大多做科研的童鞋们大概都会遇到一个头疼的问题:怎么找文献?如何保证找到的文献都是相关领域的经典文献?之前我们有两篇推送:
基于人工智能的文献检索,导师查找,更聪明
GeenMedical:文献查询、筛选、引用排序、相似文献、全文下载、杂志分区、影响因子、结果导出、杂志评述、直接投稿,一站服务
本文教你如何根据H5指数查找相关领域的高精尖经典文献。
首先来了解一下什么是H指数、H5和H5中位数?
H指数(H-index):于2005年由美国加州大学学圣迭哥分校物理学家 Hirsch 教授提出,用于评价个人学术影响。Hirsch将该指数定义为:若某位科学家的Np篇论文中有h篇论文每一篇的引量都至少为h次,且其他(Np-h)篇论文中每篇的引量都<=h,那么这位科学家的H指数即为h。
H5指数:是指在过去整整5年中所发表文章的H指数;该指数打破了H指数不会随时间的推移而减少,只会增加或保持不变的情况。
H5中位数:是指出版物的H5指数所涵盖的所有文章获得的引用次数的中位值,即H5核内文献的被引频次的中位数。H5中位数指数不考虑 H核内的最低被引频次,而是考虑H核内所有文章的引用次数的中位值来评价期刊刊载的重大研究成果。(备注:H核内是该评价标准中的一个专有名词)
谷歌学术计量(GSM:Google Scholar Metrics)公布了包括英、汉、葡、德、西、法、韩、日、荷、意10种语言的期刊H5和H5中位数排名,可以进入链接(https://scholar.google.com/citations?view_op=top_venues&hl=en) 查看不同类型期刊的排名。
Nature
排名第一,随后是NEJM和Science,Cell排名第六。Nature communication和NAR
影响因子虽在10左右,H5 index排名都在前15。PloS ONE
虽不被看好,排名也在25之内,引用量还是很大的。
点击数字,可以看到近5年文章的引用排名。
Nature
的前10高引领域分布广,包括深度学习,太阳能电池,登革热、范德华力、癌症基因组突变和微生物组,确实都是比较火的领域。
新英格兰杂志,各种癌症和慢性病,3篇Melanoma,2篇肺癌,2篇中风,一篇PD-1,诺贝儿热门领域。
Cell
杂志高引文章次数低于Nature和NEJM,排名第一的是衰老,最多的是CRISPR-Cas9
,中国人的名字比较多,张峰、王浩毅、Lei Qi。剩下的是3D Genome和超级增强子。
也可以查看某一个子类,在此我们以生物信息学相关的期刊为例,依次点击Categories —— Engineering & Computer Science —— Bioinformatics & Computational Biology
即可。
下面为谷歌学术计量统计的从2013-2017年生信期刊H5指数排名
Publication | h5-index | h5-median |
---|---|---|
Bioinformatics | 110 | 188 |
PLOS Computational Biology | 79 | 112 |
BMC Bioinformatics | 61 | 86 |
Briefings in Bioinformatics | 56 | 81 |
Database: The Journal of Biological Databases & Curation | 43 | 63 |
Journal of Theoretical Biology | 42 | 69 |
BMC Systems Biology | 37 | 50 |
GigaScience | 36 | 44 |
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics | 32 | 44 |
Genomics, Proteomics & Bioinformatics | 29 | 48 |
Journal of Mathematical Biology | 29 | 40 |
Mathematical Biosciences | 28 | 36 |
Journal of Biomedical Semantics | 26 | 34 |
Journal of Computational Biology | 23 | 37 |
International Conference on Research in Computational Molecular Biology | 21 | 37 |
Mathematical biosciences and engineering: MBE | 20 | 27 |
Algorithms for Molecular Biology | 19 | 26 |
Pacific Symposium on Biocomputing | 19 | 26 |
Computational Biology and Chemistry | 19 | 24 |
Genomics & Informatics | 18 | 30 |
还可以点击各期刊的H5指数链接,查看构成某个期刊H5指数的核心文章。
排第一的是做系统进化分析的RAxML
, 第二的是Illumina测序质量过滤工具Trimmomatic
(高通量测序的发展功不可没),第三和四的STAR
和HTseq
常用于处理转录组数据的比对和定量 (实际上STAR自带HTSeq的功能,易生信 - 转录组专题分析第4期开课啦)。
这样,你便轻松找到了感兴趣领域里的高引量文献,慢慢享用吧~
可能有人会质疑了,根据H5指数查找是否靠谱?
不要担心,有学者专门做过统计,发现H5指数和H5中位数与传统意义上的期刊评价指数(IF、IF5、ES和AIS)均成极显著正相关,且相关系数大都在0.9以上,表明H5指数和H5中位数在对期刊的评价中有较大的优势。
但同时这样的评价标准也是存在一些问题的,如不能查看谷歌的H5指数往年数据,因此不能进行横向比较;H5指数对于新创刊的期刊或新发文章没有时间优势,可能没办法及时追踪到最新的前沿。
而跟进科研动态的途径有很多,比如1)设置学术期刊或出版公司的电子邮件提醒;2)关注感兴趣作者的社交账号;3)加入科学界的Facebook——Researchgate,里面有很多业内大咖,还有可能与世界同行进行交流;4)定期访问文章官网,查看文章最新动态;5)关注相关专业的论坛和网站等等,但这需要你勤快一点,多多浏览。
找到想要的文献之后,就是如何获取全文了。Sci-Hub是一个提供大量自动且免费的付费学术论文的网站(https://lovescihub.wordpress.com/) ,于2011年由哈萨克斯坦研究生亚历珊卓·艾尔巴金创立,在Pubmed上输入文献名字,获取文章DOI号后,在上述网址中输入文献DOI号即可下载。