Materials Studio 做分子动力学MD（CO2为例）

1.新建CO2模型

（1）首先在MS中新建一个项目，命名为MD，然后把CO2的.pdb文件拖进来，.pdb文件可以根据GaussianView得到，百度也搜得到。

（2）然后建立块体。点击Modules➡Amorphous Cell➡Calculation。如图所示。

（3）选择块体的大小，输入分子的个数，其他参数可以再具体设置。如图所示。

（4）运行出来后出现下图所示的界面。

2.导入力场force field。点击Modules➡Forcite➡Forcefield Manager，如图所示，打开力场的选择界面，根据自己的要求导入合适的力场，如图所示。

3.分子动力学模拟。点击Modules➡Forcite➡Calculation，如图所示。打开参数设置界面，如图所示。

然后就可以运行了，50个分子应该要不了多久的。运行结束后，会有一些中间的数据文件，比如能量、温度，如图所示。