生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年,著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图,可见3D技术在很多领域都是发展方向。
使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型,效果如下:
当然简单的呈现DNA分子结构,仅仅是一部分功能,如果将mono和专业的DNA分析仪结合,不仅可以发现病症,更重要的是预测病症的发生,治病于未发,这将是人类的福音。除了研究人类基因之外,我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化,并加以分析,对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。
使用mono创建3D模型最大的特点就是快,代码不过几十行,使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现,核心代码如下:
function createDNA(box, x, y, z, colors){ var count=20+Math.random()*50; var dist=50; var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,'red'); for(var i=0;i<count;i++){ var angle=Math.PI*2/360*15*i; var radius = (i % 2==0) ? 10 : 7; var color = colors[i%2] var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color); var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color); node1.setParent(parent); node2.setParent(parent); if(i % 2==0){ var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray'); var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle, 'cyan'); var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle, 'cyan'); link.setParent(parent); node3.setParent(parent); node4.setParent(parent); } } parent.setPosition(x,y,z); parent.setStyle('m.visible',false); return parent; }