sklearn中的PCA使用方法

作者:Roygood 来源:博客园

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最近在做数据分析的实验,在准备进行PCA数据降维的时候产生了疑问,既然训练集和测试集不能放在一起降维,那如何让测试集的维度降到和训练集一样,看到sklearn提供的方法里有一个tranform实现了这个功能,豁然开朗。不知道sklearn里的LDA和其他降维方法有没有类似的功能,欢迎大佬指点。若以后学习到了,回来填坑

1. 函数原型及参数说明

这里只挑几个比较重要的参数进行说明。

sklearn.decomposition.PCA(n_components=None, copy=True, whiten=False)
  • n_components: int, float, None 或 string,PCA算法中所要保留的主成分个数,也即保留下来的特征个数,如果 n_components = 1,将把原始数据降到一维;如果赋值为string,如n_components='mle',将自动选取特征个数,使得满足所要求的方差百分比;如果没有赋值,默认为None,特征个数不会改变(特征数据本身会改变)。
  • copy:True 或False,默认为True,即是否需要将原始训练数据复制。
  • whiten:True 或False,默认为False,即是否白化,使得每个特征具有相同的方差。

2. PCA对象的属性

  • explained_variance_ratio_:返回所保留各个特征的方差百分比,如果n_components没有赋值,则所有特征都会返回一个数值且解释方差之和等于1。
  • n_components_:返回所保留的特征个数。

3.PCA常用方法

  • fit(X): 用数据X来训练PCA模型。
  • fit_transform(X):用X来训练PCA模型,同时返回降维后的数据。
  • inverse_transform(newData) :将降维后的数据转换成原始数据,但可能不会完全一样,会有些许差别。
  • transform(X):将数据X转换成降维后的数据,当模型训练好后,对于新输入的数据,也可以用transform方法来降维。

4.简单例子

import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA X = np.array([[-1, -1], [-2, -1], [-3, -2], [1, 1], [2, 1], [3, 2]]) pca = PCA(n_components=2) newX = pca.fit_transform(X) print(X) Out[365]: [[-1 -1] [-2 -1] [-3 -2] [ 1 1] [ 2 1] [ 3 2]] print(newX) Out[366]: array([[ 1.38340578, 0.2935787 ], [ 2.22189802, -0.25133484], [ 3.6053038 , 0.04224385], [-1.38340578, -0.2935787 ], [-2.22189802, 0.25133484], [-3.6053038 , -0.04224385]]) print(pca.explained_variance_ratio_) [ 0.99244289 0.00755711] 

可以发现第一个特征可以99.24%表达整个数据集,因此我们可以降到1维:

pca = PCA(n_components=1)
newX = pca.fit_transform(X)
print(pca.explained_variance_ratio_)
[ 0.99244289]

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