Linux系统时钟同步
在Windwos中，系统时间的设置很简单，界面操作，通俗易懂，而且设置后，重启，关机都没关系。系统时间会自动保存在BIOS时钟里面，启动计算机的时候，系统会自动在BIOS里面取硬件时间，以保证时间的不间断。但在Linux下，默认情况下，系统时间和硬件时间并不会自动同步。在Linux运行过程中，系统时间和硬件时间以异步的方式运行，互不干扰。硬件时间的运行，是靠BIOS电池来维持，而系统时间，是用CPU Tick来维持的。在系统开机的时候，会自动从BIOS中取得硬件时间，设置为系统时间。
1. Linux系统时间的设置
在Linux中设置系统时间，可以用date命令：
1 //查看时间
2 [root@node1 ~]# date
3 Tue Feb 25 20:15:18 CST 2014
4 //修改时间
5 [root@node1 ~]# date -s "20140225 20:16:00" #yyyymmdd hh:mm:ss
6 Tue Feb 25 20:16:00 CST 2014
7 //date 有多种时间格式可接受，查看date --help
2. Linux硬件时间的设置
硬件时间的设置，可以用hwclock或者clock命令。两者基本相同，只用一个就行，只不过clock命令除了支持x86硬件体系外，还支持Alpha硬件体系。
1 //查看硬件时间可以是用hwclock ，hwclock --show 或者 hwclock -r
2 [root@node1 ~]# hwclock --show
3 Tue 25 Feb 2014 08:21:14 PM CST -0.327068 seconds
4 //设置硬件时间
5 [root@node1 ~]# hwclock --set --date "20140225 20:23:00"
6 [root@node1 ~]# hwclock
7 Tue 25 Feb 2014 08:23:04 PM CST -0.750440 seconds
3. 系统时间和硬件时间的同步
同步系统时间和硬件时间，可以使用hwclock命令。
1 //以系统时间为基准，修改硬件时间
2 [root@node1 ~]# hwclock --systohc <== sys（系统时间）to（写到）hc（Hard Clock）
3 //或者
4 [root@node1 ~]# hwclock -w
5 //以硬件时间为基准，修改系统时间
6 [root@node1 ~]# hwclock --hctosys
7 //或者
8 [root@node1 ~]# hwclock -s
4. 不同机器之间的时间同步
为了避免主机时间因为长期运行下所导致的时间偏差，进行时间同步（synchronize）的工作是非常必要的。Linux系统下，一般使用ntp服务器来同步不同机器的时间。一台机器，可以同时是ntp服务端和ntp客户端。在生产系统中，推荐使用像DNS服务器一样分层的时间服务器来同步时间。
不同机器间同步时间，可以使用ntpdate命令，也可以使用ntpd服务。
4.1 ntpdate命令
使用ntpdate比较简单。格式如下：
1 [root@node1 ~]# ntpdate [NTP IP/hostname]
2 [root@node1 ~]# ntpdate 192.168.0.1
3 [root@node1 ~]# ntpdate time.ntp.org但这样的同步，只是强制性的将系统时间设置为ntp服务器时间。如果CPU Tick有问题，只是治标不治本。所以，一般配合cron命令，来进行定期同步设置。比如，在crontab中添加：
