柳叶刀与小鼠标
柳叶刀与小鼠标

蛋白质内部氨基酸之间的相互作用①（python、R语言）

蛋白质数据库（PDB）是生物大分子3D结构的存储库，其中包含其原子的坐标，通过使用两个原子的这些坐标，可以计算它们之间的距离。使用典型的pdb文件，可以使用类似于Biopython文档中介绍的方法来计算结构中两个原子之间的距离。如下所示：

  • 计算直接来自pdb数据库的数据
    首先要现在pdb数据库中将4TWU.pdb文件下载下来。
    https://www.rcsb.org/structure/4TWU

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