sratoolkit 的使用

一.主要功能有两个:

1.下载分析所需的测序数据SRR

2.将sra后缀的文件格式转换为fastq文件

 

二:具体用法如下

1.下载数据:

prefetch SRR3589950 

2.文件格式转化:

fastq-dump  --gzip  --split-3 -O  /home/lmt/biosoft  -A SRR3589950.sra

 

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