SimpleITK保存Nii文件与错误处理

Reason:
把处理好的分割结果保存为nii文件，用ITKsnap读取时出现了如下错误。

SimpleITK读取和保存Nii文件

1. 读取

import SimpleITK as sitk
filename = './xxx.nii'
ct = sitk.ReadImage(filename)
ct_array = sitk.GetArrayFromImage(ct)

origin =ct.GetOrigin()
direction = ct.GetDirection()
space = ct.GetSpacing()

2. 保存

savedImg = sitk.GetImageFromArray(ct_array)
savedImg.SetOrigin(origin)
savedImg.SetDirection(direction)
savedImg.SetSpacing(space)
sitk.WriteImage(savedImg, saved_name)

Note：被保存的ct_array数组一定是ndarray，float类型的才能被ITKsnap正确读取，如果是int类型的，就会出现上图中的错误。