下载 sra-toolkit

下载ncbi的数据

从ncbi下载 sra-toolkit（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/toolkitsoft/）

选择你的系统版本下载并解压

下载sra序列
SRR_Acc_List.txt是SRR号的文件

prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt -O /media/sdc/data

或者使用aspera下载

prefetch -t ascp -a "/home/yczuo6/.aspera/connect/bin/ascp|/home/yczuo6/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file SRR_Acc_List.txt 

使用fastq-dump把sra格式文件转化为fastq文件

for i in *sra
do
echo $i
fastq-dump --split-3 $i
done