决策树是一种基于树结构来进行决策的分类算法,我们希望从给定的训练数据集学得一个模型(即决策树),用该模型对新样本分类。决策树可以非常直观展现分类的过程和结果,一旦模型构建成功,对新样本的分类效率也相当高。
最经典的决策树算法有ID3、C4.5、CART,其中ID3算法是最早被提出的,它可以处理离散属性样本的分类,C4.5和CART算法则可以处理更加复杂的分类问题。使用算法ID3, C4.5和C5.0生成树算法使用熵。这一度量是基于信息学理论中熵的概念。
分类树(决策树)是一种十分常用的分类方法。它是一种监督学习,所谓监督学习就是给定一堆样本,每个样本都有一组属性和一个类别,这些类别是事先确定的,那么通过学习得到一个分类器,这个分类器能够对新出现的对象给出正确的分类。这样的机器学习就被称之为监督学习。
下面,我们就对以下表格中的西瓜样本构建决策树模型。
色泽 | 根蒂 | 敲声 | 纹理 | 脐部 | 触感 | 好瓜 |
---|---|---|---|---|---|---|
青绿 | 蜷缩 | 浊响 | 清晰 | 凹陷 | 硬滑 | 是 |
乌黑 | 蜷缩 | 沉闷 | 清晰 | 凹陷 | 硬滑 | 是 |
乌黑 | 蜷缩 | 浊响 | 清晰 | 凹陷 | 硬滑 | 是 |
青绿 | 蜷缩 | 沉闷 | 清晰 | 凹陷 | 硬滑 | 是 |
浅白 | 蜷缩 | 浊响 | 清晰 | 凹陷 | 硬滑 | 是 |
青绿 | 稍蜷 | 浊响 | 清晰 | 稍凹 | 软粘 | 是 |
乌黑 | 稍蜷 | 浊响 | 稍糊 | 稍凹 | 软粘 | 是 |
乌黑 | 稍蜷 | 浊响 | 清晰 | 稍凹 | 硬滑 | 是 |
乌黑 | 稍蜷 | 沉闷 | 稍糊 | 稍凹 | 硬滑 | 否 |
青绿 | 硬挺 | 清脆 | 清晰 | 平坦 | 软粘 | 否 |
浅白 | 硬挺 | 清脆 | 模糊 | 平坦 | 硬滑 | 否 |
浅白 | 蜷缩 | 浊响 | 模糊 | 平坦 | 软粘 | 否 |
青绿 | 稍蜷 | 浊响 | 稍糊 | 凹陷 | 硬滑 | 否 |
浅白 | 稍蜷 | 沉闷 | 稍糊 | 凹陷 | 硬滑 | 否 |
乌黑 | 稍蜷 | 浊响 | 清晰 | 稍凹 | 软粘 | 否 |
浅白 | 蜷缩 | 浊响 | 模糊 | 平坦 | 硬滑 | 否 |
青绿 | 蜷缩 | 沉闷 | 稍糊 | 稍凹 | 硬滑 | 否 |
样本有多个属性,该先选哪个样本来划分数据集呢?原则是随着划分不断进行,我们希望决策树的分支节点所包含的样本尽可能属于同一分类,即“纯度”越来越高。
#导入模块
import numpy as np
import pandas as pd
import math
import collections
def import_data():
data = pd.read_csv('..watermelon.txt')
data.head(10)
data=np.array(data).tolist()
# 特征值列表
labels = ['色泽', '根蒂', '敲击', '纹理', '脐部', '触感']
# 特征对应的所有可能的情况
labels_full = {}
for i in range(len(labels)):
labelList = [example[i] for example in data]
uniqueLabel = set(labelList)
labels_full[labels[i]] = uniqueLabel
return data,labels,labels_full
data,labels,labels_full=import_data()
def calcShannonEnt(dataSet):
"""
计算给定数据集的信息熵(香农熵)
:param dataSet:
:return:
"""
# 计算出数据集的总数
numEntries = len(dataSet)
# 用来统计标签
labelCounts = collections.defaultdict(int)
# 循环整个数据集,得到数据的分类标签
for featVec in dataSet:
# 得到当前的标签
currentLabel = featVec[-1]
# # 如果当前的标签不再标签集中,就添加进去(书中的写法)
# if currentLabel not in labelCounts.keys():
# labelCounts[currentLabel] = 0
#
# # 标签集中的对应标签数目加一
# labelCounts[currentLabel] += 1
# 也可以写成如下
labelCounts[currentLabel] += 1
# 默认的信息熵
shannonEnt = 0.0
for key in labelCounts:
# 计算出当前分类标签占总标签的比例数
prob = float(labelCounts[key]) / numEntries
# 以2为底求对数
shannonEnt -= prob * math.log2(prob)
return shannonEnt
print(calcShannonEnt(data)) # 输出为:0.9975025463691153
def splitDataSet(dataSet, axis, value):
"""
按照给定的特征值,将数据集划分
:param dataSet: 数据集
:param axis: 给定特征值的坐标
:param value: 给定特征值满足的条件,只有给定特征值等于这个value的时候才会返回
:return:
"""
# 创建一个新的列表,防止对原来的列表进行修改
retDataSet = []
# 遍历整个数据集
for featVec in dataSet:
# 如果给定特征值等于想要的特征值
if featVec[axis] == value:
# 将该特征值前面的内容保存起来
reducedFeatVec = featVec[:axis]
# 将该特征值后面的内容保存起来,所以将给定特征值给去掉了
reducedFeatVec.extend(featVec[axis + 1:])
# 添加到返回列表中
retDataSet.append(reducedFeatVec)
return retDataSet
