Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图

目录

一、窄依赖解析

二、宽依赖解析

三、DAG生成的机制

四、DAG逻辑视图解析


  RDD依赖关系为成两种:窄依赖(Narrow Dependency)、宽依赖(Shuffle Dependency)。窄依赖表示每个父RDD中的Partition最多被子RDD的一个Partition所使用;宽依赖表示一个父RDD的Partition都会被多个子RDD的Partition所使用。

一、窄依赖解析

  RDD的窄依赖(Narrow Dependency)是RDD中最常见的依赖关系,用来表示每一个父RDD中的Partition最多被子RDD的一个Partition所使用,如下图所示,父RDD有2~3个Partition,每一个分区都只对应子RDD的一个Partition(join with inputs co-partitioned:对数据进行基于相同Key的数值相加)。

  Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图_第1张图片

  窄依赖分为两类:第一类是一对一的依赖关系,在Spark中用OneToOneDependency来表示父RDD与子RDD的依赖关系是一对一的依赖关系,如map、filter、join with inputs co-partitioned;第二类是范围依赖关系,在Spark中用RangeDependency表示,表示父RDD与子RDD的一对一的范围内依赖关系,如union。OneToOneDependency依赖关系的Dependency.scala的源码如下。

/**
 * :: DeveloperApi ::
 * Represents a one-to-one dependency between partitions of the parent and child RDDs.
 */
@DeveloperApi
class OneToOneDependency[T](rdd: RDD[T]) extends NarrowDependency[T](rdd) {
  override def getParents(partitionId: Int): List[Int] = List(partitionId)
}

  OneToOneDependency的getParents重写方法引入了参数partitionId,而在具体的方法中也使用了这个参数,这表明子RDD在使用getParents方法的时候,查询的是相同partitionId的内容。也就是说,子RDD仅仅依赖父RDD中相同partitionID的Partition。

  Spark窄依赖中第二种依赖关系是RangeDependency。Dependency.scala的RangeDependency的源码如下。

/**
 * :: DeveloperApi ::
 * Represents a one-to-one dependency between ranges of partitions in the parent and child RDDs.
 * @param rdd the parent RDD
 * @param inStart the start of the range in the parent RDD
 * @param outStart the start of the range in the child RDD
 * @param length the length of the range
 */
@DeveloperApi
class RangeDependency[T](rdd: RDD[T], inStart: Int, outStart: Int, length: Int)
  extends NarrowDependency[T](rdd) {
 
  override def getParents(partitionId: Int): List[Int] = {
    if (partitionId >= outStart && partitionId < outStart + length) {
      List(partitionId - outStart + inStart)
    } else {
      Nil
    }
  }
}

  RangeDependency和OneToOneDependency最大的区别是实现方法中出现了outStart、length、instart,子RDD在通过getParents方法查询对应的Partition时,会根据这个partitionId减去插入时的开始ID,再加上它在父RDD中的位置ID,换而言之,就是将父RDD中的Partition,根据partitionId的顺序依次插入到子RDD中。

  分析完Spark中的源码,下边通过两个例子来讲解从实例角度去看RDD窄依赖输出的结果。对于OneToOneDependency,采用map操作进行实验,实验代码和结果如下所示。

val sparkSession = SparkSession.builder().master("local").appName("wordcount").getOrCreate()
val sc = sparkSession.sparkContext
sc.setLogLevel("WARN")
 
// val people = sparkSession.read.parquet("...").as[Person]
 
val num = Array(100,80,70)
val rddnum1 = sc.parallelize(num)
val mapRdd = rddnum1.map(_*2)
mapRdd.collect().foreach(println)

 Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图_第2张图片

 

二、宽依赖解析

  RDD的宽依赖(Shuffle Dependency)是一种会导致计算时产生Shuffle操作的RDD操作,用来表示一个父RDD的Partition都会被多个子RDD的Partition使用,如下图中groupByKey算子操作所示,父RDD有3个Partition,每个Partition中的数据会被子RDD中的两个Partition使用。

  Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图_第3张图片

  宽依赖的源码位于Dependency.scala文件的ShuffleDependency方法中,newShuffleId()产生了新的shuffleId,表明宽依赖过程需要涉及shuffle操作,后续的代码表示宽依赖进行时的shuffle操作需要向shuffleManager注册信息。Dependency.scala的ShuffleDependency的源码如下。

@DeveloperApi
class ShuffleDependency[K: ClassTag, V: ClassTag, C: ClassTag](
    @transient private val _rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]],
    val partitioner: Partitioner,
    val serializer: Serializer = SparkEnv.get.serializer,
    val keyOrdering: Option[Ordering[K]] = None,
    val aggregator: Option[Aggregator[K, V, C]] = None,
    val mapSideCombine: Boolean = false)
  extends Dependency[Product2[K, V]] {
 
  override def rdd: RDD[Product2[K, V]] = _rdd.asInstanceOf[RDD[Product2[K, V]]]
 
  private[spark] val keyClassName: String = reflect.classTag[K].runtimeClass.getName
  private[spark] val valueClassName: String = reflect.classTag[V].runtimeClass.getName
  // Note: It's possible that the combiner class tag is null, if the combineByKey
  // methods in PairRDDFunctions are used instead of combineByKeyWithClassTag.
  private[spark] val combinerClassName: Option[String] =
    Option(reflect.classTag[C]).map(_.runtimeClass.getName)
 
  val shuffleId: Int = _rdd.context.newShuffleId()
 
  val shuffleHandle: ShuffleHandle = _rdd.context.env.shuffleManager.registerShuffle(
    shuffleId, _rdd.partitions.length, this)
 
  _rdd.sparkContext.cleaner.foreach(_.registerShuffleForCleanup(this))
@DeveloperApi
class ShuffleDependency[K: ClassTag, V: ClassTag, C: ClassTag](
    @transient private val _rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]],
    val partitioner: Partitioner,
    val serializer: Serializer = SparkEnv.get.serializer,
    val keyOrdering: Option[Ordering[K]] = None,
    val aggregator: Option[Aggregator[K, V, C]] = None,
    val mapSideCombine: Boolean = false)
  extends Dependency[Product2[K, V]] {
 
  override def rdd: RDD[Product2[K, V]] = _rdd.asInstanceOf[RDD[Product2[K, V]]]
 
  private[spark] val keyClassName: String = reflect.classTag[K].runtimeClass.getName
  private[spark] val valueClassName: String = reflect.classTag[V].runtimeClass.getName
  // Note: It's possible that the combiner class tag is null, if the combineByKey
  // methods in PairRDDFunctions are used instead of combineByKeyWithClassTag.
  // 注意:如果在PairRDDFunctions方法中使用combineByKeyWithClassTag,combiner类标签可能为空
  private[spark] val combinerClassName: Option[String] =
    Option(reflect.classTag[C]).map(_.runtimeClass.getName)
 
  val shuffleId: Int = _rdd.context.newShuffleId()
 
  val shuffleHandle: ShuffleHandle = _rdd.context.env.shuffleManager.registerShuffle(
    shuffleId, _rdd.partitions.length, this)
 
  _rdd.sparkContext.cleaner.foreach(_.registerShuffleForCleanup(this))
}

 Spark中宽依赖关系非常常见,其中较经典的操作为GroupByKey(将输入的key-value类型的数据进行分组,对相同key的value值进行合并,生成一个tuple2),具体代码和操作结果如下所示。输入5个tuple2类型的数据,通过运行产生3个tuple2数据。  

val sparkSession = SparkSession.builder().master("local").appName("wordcount").getOrCreate()
val sc = sparkSession.sparkContext
sc.setLogLevel("WARN")   
val data = Array(Tuple2("spark",100),Tuple2("spark",95),Tuple2("hadoop",99),Tuple2("hadoop",80),Tuple2("scala",75))
val rdd = sc.parallelize(data)
val rddGroup = rdd.groupByKey()
rddGroup.collect().foreach(println)

  Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图_第4张图片

三、DAG生成的机制

  在图论中,如果一个有向图无法从任意顶点出发经过若干条边回到该点,则这个图是一个有向无环图(DAG图)。而在Spark中,由于计算过程很多时候会有先后顺序,受制于某些任务必须比另一些任务较早执行的限制,我们必须对任务进行排队,形成一个队列的任务集合,这个队列的任务集合就是DAG图,每一个定点就是一个任务,每一条边代表一种限制约束(Spark中的依赖关系)。

  通过DAG,Spark可以对计算的流程进行优化,对于数据处理,可以将在单一节点上进行的计算操作进行合并,并且计算中间数据通过内存进行高效读写,对于数据处理,需要涉及Shuffle操作的步骤划分Stage,从而使计算资源的利用更加高效和合理,减少计算资源的等待过程,减少计算中间数据读写产生的时间浪费(基于内存的高效读写)。

  Spark中DAG生成过程的重点是对Stage的划分,其划分的依据是RDD的依赖关系,对于不同的依赖关系,高层调度器会进行不同的处理。对于窄依赖,RDD之间的数据不需要进行Shuffle,多个数据处理可以在同一台机器的内存中完成,所以窄依赖在Spark中被划分为同一个Stage;对于宽依赖,由于Shuffle的存在,必须等到父RDD的Shuffle处理完成后,才能开始接下来的计算,所以会在此处进行Stage的切分。

  在Spark中,DAG生成的流程关键在于回溯,在程序提交后,高层调度器将所有的RDD看成是一个Stage,然后对此Stage进行从后往前的回溯,遇到Shuffle就断开,遇到窄依赖,则归并到同一个Stage。等到所有的步骤回溯完成,便生成一个DAG图。

  DAG生成的相关源码位于Spark的DAGScheduler.scala。getParentStages获取或创建一个给定RDD的父Stages列表,getParentStages调用了getShuffleMapStage,,getShuffleMapStage调用了getAncestorShuffleDependencies,getAncestorShuffleDependencies返回给定RDD的父节点中直接的Shuffle依赖。DAGScheduler.scala的getParentStages的源码如下。

/**
 * Get or create the list of parent stages for a given RDD.  The new Stages will be created with
 * the provided firstJobId.
 */
private def getParentStages(rdd: RDD[_], firstJobId: Int): List[Stage] = {
  val parents = new HashSet[Stage]
  val visited = new HashSet[RDD[_]]
  // We are manually maintaining a stack here to prevent StackOverflowError
  // caused by recursively visiting
  val waitingForVisit = new Stack[RDD[_]]
  def visit(r: RDD[_]) {
    if (!visited(r)) {
      visited += r
      // Kind of ugly: need to register RDDs with the cache here since
      // we can't do it in its constructor because # of partitions is unknown
      for (dep <- r.dependencies) {
        dep match {
          case shufDep: ShuffleDependency[_, _, _] =>
            parents += getShuffleMapStage(shufDep, firstJobId)
          case _ =>
            waitingForVisit.push(dep.rdd)
        }
      }
    }
  }
  waitingForVisit.push(rdd)
  while (waitingForVisit.nonEmpty) {
    visit(waitingForVisit.pop())
  }
  parents.toList
}

DAGScheduler.scala的getShuffleMapStage的源码如下。  

/**
 * Get or create a shuffle map stage for the given shuffle dependency's map side.
 */
private def getShuffleMapStage(
    shuffleDep: ShuffleDependency[_, _, _],
    firstJobId: Int): ShuffleMapStage = {
  shuffleToMapStage.get(shuffleDep.shuffleId) match {
    case Some(stage) => stage
    case None =>
      // We are going to register ancestor shuffle dependencies
      getAncestorShuffleDependencies(shuffleDep.rdd).foreach { dep =>
        if (!shuffleToMapStage.contains(dep.shuffleId)) {
          shuffleToMapStage(dep.shuffleId) = newOrUsedShuffleStage(dep, firstJobId)
        }
      }
      // Then register current shuffleDep
      val stage = newOrUsedShuffleStage(shuffleDep, firstJobId)
      shuffleToMapStage(shuffleDep.shuffleId) = stage
      stage
  }
}

