Tensorflow中使用tfrecord,队列方式读取数据

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标准TensorFlow格式

      有一种保存记录的方法可以允许你讲任意的数据转换为TensorFlow所支持的格式, 这种方法可以使TensorFlow的数据集更容易与网络应用架构相匹配。这种建议的方法就是使用TFRecords文件,TFRecords文件包含了tf.train.Example 协议内存块(protocol buffer)(协议内存块包含了字段 Features)。你可以写一段代码获取你的数据, 将数据填入到Example协议内存块(protocol buffer),将协议内存块序列化为一个字符串, 并且通过tf.python_io.TFRecordWriter class写入到TFRecords文件。
     从TFRecords文件中读取数据, 可以使用tf.TFRecordReader的tf.parse_single_example解析器。这个parse_single_example操作可以将Example协议内存块(protocol buffer)解析为张量。

     tfecord文件中的数据是通过tf.train.Example Protocol Buffer的格式存储的,下面是tf.train.Example的定义:

message Example {
 Features features = 1;
};

message Features{
 map featrue = 1;
};

message Feature{
    oneof kind{
        BytesList bytes_list = 1;
        FloatList float_list = 2;
        Int64List int64_list = 3;
    }
};

从上述代码可以看到,ft.train.Example 的数据结构相对简洁。tf.train.Example中包含了一个从属性名称到取值的字典,其中属性名称为一个字符串,属性的取值可以为字符串(BytesList ),实数列表(FloatList )或整数列表(Int64List )。例如我们可以将解码前的图片作为字符串,图像对应的类别标号作为整数列表。

测试例子

先给出数据和程序的链接
数据集 : YaleB_dataset

处理程序 : Batch Generator.py

使用queue读取图片数据方法的大致思路分为三步:
1、根据数据集的具体存储情况生成一个txt清单,清单上记载了每一张图片的存储地址还有一些相关信息(如标签、大小之类的)
2、根据第一步的清单记录,读取数据和信息,并将这些数据和信息按照一定的格式写成Tensorflow的专用文件格式(.tfrecords)

3、从.tfrecords文件中批量的读取数据供给模型使用

数据清单的生成

根据数据的存储情况生成的数据清单,不同的情况写的代码肯定也是不一样的,这里根据我的具体情况说一下过程和程序
我的数据存储地址为:/Users/zhuxiaoxiansheng/Desktop/doc/SICA_data/YaleB

具体情况如下:

Tensorflow中使用tfrecord,队列方式读取数据_第1张图片

这里第一张图片的的Class01表示的是第一个类别,00000表示的是第一个类别里的第一张,生成清单的程序如下:

##相关库函数导入
import os
import cv2 as cv
import tensorflow as tf 
from PIL import Image
import matplotlib.pyplot as plt
def getTrianList():
    root_dir = "/Users/zhuxiaoxiansheng/Desktop/doc/SICA_data/YaleB"  #数据存储文件夹地址
    with open('/Users/zhuxiaoxiansheng/Desktop'+"/Yaledata.txt","w") as f:    #txt文件生成地址
        for file in os.listdir(root_dir):
            if len(file) == 23:                     #图片名长为23个字节,避免读入其他的文件
                f.write(root_dir+'/'+file+" "+ file[11:13] +"\n")   #file[11:13]表示类别编号

生成的清单文件是这样的

Tensorflow中使用tfrecord,队列方式读取数据_第2张图片

生成tfrecords文件

在得到txt清单文件以后,根据这份文件就可以进入流程式的步骤了,首先我们需要生成.tfrecords文件,代码如下

def load_file(example_list_file):   #从清单中读取地址和类别编号,这里的输入是清单存储地址
   lines = np.genfromtxt(example_list_file,delimiter=" ",dtype=[('col1', 'S120'), ('col2', 'i8')])
   examples = []
   labels = []
   for example,label in lines:
       examples.append(example)
       labels.append(label)
   return np.asarray(examples),np.asarray(labels),len(lines)   

