摘要:FCN对图像进行像素级的分类,从而解决了语义级别的图像分割问题。
本文分享自华为云社区《全卷积网络(FCN)实战:使用FCN实现语义分割》,作者: AI浩。
FCN对图像进行像素级的分类,从而解决了语义级别的图像分割(semantic segmentation)问题。与经典的CNN在卷积层之后使用全连接层得到固定长度的特征向量进行分类(全联接层+softmax输出)不同,FCN可以接受任意尺寸的输入图像,采用反卷积层对最后一个卷积层的feature map进行上采样, 使它恢复到输入图像相同的尺寸,从而可以对每个像素都产生了一个预测, 同时保留了原始输入图像中的空间信息, 最后在上采样的特征图上进行逐像素分类。
下图是语义分割所采用的全卷积网络(FCN)的结构示意图:
传统的基于CNN的分割方法缺点?
传统的基于CNN的分割方法:为了对一个像素分类,使用该像素周围的一个图像块作为CNN的输入,用于训练与预测,这种方法主要有几个缺点:
1)存储开销大,例如,对每个像素使用15 * 15的图像块,然后不断滑动窗口,将图像块输入到CNN中进行类别判断,因此,需要的存储空间随滑动窗口的次数和大小急剧上升;
2)效率低下,相邻像素块基本上是重复的,针对每个像素块逐个计算卷积,这种计算有很大程度上的重复;
3)像素块的大小限制了感受区域的大小,通常像素块的大小比整幅图像的大小小很多,只能提取一些局部特征,从而导致分类性能受到限制。
而全卷积网络(FCN)则是从抽象的特征中恢复出每个像素所属的类别。即从图像级别的分类进一步延伸到像素级别的分类。
FCN改变了什么?
对于一般的分类CNN网络,如VGG和Resnet,都会在网络的最后加入一些全连接层,经过softmax后就可以获得类别概率信息。但是这个概率信息是1维的,即只能标识整个图片的类别,不能标识每个像素点的类别,所以这种全连接方法不适用于图像分割。
而FCN提出可以把后面几个全连接都换成卷积,这样就可以获得一张2维的feature map,后接softmax层获得每个像素点的分类信息,从而解决了分割问题,如图。
FCN缺点
(1)得到的结果还是不够精细。进行8倍上采样虽然比32倍的效果好了很多,但是上采样的结果还是比较模糊和平滑,对图像中的细节不敏感。
(2)对各个像素进行分类,没有充分考虑像素与像素之间的关系。忽略了在通常的基于像素分类的分割方法中使用的空间规整(spatial regularization)步骤,缺乏空间一致性。
数据集
本例的数据集采用PASCAL VOC 2012 数据集,它有二十个类别:
Person:person
Animal: bird, cat, cow, dog, horse, sheep
Vehicle:aeroplane, bicycle, boat, bus, car, motorbike, train
Indoor: bottle, chair, dining table, potted plant, sofa, tv/monitor
下载地址:The PASCAL Visual Object Classes Challenge 2012 (VOC2012) (ox.ac.uk)。
数据集的结构:
VOCdevkit └── VOC2012 ├── Annotations 所有的图像标注信息(XML文件) ├── ImageSets │ ├── Action 人的行为动作图像信息 │ ├── Layout 人的各个部位图像信息 │ │ │ ├── Main 目标检测分类图像信息 │ │ ├── train.txt 训练集(5717) │ │ ├── val.txt 验证集(5823) │ │ └── trainval.txt 训练集+验证集(11540) │ │ │ └── Segmentation 目标分割图像信息 │ ├── train.txt 训练集(1464) │ ├── val.txt 验证集(1449) │ └── trainval.txt 训练集+验证集(2913) │ ├── JPEGImages 所有图像文件 ├── SegmentationClass 语义分割png图(基于类别) └── SegmentationObject 实例分割png图(基于目标)
数据集包含物体检测和语义分割,我们只需要语义分割的数据集,所以可以考虑把多余的图片删除,删除的思路:
1、获取所有图片的name。
2、获取所有语义分割mask的name。
3、求二者的差集,然后将差集的name删除。
代码如下:
import glob import os image_all = glob.glob('data/VOCdevkit/VOC2012/JPEGImages/*.jpg') image_all_name = [image_file.replace('\\', '/').split('/')[-1].split('.')[0] for image_file in image_all] image_SegmentationClass = glob.glob('data/VOCdevkit/VOC2012/SegmentationClass/*.png') image_se_name= [image_file.replace('\\', '/').split('/')[-1].split('.')[0] for image_file in image_SegmentationClass] image_other=list(set(image_all_name) - set(image_se_name)) print(image_other) for image_name in image_other: os.remove('data/VOCdevkit/VOC2012/JPEGImages/{}.jpg'.format(image_name))
代码链接
本例选用的代码来自deep-learning-for-image-processing/pytorch_segmentation/fcn at master · WZMIAOMIAO/deep-learning-for-image-processing (github.com)
其他的代码也有很多,这篇比较好理解!
