Nature | 2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究

文章信息：
标题：A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes
中文：2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究
杂志：Nature
时间：2012
单位：深圳华大生命科学研究院

摘要：
肠道菌群的评估和表征已经成为人类疾病的一个主要研究领域，包括2型糖尿病，这是世界上最流行的内分泌疾病。为了分析2型糖尿病患者的肠道微生物含量，我们开发了一项宏基因组全关联研究(MGWAS)方案，并基于345名中国人的肠道微生物DNA的深度散弹枪测序进行了两阶段的MGWAS。我们鉴定和验证了大约60,000种2型糖尿病相关的标记物，并建立了宏基因组连锁群（MLG）的概念，使分类物种水平的分析成为可能。MGWAS分析表明,2型糖尿病患者具有中等程度的肠道微生物生态失调,减少大量的一些通用butyrate-producing细菌和增加各种机会致病菌,以及其他微生物的富集功能赋予硫酸盐还原和氧化应激抵抗。一项对另外23个个体的分析表明，这些肠道微生物标志物可能有助于2型糖尿病的分类。

1 肠道微生物T2D有关标记

2 TCD CON有关MLG与已知细菌分类型

3 T2D病人肠道微生物物种类型、功能特征

4 T2D病人肠道微生物变现出一定的菌群紊乱

更多：
华大基因主导完成肠道微生物与Ⅱ型糖尿病的宏基因组关联分析

• 1 基于新一代鸟枪法深度测序技术，研发出一种新的宏基因组关联分析（Metagenome-Wide Association Study, MGWAS）方法。
• 2 建立了一个全新概念——宏基因组连锁群（metagenomic linkage group，MLG），以便于对大量的宏基因组数据进行物种描述及分类，并可替代传统的物种分类方法，而且能为未知物种提供宏基因组水平的信息，例如染色体上细菌物种的特定区域，质粒和噬菌体等可移动的遗传因子。