0 12 * * * /usr/sbin/ntpdate 192.168.0.1这样，会在每天的12点整，同步一次时间。ntp服务器为192.168.0.1。
或者将下列脚本添加到/etc/cron.hourly/，这样就每小时会执行一次同步：
#!/bin/bash
#
# $Id: sync-clock,v 1.6 2009/12/23 15:41:29 jmates Exp $
#
# Use ntpdate to get rough clock sync with department of Genome Sciences
# time server.
NTPDATE=/usr/sbin/ntpdate
SERVER="192.168.0.1 "
# if running from cron (no tty available), sleep a bit to space
# out update requests to avoid slamming a server at a particular time
if ! test -t 0; then
MYRAND=$RANDOM
MYRAND=${MYRAND:=$$}
if [ $MYRAND -gt 9 ]; then
sleep `echo $MYRAND | sed 's/.*\(..\)$/\1/' | sed 's/^0//'`
fi
fi
$NTPDATE -su $SERVER
# update hardware clock on Linux (RedHat?) systems
if [ -f /sbin/hwclock ]; then
/sbin/hwclock --systohc
fi
4.2 ntpd服务
使用ntpd服务，要好于ntpdate加cron的组合。因为，ntpdate同步时间会造成时间的突变和跳跃，对一些依赖时间的程序和服务会造成影响。比如sleep，timer等。而且ntpd服务可以在修正时间的同时，修正CPU Tick。因此理想的做法为，在开机的时候，使用ntpdate强制同步时间，在其他时候使用ntpd服务来同步时间。
要注意的是，ntpd 有一个自我保护的机制：如果本机与上源时间相差太大，ntpd 不会运行时间同步操作，所以新设置的时间服务器一定要先 ntpdate 从上源取得时间初值, 然后启动 ntpd服务。ntpd服务运行后，先是每64秒与上源NTP服务器同步一次，根据每次同步时测得的误差值经复杂计算逐步调整自己的时间，随着误差减小，逐步增加同步的间隔。每次跳动，都会重复这个调整的过程。
4.3. ntpd服务的设置
ntpd服务的相关设置文件如下：
（1）/etc/ntp.conf：这个是NTP daemon的主要设文件，也是 NTP 唯一的设定文件。
（2）/usr /share/zoneinfo/：在这个目录下的文件其实是规定了各主要时区的时间设定文件，例如北京地区的时区设定文件在 /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai 就是了。这个目录里面的文件与底下要谈的两个文件(clock 与localtime)是有关系的。
（3）/etc/sysconfig/clock：这个文件其实也不包含在NTP 的 daemon 当中，因为这个是 Linux 的主要时区设定文件。每次开机后，Linux 会自动的读取这个文件来设定自己系统所默认要显示的时间。
（4）/etc /localtime：这个文件就是"本地端的时间配置文件"。刚刚那个clock 文件里面规定了使用的时间设置文件(ZONE) 为 /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai ，所以说，这就是本地端的时间了，此时， Linux系统就会将Shanghai那个文件另存为一份 /etc/localtime文件，所以未来我们的时间显示就会以Beijing那个时间设定文件为准。
下面重点介绍 /etc/ntp.conf文件的设置。在 NTP Server 的设定上，建议不要对Internet 无限制的开放，尽量仅提供局域网内部的 Client 端联机进行网络校时。此外，NTP Server 总也是需要网络上面较为准确的主机来自行更新自己的时间啊，所以在我们的 NTP Server 上面也要找一部最靠近自己的 Time Server 来进行自我校正。事实上， NTP 这个服务也是 Server/Client 的一种模式。
[root@linux ~]# vi /etc/ntp.conf
# 1. 关于权限设定部分
# 权限的设定主要以 restrict 这个参数来设定，主要的语法为：
# restrict IP mask netmask_IP parameter
# 其中 IP 可以是软件地址，也可以是 default ，default 就类似 0.0.0.0
# 至于 paramter 则有：
# ignore ：关闭所有的 NTP 联机服务
# nomodify：表示 Client 端不能更改 Server 端的时间参数，不过Client 端仍然可以透过 Server 端来进行网络校时。
# notrust ：该 Client 除非通过认证，否则该 Client 来源将被视为不信任网域
# noquery ：不提供 Client 端的时间查询
# notrap ：不提供trap这个远程事件登入
# 如果 paramter 完全没有设定，那就表示该 IP (或网域)"没有任何限制"
restrict default nomodify notrap noquery # 关闭所有的 NTP 要求封包
restrict 127.0.0.1 #这是允许本机查询
restrict 192.168.0.1 mask 255.255.255.0 nomodify
