利用openbabel移除重复的分子

有时候要比较两个不同的文档中的分子,发现有无重复的分子,可以利用babel。

我们可以把两个文档整合为一个文档,利用babel 发现两个文档中的重复分子。
详细内容可参考:https://openbabel.org/docs/dev/Command-line_tools/babel.html#remove-duplicate-molecules

具体操作:
babel infile.xxx -onul --unique #这里xxx 为文件格式

发现重复的分子,输出为
Removed xxx1 - a duplicate of xxx2 (#1)
xxx1与xxx2相似,#1 为发现的第几个分子

你可能感兴趣的:(利用openbabel移除重复的分子)