan_to_num(t1),可以将t1中的nan替换为0
(6)t1[ t1 == t1]可以剔除所有nan只保留非nan值

现在生成一个3*4的数组,设定第1行,第2、3列位置两个元素为np.nan

import numpy as np
t1 = np.arange(12).reshape(3,4).astype('float')
t1[1,2:] = np.nan
print(t1)

[[ 0. 1. 2. 3.]
[ 4. 5. nan nan]
[ 8. 9. 10. 11.]]

1. 问题1:如何将t1中的nan替换为0

#方法1:
for i in range(t1.shape[1]):
    col = t1[:,i]
    col[np.isnan(col)] = 0
#方法2:调用np.nan_to_num方法
t1 = np.nan_to_num(t1)
#方法3:或用np.isnan(t1)做索引,然后替换,建议用该方法
t1[np.isnan(t1)] = 0

方法3不但可以替换为0,替换为其它值也可,建议使用。

2. 问题2:如何将t1中的nan替换为某些计算之后的值,例如将其替换为该列所有非 nan元素的均值
将原始数据中缺失的值替换为0有时未必是合适的。例如原始数据中某些人的年龄没有填,如果替换为0,将来在计算年龄平均值或做数据分析时就存在不合理的后果。此时,将年龄缺失的的人的年龄设为均值更为合理。
(1)方法1

#方法1:
for i in range(t1.shape[1]):
    col = t1[:,i]
    #当前列中如果存在nan,由于np.nan不等于np.nan,所以如果某列中存在nan,则col!=col将会有元素为True,np.count_nonzero方法将会累计值为True的元素数量,可以通过这种方法来判断该列是否存在nan
    nan_num = np.count_nonzero(col != col)
    if nan_num:
        not_nan_col = col[col == col] #用布尔矩阵col == col做索引来筛选矩阵,布尔矩阵中False位置的元素将被剔除。
        col[np.isnan(col)] = not_nan_col.mean()
print(t1)

运行结果:
[[ 0. 1. 2. 3.]
[ 4. 5. 6. 7.]
[ 8. 9. 10. 11.]]

(2)方法2

#方法2:np.nanmean方法可以计算非nan值的均值,此外还有np.nanmax, np.nanmin方法。所以上述程序可以改写如下:
mean = np.nanmean(t1,axis=0)
print('各列的均值为:%s' %mean)
for i in range(t1.shape[1]):
    col = t1[:,i]
    col[np.isnan(col)] = mean[i]
print(t1)

运行结果同上

(3)方法3
使用功能强大的pandas库

#也可以用pandas来处理,更为简单便捷
import pandas as pd
df = pd.DataFrame(t1)
t1 = df.fillna(df.mean()).values  #values代替as_matrix(),可以将DataFrame转换为ndarray
print(t1)

运行结果同上。

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