2020-07-14 通过简单的内联重定向和变量调用实现gatk json文件的批量生成

直接上代码：

#!/bin/bash
for sample in A B C D; do
    cd /data/output/${sample}/
        # 接下来是重点，使用内联重定向符号<<和首尾标记，将多行文本写入json文件
        # 首尾标记可以是任意选择，我这里用EOF(像haha，hehe等也是可以作为标记的)，那么两个EOF中间的文本会被重定向至json文件
        # 首尾标记中间的文本除了确实需要缩进的地方，不 需 要 额 外 缩 进
        # 在文本文件中，也可以调用变量，如${sample}
    cat>preprocessing-for-variant-discovery-gatk4.b37.inputs.json<

使用内联重定向符号<<和首尾标记，可以将多行文本写入json文件
首尾标记可以是任意选择，我这里用EOF(像haha，hehe等也是可以作为标记的)，那么两个EOF中间的文本会被重定向至json文件
首尾标记中间的文本除了确实需要缩进的地方，不 需 要 额 外 缩 进
在文本文件中，也可以调用变量，如${sample}