FDR(矫正后的P值)问题

最近在分析数据的时候,遇到一个问题。

因为在文献中大家好像都在用FDR作为指标来判断。

但是我的结果中FDR普遍为0.99且一样,而P值则小于0.05,这就让我比较迷茫?

为什么会出现这种情况?是我在处理的哪个环节出错了吗?

在这种情况下,是否应该根据FDR来判断,FDR处理的意义是什么?

于是以下,就这个问题进行探究。

我处理后的部分数据:

gene logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B
ARHGAP4 0.230563713 6.564189212 4.055469371 0.000260371 0.99070587 -0.667925915
TUNAR 0.301789676 7.84758218 3.799942772 0.000545143 0.99070587 -1.107306675
ZNF469 0.245938903 7.417314332 3.675059778 0.00077793 0.99070587 -1.320066426
HAR1A 0.312924032 7.712889342 3.650382194 0.000834163 0.99070587 -1.361914606
LINC02504 -0.19053191 6.636669659 -3.604447284 0.000949469 0.99070587 -1.439622155
GPR26 0.258944298 9.653403752 3.553737688 0.001094615 0.99070587 -1.525104617

待补充。


时隔2年,我终于过来填坑了!

FDR(矫正后的P值)问题_第1张图片

 

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