DAGScheduler.scala的getAncestorShuffleDependencies的源码如下。  

/** Find ancestor shuffle dependencies that are not registered in shuffleToMapStage yet */
private def getAncestorShuffleDependencies(rdd: RDD[_]): Stack[ShuffleDependency[_, _, _]] = {
  val parents = new Stack[ShuffleDependency[_, _, _]]
  val visited = new HashSet[RDD[_]]
  // We are manually maintaining a stack here to prevent StackOverflowError
  // caused by recursively visiting
  val waitingForVisit = new Stack[RDD[_]]
  def visit(r: RDD[_]) {
    if (!visited(r)) {
      visited += r
      for (dep <- r.dependencies) {
        dep match {
          case shufDep: ShuffleDependency[_, _, _] =>
            if (!shuffleToMapStage.contains(shufDep.shuffleId)) {
              parents.push(shufDep)
            }
          case _ =>
        }
        waitingForVisit.push(dep.rdd)
      }
    }
  }
 
  waitingForVisit.push(rdd)
  while (waitingForVisit.nonEmpty) {
    visit(waitingForVisit.pop())
  }
  parents
}

四、DAG逻辑视图解析

  下面通过一个简单计数案例讲解DAG具体的生成流程和关系。示例代码如下。

val conf = new SparkConf()
conf.setAppName("My first spark app").setMaster("local")
val sc = new SparkContext(conf)
sc.setLogLevel("WARN")
val lines = sc.textFile("./src/test3/words.txt")
// 操作一 通过flatmap形成新的MapPartitionRDD
val words = lines.flatMap(lines=>lines.split(" "))
// 操作二  通过map形成新的MapPartitionRDD
val pairs = words.map(word=>(word,1))
// 操作三  reduceByKey(包含两步reduce)
// 此步骤生成MapPartitionRDD和ShuffleRDD
val WordCounts = pairs.reduceByKey(_+_)
WordCounts.collect().foreach(println)
println(pairs.toDebugString)  // 通过toDebugString查看RDD的谱系
println("====================================================")
println(WordCounts.toDebugString)
println("====================================================")
sc.stop()

Spark之RDD依赖关系及DAG逻辑视图_第5张图片

具体解释为:在程序正式运行前,Spark的DAG调度器会将整个流程设定为一个Stage,此Stage包含3个操作,5个RDD,分别为MapPartitionRDD(读取文件数据时)、MapPartitionRDD(flatMap操作)、MapPartitionRDD(map操作)、MapPartitionRDD(reduceByKey的local段的操作)、ShuffleRDD(reduceByKeyshuffle操作)。

  (1)回溯整个流程,在shuffleRDD与MapPartitionRDD(reduceByKey的local段的操作)中存在shuffle操作,整个RDD先在此切开,形成两个Stage。
  (2)继续向前回溯,MapPartitionRDD(reduceByKey的local段的操作)与MapPartitionRDD (map操作)中间不存在Shuffle(即两个RDD的依赖关系为窄依赖),归为同一个Stage。
  (3)继续回溯,发现往前的所有的RDD之间都不存在Shuffle,应归为同一个Stage。
  (4)回溯完成,形成DAG,由两个Stage构成:

  第一个Stage由MapPartitionRDD(读取文件数据时)、MapPartitionRDD(flatMap操作)、MapPartitionRDD(map操作)、MapPartitionRDD(reduceByKey的local段的操作)构成。第二个Stage由ShuffleRDD(reduceByKey Shuffle操作)构成。

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