#在192.168.0.1/24网段内的服务器就可以通过这台NTP Server进行时间同步了
# 2. 上层主机的设定
# 要设定上层主机主要以 server 这个参数来设定，语法为：
# server [IP|HOST Name] [prefer]
# Server 后面接的就是上层 Time Server，而如果 Server 参数
# 后面加上 perfer 的话，那表示我们的 NTP 主机主要以该部主机来
# 作为时间校正的对应。另外，为了解决更新时间封包的传送延迟动作，
# 所以可以使用 driftfile 来规定我们的主机
# 在与 Time Server 沟通时所花费的时间，可以记录在 driftfile
# 后面接的文件内，例如下面的范例中，我们的 NTP server 与
# cn.pool.ntp.org联机时所花费的时间会记录在 /etc/ntp/drift文件内
server 0.pool.ntp.org
server 1.pool.ntp.org
server 2.pool.ntp.org
server cn.pool.ntp.org prefer
#其他设置值，以系统默认值即可
server 127.127.1.0 # local clock
fudge 127.127.1.0 stratum 10
driftfile /var/lib/ntp/drift
broadcastdelay 0.008
keys /etc/ntp/keys
总结一下，restrict用来设置访问权限，server用来设置上层时间服务器，driftfile用来设置保存漂移时间的文件。
4.4 ntpd服务的启动与查询
在启动NTP服务前，先对提供服务的这台主机手动的校正一次时间（因为启动服务器，端口会被服务端占用，就不能手动同步时间了）。
[root@node1 ~]# ntpdate cn.pool.ntp.org
25 Feb 21:10:52 ntpdate[9549]: adjust time server 202.112.31.197 offset 0.000101 sec然后，启动ntpd服务：
[root@node1 ~]# /etc/init.d/ntpd start
Starting ntpd: [ OK ]
[root@node1 ~]# date
Tue Feb 25 21:11:07 CST 2014查看端口（ntpd服务使用UDP的123端口）：
[root@node1 ~]# netstat -ln |grep :123
udp 0 0 12.12.12.100:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 192.168.0.100:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 172.18.226.174:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 10.10.10.100:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 127.0.0.1:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 0.0.0.0:123 0.0.0.0:*
udp 0 0 fe80::225:90ff:fe98:61ff:123 :::*
udp 0 0 fe80::225:90ff:fe98:61fe:123 :::*
udp 0 0 fe80::202:c903:1b:afa1:123 :::*
udp 0 0 ::1:123 :::*
udp 0 0 :::123 :::*
如何确认我们的NTP服务器已经更新了自己的时间呢？
[root@node1 ~]# ntpstat
synchronised to NTP server (202.120.2.101) at stratum 4
time correct to within 557 ms
polling server every 64 s
# 该指令可列出NTP服务器是否与上层联机。由上述输出结果可知，时间校正约
# 为557*10(-6)秒，且每隔64秒会主动更新时间。
常见的错误：
unsynchronized time server re-starting polling server every 64 s
// 或者
25 Apr 15:30:17 ntpdate[11520]: no server suitable for synchronization found其实，这不是一个错误。而是由于每次重启NTP服务器之后大约要3－5分钟客户端才能与server建立正常的通讯连接。当此时用客户端连接服务端就会报这样的信息。一般等待几分钟就可以了。
[root@node1 ~] # ntptrace –n
127.0.0.1:stratum 11, offset 0.000000，synch distance 0.950951
222.73.214.125：stratum 2，offset –0.000787，synch distance 0.108575
209.81.9.7:stratum 1，offset 0.000028，synch distance 0.00436，refid 'GPS'
# 这个指令可以列出目前NTP服务器（第一层）与上层NTP服务器（第二层）
# 彼此之间的关系，注意：该命令需要安装ntp-perl包
ntpq命令：
[root@node1 ~]# ntpq -p
指令"ntpq -p"可以列出目前我们的NTP与相关的上层NTP的状态，以上的几个字段的意义如下：
