pymol的正确安装方式

安装pymol走了不少弯路,写个文档避免后来人走坑。
推荐使用环境:Anaconda

一、anaconda下载安装

anaconda集成了python开发所需要的的大部分安装包,可以通过添加国内镜像源,提升其下载的速度。

1.1anaconda下载:

下载链接:添加链接描述
根据自己的电脑情况,下载安装合适的版本:
pymol的正确安装方式_第1张图片
安装时建议将安装路径添加到系统变量中去。

1.2国内源替换方式:

推荐使用清华源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

1.3创建虚拟python环境

使用:

conda create python python=xxx

其中X是版本号,anaconda默认为3.7.4,使用conda环境也是没有问题。

二、pymol安装

2.1pymol下载

推荐在该链接下下载整理好的安装包:
纽普生物
pymol的正确安装方式_第2张图片
此处我选择的是3.7版本的64位pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl,并存放在D盘根目录。
如果要获取最新版本,可以到lfd查看。

2.2安装pmw

在conda shell中,输入 conda install pmw
pymol的正确安装方式_第3张图片
2.3安装:
我们选择安装pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl,并放在D:/根目录。

3.2 命令行下,将盘符切换到D:盘,键入命令:python -m pip install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl

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