6月数据库汇总(截止6.21)上

写在前面

整个5-6月份发表了近100篇数据库文章。进一步去掉一些其他物种的以及植物方面的数据库，最后剩下了88个数据库。

这次的数据库我们分成了六个方面。(1) 疾病相关数据库；(2) DNA相关数据库；(3) RNA相关数据库；(4) 蛋白相关数据库；(5) 组学分析流程数据库；(6) 微生物和老鼠相关数据库；(7) 其他数据库。

由于这个月发表的数据库比较多，所以我们分上、中、下来介绍这些新发表的数据库。这次我们介绍疾病相关数据库；DNA相关数据库以及其他物种的数据库。

以下是所有这个月数据库的汇总，如果想要pdf格式的文件。可以直接后台回复:"2006"。

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1.疾病相关数据库

这类疾病相关的数据库，基本上是总结了多个公共数据集的数据集来进行分析。通过这样的数据库，我们就省去了去GEO这样的公共数据库检索目标疾病数据集的时间。

1.1 SNE-NICHD https://snengs.nichd.nih.gov

视网膜数据库。提供了多个物种关于视网膜和松果体的转录组数据。

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1.2 OSluca: http://bioinfo.henu.edu.cn/Index.html

肺癌生存分析数据库。数据库纳入了35个数据集的5741个患者的生存数据。不过只是一个简单的各个数据集的汇总做完的汇总。并不是整合到一起的结果

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1.3 dBMHCC: http://predictor.nchu.edu.tw/dBMHCC/index.php

肝癌标志物数据库。整合了多个数据库，可以见检索基因是否是肝癌的标志物。

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1.4 VIRdb: https://www.vitiligoinfores.com/index.html

白癜风综合性数据库。利用白癜风相关的高通量数据，来分析和白癜风相关的基因。

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1.5 MyomiRDB: http://www.myomirdb.in/

肌肉萎缩相关miRNA数据库。分析肌肉萎缩过程当中相关的miRNA以及这些miRNA相关功能的数据库。

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1.6 TTRMDb： http://vit.ac.in/ttrmdb

运甲状腺素蛋白突变体的淀粉样疾病数据库

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2.DNA相关数据库

2.1 SNPnexus： https://www.snp-nexus.org

SNP注释数据库。对SNP位置和调控相关预测数据库。

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### 2.2 EpiRegioDB:https://epiregio.de/

非编码DNA区域对于基因表达调控数据库。通过输入基因名来获取这个基因可能收到的调控位置。属于预测表观遗传的数据库。

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3. 老鼠和微生物数据库

3.1 PROSPECT: http://PROSPECT.erc.monash.edu/

细菌蛋白质磷酸化位点预测数据库。通过输入 fa序列来进行预测。

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3.2 PSI-MOUSE: http://psimouse.rnamd.com

老鼠的假性尿苷（Ψ）数据库。

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3.3 gutMEGA：http://gutmega.omicsbio.info

人类肠道基因组图谱数据库。收集了多个16S测序的结果来综合的一个数据库。算是肠道基因组方面一个很好的数据库了。

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