remote：即NTP主机的IP或主机名称。注意最左边的符号，如果由"+"则代表目前正在作用钟的上层NTP，如果是"*"则表示也有连上线，不过是作为次要联机的NTP主机。
refid：参考的上一层NTP主机的地址
st：即stratum阶层
when：几秒前曾做过时间同步更新的操作
poll：下次更新在几秒之后
reach：已经向上层NTP服务器要求更新的次数
delay：网络传输过程钟延迟的时间
offset：时间补偿的结果
jitter：Linux系统时间与BIOS硬件时间的差异时间
最后提及一点，ntp服务默认只会同步系统时间。如果想要让ntp同时同步硬件时间，可以设置/etc/sysconfig/ntpd 文件。
在/etc/sysconfig/ntpd文件中，添加 SYNC_HWCLOCK=yes 这样，就可以让硬件时间与系统时间一起同步。
5. HPC集群中时间同步示例
5.1 集群环境简介
管理节点：192.168.0.100，192.168.0.101
计算节点：192.168.0.1~192.168.0.50
I/O节点：192.168.0.51~192.168.0.54
Internet NTP服务器：cn.pool.ntp.org
5.2 时间同步方案设计
图 1 NTP时间同步方案设计
方案详细解释：
（1）管理节点1作为主NTP服务器，跟互联网NTP服务器进行时间同步；管理节点2作为备用NTP服务器，也跟互联网NTP服务器进行时间同步。两个管理节点做Heartbeat，设置一个漂移IP地址192.168.0.103，并对ntpd服务进行双机高可用；
（2）集群计算节点和IO节点，跟管理节点的虚拟IP地址192.168.0.103通过ntpd服务做时间同步；
（3）所有节点，在ntp时间同步的同时，设置硬件时间跟系统时间一致；
（4）所有计算节点和IO节点开机时，通过ntpdate跟192.168.0.103进行时间同步，然后再开启ntpd服务。
6.linux时钟同步步骤与故障排查
（1）设置时区
linux系统的timezone文件, 他们放在/usr/share/zoneinfo这个目录下,基本涵盖了大部分的国家和城市.
zdump Hongkong #该命令可以查询每个time zone当前的时间；
cp /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai /etc/localtimezone #将上海时区复制到linux系统的时区目录下
ln -sf /usr/share/zoneinfo/posix/Asia/Shanghai /etc/localtime #启用上海时区
date #使用date命令可查询到时区是否已改变
（2）linux的客户端与ntp服务器能相互ping通
如果客户端和ntp服务器的设备不能直接通信（或者不在同一个网段），则需要在客户端和服务器端分别添加路由。（例：ntp服务器为windows系统，ip为10.15.129.2；客户端为linux系统设备，网关为10.10.5.254，我们分别在windows和linux系统添加如下路由，直到S-N间能相互ping通）
route -p add 10.10.5.254 mask 255.255.255.0 10.15.129.2
sudo route add -net 10.15.129.0/28 gw 10.10.5.254
（3）编辑etc目录下的ntp.conf文件（如有一些特殊同步需要也可以使用crontab -e命令按4.1步骤来进行同步时间的编辑和设置）
在文件的末尾，写上ntp server的ip，如
server 10.15.129.2 perfer #设置ntp时钟同步的server
（4）使用ntp相关的同步命令进行时间同步
service ntpd start #启动ntpd服务守护进程
service ntpd stop #停止ntpd服务守护进程
ntpd –q -g #和ntp服务器同步时钟
date #查询当前时间
-----------------------------------
相关状态查询命令
ntpq -p #查看网络中的NTP服务器，同时显示客户端和每个服务器的关系
ntpstat #查看时间同步状态
（5）故障排查
一般linux时钟同步比较常见的故报错是: no server suitable for synchronization found
综合网上的文章与实际情况，在客户端与服务器端不同步且使用ntpdate -d或者ntpdate -u 10.15.129.2同步时上述报错，大概有四种下列原因：
报错行中有Server dropped: no data的情况
1.可能时ntp安装包的版本问题，可查询版本，如果不对，重新下载并安装4.2之前的版本。
ntpq -c version #查询ntp的版本
2.检查ntp server的防火墙。可能是server的防火墙屏蔽了upd 123端口。
service iptables stop #关闭防火墙
3.检查客户端和服务器端是否能相互ping通
报错行中有Server dropped: Strata too high的情况
1.可能是ntp服务器端未同步所致
在ntp客户端用ntpdate –d serverIP查看，发现有“Server dropped: strata too high”的错误，并且显示“stratum 16”。而正常情况下stratum这个值得范围是“0~15”。
可能是NTP server还没有和其自身或者它的server同步上。
下面代码的定义是让NTP Server和其自身保持同步，如果在/ntp.conf中定义的server都不可用时，将使用local时间作为ntp服务提供给ntp客户端。
server 127.127.1.0 fudge
127.127.1.0 stratum 10