def trans2tfRecord(trainFile,output_dir):    #生成tfrecords文件
    _examples,_labels,examples_num = load_file(trainFile)
    filename = output_dir + '.tfrecords'
    writer = tf.python_io.TFRecordWriter(filename)
    for i,[example,label] in enumerate(zip(_examples,_labels)):
        example = example.decode("UTF-8")
        image = cv.imread(example)
        image = cv.resize(image,(192,168))    #这里的格式需要注意,一定要尽量保证图片的大小一致
        image_raw = image.tostring()          #将图片矩阵转化为字符串格式
        example = tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature={
                'image_raw':tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[image_raw])),
                'label':tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[label]))                        
                }))
        writer.write(example.SerializeToString()) 
    writer.close()     #写入完成,关闭指针
    return filename    #返回文件地址

这里生成的是.tfrecords不好打开,就不展示了

从tfrecords文件中读取数据

设置从tfrecords文件中读取文件方式的函数如下:

def read_tfRecord(file_tfRecord):     #输入是.tfrecords文件地址
    queue = tf.train.string_input_producer([file_tfRecord])
    reader = tf.TFRecordReader()
    _,serialized_example = reader.read(queue)
    features = tf.parse_single_example(
            serialized_example,
            features={
          'image_raw':tf.FixedLenFeature([], tf.string),   
          'label':tf.FixedLenFeature([], tf.int64)
                    }
            )
    image = tf.decode_raw(features['image_raw'],tf.uint8)
    image = tf.reshape(image,[192,168,3])
    image = tf.cast(image, tf.float32)
    image = tf.image.per_image_standardization(image)
    label = tf.cast(features['label'], tf.int64)   这里设置了读取信息的格式
    return image,label

测试代码

上面就是主要的代码,其中特别要注意的就是以下两句,非常重要:

coord=tf.train.Coordinator() #创建一个协调器,管理线程
threads=tf.train.start_queue_runners(coord=coord) #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队

这两句实现的功能就是创建线程并使用QueueRunner对象来提取数据。简单来说:使用tf.train函数添加QueueRunner到tensorflow中。在运行任何训练步骤之前,需要调用tf.train.start_queue_runners函数,否则tensorflow将一直挂起。

tf.train.start_queue_runners 这个函数将会启动输入管道的线程,填充样本到队列中,以便出队操作可以从队列中拿到样本。这种情况下最好配合使用一个tf.train.Coordinator,这样可以在发生错误的情况下正确地关闭这些线程。如果你对训练迭代数做了限制,那么需要使用一个训练迭代数计数器,并且需要被初始化。

if __name__ == '__main__':
    getTrianList()
    dataroad = "/Users/zhuxiaoxiansheng/Desktop/Yaledata.txt"
    outputdir = "/Users/zhuxiaoxiansheng/Desktop/Yaledata"

    trainroad = trans2tfRecord(dataroad,outputdir)
    traindata,trainlabel = read_tfRecord(trainroad)
    image_batch,label_batch = tf.train.shuffle_batch([traindata,trainlabel],
                                            batch_size=100,capacity=2000,min_after_dequeue = 1000) 

    with tf.Session() as sess:
        sess.run(tf.local_variables_initializer())
        sess.run(tf.global_variables_initializer())  
        coord = tf.train.Coordinator()
        threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess,coord = coord)
        train_steps = 10  

        try:  
            while not coord.should_stop():  # 如果线程应该停止则返回True  
                example,label = sess.run([image_batch,label_batch])  
                print(example.shape,label)  

                train_steps -= 1  
                print(train_steps)  
                if train_steps <= 0:  
                    coord.request_stop()    # 请求该线程停止  

        except tf.errors.OutOfRangeError:  
            print ('Done training -- epoch limit reached')  
        finally:  
            # When done, ask the threads to stop. 请求该线程停止  
            coord.request_stop()  
        # And wait for them to actually do it. 等待被指定的线程终止  
        coord.join(threads)  

如果成功的话会有下面的输出(输出结果就截自己的图吧):

Tensorflow中使用tfrecord,队列方式读取数据_第3张图片]。


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