其实还有个比较好的图像分割库:https://github.com/qubvel/segmentation_models.pytorch
这个图像分割集合由俄罗斯的程序员小哥Pavel Yakubovskiy一手打造。在后面的文章,我也会使用这个库演示。
项目结构
├── src: 模型的backbone以及FCN的搭建 ├── train_utils: 训练、验证以及多GPU训练相关模块 ├── my_dataset.py: 自定义dataset用于读取VOC数据集 ├── train.py: 以fcn_resnet50(这里使用了Dilated/Atrous Convolution)进行训练 ├── predict.py: 简易的预测脚本,使用训练好的权重进行预测测试 ├── validation.py: 利用训练好的权重验证/测试数据的mIoU等指标,并生成record_mAP.txt文件 └── pascal_voc_classes.json: pascal_voc标签文件
由于代码很多不能一一讲解,所以,接下来对重要的代码做剖析。
自定义数据集读取
my_dataset.py自定义数据读取的方法,代码如下:
import os import torch.utils.data as data from PIL import Image class VOCSegmentation(data.Dataset): def __init__(self, voc_root, year="2012", transforms=None, txt_name: str = "train.txt"): super(VOCSegmentation, self).__init__() assert year in ["2007", "2012"], "year must be in ['2007', '2012']" root = os.path.join(voc_root, "VOCdevkit", f"VOC{year}") root=root.replace('\\','/') assert os.path.exists(root), "path '{}' does not exist.".format(root) image_dir = os.path.join(root, 'JPEGImages') mask_dir = os.path.join(root, 'SegmentationClass') txt_path = os.path.join(root, "ImageSets", "Segmentation", txt_name) txt_path=txt_path.replace('\\','/') assert os.path.exists(txt_path), "file '{}' does not exist.".format(txt_path) with open(os.path.join(txt_path), "r") as f: file_names = [x.strip() for x in f.readlines() if len(x.strip()) > 0] self.images = [os.path.join(image_dir, x + ".jpg") for x in file_names] self.masks = [os.path.join(mask_dir, x + ".png") for x in file_names] assert (len(self.images) == len(self.masks)) self.transforms = transforms
导入需要的包。
定义VOC数据集读取类VOCSegmentation。在init方法中,核心是读取image列表和mask列表。
def __getitem__(self, index): img = Image.open(self.images[index]).convert('RGB') target = Image.open(self.masks[index]) if self.transforms is not None: img, target = self.transforms(img, target) return img, target
__getitem__方法是获取单张图片和图片对应的mask,然后对其做数据增强。
def collate_fn(batch): images, targets = list(zip(*batch)) batched_imgs = cat_list(images, fill_value=0) batched_targets = cat_list(targets, fill_value=255) return batched_imgs, batched_targets
collate_fn方法是对一个batch中数据调用cat_list做数据对齐。
在train.py中torch.utils.data.DataLoader调用
train_loader = torch.utils.data.DataLoader(train_dataset, batch_size=batch_size, num_workers=num_workers, shuffle=True, pin_memory=True, collate_fn=train_dataset.collate_fn) val_loader = torch.utils.data.DataLoader(val_dataset, batch_size=1, num_workers=num_workers, pin_memory=True, collate_fn=val_dataset.collate_fn)
训练
重要参数
打开train.py,我们先认识一下重要的参数:
def parse_args(): import argparse parser = argparse.ArgumentParser(description="pytorch fcn training") # 数据集的根目录(VOCdevkit)所在的文件夹 parser.add_argument("--data-path", default="data/", help="VOCdevkit root") parser.add_argument("--num-classes", default=20, type=int) parser.add_argument("--aux", default=True, type=bool, help="auxilier loss") parser.add_argument("--device", default="cuda", help="training device") parser.add_argument("-b", "--batch-size", default=32, type=int) parser.add_argument("--epochs", default=30, type=int, metavar="N", help="number of total epochs to train") parser.add_argument('--lr', default=0.0001, type=float, help='initial learning rate') parser.add_argument('--momentum', default=0.9, type=float, metavar='M', help='momentum') parser.add_argument('--wd', '--weight-decay', default=1e-4, type=float, metavar='W', help='weight