2018-06-14 跑gatk奔溃，释放你主机的内存buff cache

好久没有写更新，最近实在是太忙了，也发生了很多事情，对科研也有点迷茫啊，让我止步不前，但是想来想去，还是要按部就班地学习。

最近在自学广义线性模型，机器学习，还要跑重测序的数据，可以说没有一个重心。

我在跑很大数据的gatk的流程的时候，每次都会断掉，不知道什么原因，后来我发现是内存不够了，网上查了查，只要手动释放你的内存就OK，也可以编个脚本，每天定时释放。

命令很简单

sync
echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

表示清除pagecache和slab分配器中的缓存对象。

网上说是这样：

sync
echo 1 > /proc/sys/vm/drop_caches
echo 2 > /proc/sys/vm/drop_caches
echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

一般先用sync
sync 命令将所有未写的系统缓冲区写到磁盘中
然后释放内存

这里有个编写脚本的参考：
https://blog.csdn.net/u014740338/article/details/66975550

这里有个top 命令的详解：
https://blog.csdn.net/quiet_girl/article/details/50668126

还是要不断学习