Ubuntu 下生物分析软件的安装

本ubuntu发行版本为16.04。以群体结构分析软件admixture安装为例。

• 下载软件，一般下载的软件为tarball压缩格式 wget somehttps

• 软件下载完进行解压，可选择解压到指定目录

sudo tar -jxv -f admixture.tar.bz2 -C /usr/local/src #如果是gzip压缩格式则用-zxv来进行解压即可
此时解压后目录/usr/local/src/admixture下绿色的admixture文件即为可执行程序，有的复杂的需用make编译。要执行程序的话只需在相应目录下./admixture即可执行文件，但是这样比较麻烦，每次执行都需要切换到此目录。

• 为了方便以后的使用可创建软链接（也即Windows下的快捷方式），然后添加到bash配置文件~/.bashrc中，如此便可以在该bash中跟使用shell命令一样直接调用该程序。

ln -s /usr/local/src/admixture/admixture /home/user/biosoft/admixture  
# /usr/local/src/admixture/admixture中前一个admixture为目录，后一个为可执行文件 
echo alias admixture=/home/user/biosoft/admixture >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

• 也可建立软连接至/usr/local/bin下，这样以后也可以直接使用，更方便的是这样安装一次以后多个用户都可以使用的。

$ ln -s /usr/local/src/admixture/admixture /usr/local/bin/admixture