decay (default: 1e-4)', dest='weight_decay') parser.add_argument('--print-freq', default=10, type=int, help='print frequency') parser.add_argument('--resume', default='', help='resume from checkpoint') parser.add_argument('--start-epoch', default=0, type=int, metavar='N', help='start epoch') # 是否使用混合精度训练 parser.add_argument("--amp", default=False, type=bool, help="Use torch.cuda.amp for mixed precision training") args = parser.parse_args() return args
data-path:定义数据集的根目录(VOCdevkit)所在的文件夹
num-classes:检测目标类别数(不包含背景)。
aux:是否使用aux_classifier。
device:使用cpu还是gpu训练,默认是cuda。
batch-size:BatchSize设置。
epochs:epoch的个数。
lr:学习率。
resume:继续训练时候,选择用的模型。
start-epoch:起始的epoch,针对再次训练时,可以不需要从0开始。
amp:是否使用torch的自动混合精度训练。
数据增强
增强调用transforms.py中的方法。
训练集的增强如下:
class SegmentationPresetTrain: def __init__(self, base_size, crop_size, hflip_prob=0.5, mean=(0.485, 0.456, 0.406), std=(0.229, 0.224, 0.225)): # 随机Resize的最小尺寸 min_size = int(0.5 * base_size) # 随机Resize的最大尺寸 max_size = int(2.0 * base_size) # 随机Resize增强。 trans = [T.RandomResize(min_size, max_size)] if hflip_prob > 0: #随机水平翻转 trans.append(T.RandomHorizontalFlip(hflip_prob)) trans.extend([ #随机裁剪 T.RandomCrop(crop_size), T.ToTensor(), T.Normalize(mean=mean, std=std), ]) self.transforms = T.Compose(trans) def __call__(self, img, target): return self.transforms(img, target)
训练集增强,包括随机Resize、随机水平翻转、随即裁剪。
验证集增强:
class SegmentationPresetEval: def __init__(self, base_size, mean=(0.485, 0.456, 0.406), std=(0.229, 0.224, 0.225)): self.transforms = T.Compose([ T.RandomResize(base_size, base_size), T.ToTensor(), T.Normalize(mean=mean, std=std), ]) def __call__(self, img, target): return self.transforms(img, target)
验证集的增强比较简单,只有随机Resize。
Main方法
对Main方法,我做了一些修改,修改的代码如下:
#定义模型,并加载预训练 model = fcn_resnet50(pretrained=True) # 默认classes是21,如果不是21,则要修改类别。 if num_classes != 21: model.classifier[4] = torch.nn.Conv2d(512, num_classes, kernel_size=(1, 1), stride=(1, 1)) model.aux_classifier[4] = torch.nn.Conv2d(256, num_classes, kernel_size=(1, 1), stride=(1, 1)) print(model) model.to(device) # 如果有多张显卡,则使用多张显卡 if torch.cuda.device_count() > 1: print("Let's use", torch.cuda.device_count(), "GPUs!") model = torch.nn.DataParallel(model)
模型,我改为pytorch官方的模型了,如果能使用官方的模型尽量使用官方的模型。
默认类别是21,如果不是21,则要修改类别。
检测系统中是否有多张卡,如果有多张卡则使用多张卡不能浪费资源。
如果不想使用所有的卡,而是指定其中的几张卡,可以使用:
os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0,1'
也可以在DataParallel方法中设定:
model = torch.nn.DataParallel(model,device_ids=[0,1])
如果使用了多显卡,再使用模型的参数就需要改为model.module.xxx,例如:
params = [p for p in model.module.aux_classifier.parameters() if p.requires_grad] params_to_optimize.append({"params": params, "lr": args.lr * 10})
上面的都完成了就可以开始训练了,如下图:
测试
在开始测试之前,我们还要获取到调色板,新建脚本get_palette.py,代码如下:
import json import numpy as np from PIL import Image # 读取mask标签 target = Image.open("./2007_001288.png") # 获取调色板 palette = target.getpalette() palette = np.reshape(palette, (-1, 3)).tolist() print(palette) # 转换成字典子形式 pd = dict((i, color) for i, color in enumerate(palette)) json_str = json.dumps(pd) with open("palette.json", "w") as f: f.write(json_str)
选取一张mask,然后使用getpalette方法获取,然后将其转为字典的格式保存。
接下来,开始预测部分,新建predict.py,插入以下代码:
import os import time import json import torch from torchvision import transforms import numpy as np from PIL import Image from torchvision.models.segmentation import fcn_resnet50
