峰峰love典典
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GEO数据挖掘（1）引出

要知道的背景知识

GEO=Gene Expression Omnibus
一个基因对应一个GSE编号，根据编号在NCBI-GEO中找http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24673(编号根据需要)
首先GES号要有，然后找表达矩阵
limma包的用法掌握
找差异基因的方法就是换R包
了解一下refseq的背景知识，探针和基因如何完美匹配（见后面的博客）
学习芯片基础知识
一个GSE里面有3种芯片平台数据该如何处理呢

GEO数据库

先看一下GEO主页
GEO数据挖掘（1）引出_第1张图片
每个GES数据集会有多个sample
我们的起点就是一个数据集GSE，搞清楚里面有多少sample
一个GSE会有多个芯片平台
plantform
GEO数据挖掘（1）引出_第2张图片

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