BED tools安装流程

BEDTools是可用于genomic features的比较,相关操作及进行注释的工具。而genomic features通常使用Browser Extensible Data (BED) 或者 General Feature Format (GFF)文件表示,用UCSC Genome Browser进行可视化比较。

安装方法:

UNIX系统:

$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.25.0/bedtools-2.25.0.tar.gz

$ tar -zxvf bedtools-2.25.0.tar.gz

$cd bedtools2

$ make

$ cp/bin/* usr/local/bin/

ubuntu系统可以直接使用命令

$ apt-get install bedtools

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