导入程序需要的包文件,然在mian方法中:
def main(): aux = False # inference time not need aux_classifier classes = 20 weights_path = "./save_weights/model_5.pth" img_path = "./2007_000123.jpg" palette_path = "./palette.json" assert os.path.exists(weights_path), f"weights {weights_path} not found." assert os.path.exists(img_path), f"image {img_path} not found." assert os.path.exists(palette_path), f"palette {palette_path} not found." with open(palette_path, "rb") as f: pallette_dict = json.load(f) pallette = [] for v in pallette_dict.values(): pallette += v
- 定义是否需要aux_classifier,预测不需要aux_classifier,所以设置为False。
- 设置类别为20,不包括背景。
- 定义权重的路径。
- 定义调色板的路径。
- 读去调色板。
接下来,是加载模型,单显卡训练出来的模型和多显卡训练出来的模型加载有区别,我们先看单显卡训练出来的模型如何加载。
model = fcn_resnet50(num_classes=classes+1) print(model) # 单显卡训练出来的模型,加载 # delete weights about aux_classifier weights_dict = torch.load(weights_path, map_location='cpu')['model'] for k in list(weights_dict.keys()): if "aux_classifier" in k: del weights_dict[k] # load weights model.load_state_dict(weights_dict) model.to(device)
定义模型fcn_resnet50,num_classes设置为类别+1(背景)
加载训练好的模型,并将aux_classifier删除。
然后加载权重。
再看多显卡的模型如何加载
# create model model = fcn_resnet50(num_classes=classes+1) model = torch.nn.DataParallel(model) # delete weights about aux_classifier weights_dict = torch.load(weights_path, map_location='cpu')['model'] print(weights_dict) for k in list(weights_dict.keys()): if "aux_classifier" in k: del weights_dict[k] # load weights model.load_state_dict(weights_dict) model=model.module model.to(device)
定义模型fcn_resnet50,num_classes设置为类别+1(背景),将模型放入DataParallel类中。
加载训练好的模型,并将aux_classifier删除。
加载权重。
执行torch.nn.DataParallel(model)时,model被放在了model.module,所以model.module才真正需要的模型。所以我们在这里将model.module赋值给model。
接下来是图像数据的处理
# load image original_img = Image.open(img_path) # from pil image to tensor and normalize data_transform = transforms.Compose([transforms.Resize(520), transforms.ToTensor(), transforms.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406), std=(0.229, 0.224, 0.225))]) img = data_transform(original_img) # expand batch dimension img = torch.unsqueeze(img, dim=0)
加载图像。
对图像做Resize、标准化、归一化处理。
使用torch.unsqueeze增加一个维度。
完成图像的处理后,就可以开始预测了。
model.eval() # 进入验证模式 with torch.no_grad(): # init model img_height, img_width = img.shape[-2:] init_img = torch.zeros((1, 3, img_height, img_width), device=device) model(init_img) t_start = time_synchronized() output = model(img.to(device)) t_end = time_synchronized() print("inference+NMS time: {}".format(t_end - t_start)) prediction = output['out'].argmax(1).squeeze(0) prediction = prediction.to("cpu").numpy().astype(np.uint8) np.set_printoptions(threshold=sys.maxsize) print(prediction.shape) mask = Image.fromarray(prediction) mask.putpalette(pallette) mask.save("test_result.png")
将预测后的结果保存到test_result.png中。查看运行结果:
原图:
结果:
打印出来的数据:
类别列表:
{ "aeroplane": 1, "bicycle": 2, "bird": 3, "boat": 4, "bottle": 5, "bus": 6, "car": 7, "cat": 8, "chair": 9, "cow": 10, "diningtable": 11, "dog": 12, "horse": 13, "motorbike": 14, "person": 15, "pottedplant": 16, "sheep": 17, "sofa": 18, "train": 19, "tvmonitor": 20 }
从结果来看,已经预测出来图像上的类别是“train”。
总结
这篇文章的核心内容是讲解如何使用FCN实现图像的语义分割。
在文章的开始,我们讲了一些FCN的结构和优缺点。然后,讲解了如何读取数据集。接下来,告诉大家如何实现训练。最后,是测试以及结果展示。希望本文能给大家带来帮助。
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