def chooseBestFeatureToSplit(dataSet, labels):
"""
选择最好的数据集划分特征,根据信息增益值来计算
:param dataSet:
:return:
"""
# 得到数据的特征值总数
numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
# 计算出基础信息熵
baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
# 基础信息增益为0.0
bestInfoGain = 0.0
# 最好的特征值
bestFeature = -1
# 对每个特征值进行求信息熵
for i in range(numFeatures):
# 得到数据集中所有的当前特征值列表
featList = [example[i] for example in dataSet]
# 将当前特征唯一化,也就是说当前特征值中共有多少种
uniqueVals = set(featList)
# 新的熵,代表当前特征值的熵
newEntropy = 0.0
# 遍历现在有的特征的可能性
for value in uniqueVals:
# 在全部数据集的当前特征位置上,找到该特征值等于当前值的集合
subDataSet = splitDataSet(dataSet=dataSet, axis=i, value=value)
# 计算出权重
prob = len(subDataSet) / float(len(dataSet))
# 计算出当前特征值的熵
newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
# 计算出“信息增益”
infoGain = baseEntropy - newEntropy
#print('当前特征值为:' + labels[i] + ',对应的信息增益值为:' + str(infoGain)+"i等于"+str(i))
#如果当前的信息增益比原来的大
if infoGain > bestInfoGain:
# 最好的信息增益
bestInfoGain = infoGain
# 新的最好的用来划分的特征值
bestFeature = i
#print('信息增益最大的特征为:' + labels[bestFeature])
return bestFeature
def judgeEqualLabels(dataSet):
"""
判断数据集的各个属性集是否完全一致
:param dataSet:
:return:
"""
# 计算出样本集中共有多少个属性,最后一个为类别
feature_leng = len(dataSet[0]) - 1
# 计算出共有多少个数据
data_leng = len(dataSet)
# 标记每个属性中第一个属性值是什么
first_feature = ''
# 各个属性集是否完全一致
is_equal = True
# 遍历全部属性
for i in range(feature_leng):
# 得到第一个样本的第i个属性
first_feature = dataSet[0][i]
# 与样本集中所有的数据进行对比,看看在该属性上是否都一致
for _ in range(1, data_leng):
# 如果发现不相等的,则直接返回False
if first_feature != dataSet[_][i]:
return False
return is_equal
def createTree(dataSet, labels):
"""
创建决策树
:param dataSet: 数据集
:param labels: 特征标签
:return:
"""
# 拿到所有数据集的分类标签
classList = [example[-1] for example in dataSet]
# 统计第一个标签出现的次数,与总标签个数比较,如果相等则说明当前列表中全部都是一种标签,此时停止划分
if classList.count(classList[0]) == len(classList):
return classList[0]
# 计算第一行有多少个数据,如果只有一个的话说明所有的特征属性都遍历完了,剩下的一个就是类别标签,或者所有的样本在全部属性上都一致
if len(dataSet[0]) == 1 or judgeEqualLabels(dataSet):
# 返回剩下标签中出现次数较多的那个
return majorityCnt(classList)
# 选择最好的划分特征,得到该特征的下标
bestFeat = chooseBestFeatureToSplit(dataSet=dataSet, labels=labels)
print(bestFeat)
# 得到最好特征的名称
bestFeatLabel = labels[bestFeat]
print(bestFeatLabel)
# 使用一个字典来存储树结构,分叉处为划分的特征名称
myTree = {bestFeatLabel: {}}
# 将本次划分的特征值从列表中删除掉
del(labels[bestFeat])
# 得到当前特征标签的所有可能值
featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
# 唯一化,去掉重复的特征值
uniqueVals = set(featValues)
# 遍历所有的特征值
for value in uniqueVals:
# 得到剩下的特征标签
subLabels = labels[:]
subTree = createTree(splitDataSet(dataSet=dataSet, axis=bestFeat, value=value), subLabels)
# 递归调用,将数据集中该特征等于当前特征值的所有数据划分到当前节点下,递归调用时需要先将当前的特征去除掉
myTree[bestFeatLabel][value] = subTree
return myTree
mytree=createTree(data,labels)
print(mytree)
import matplotlib.pylab as plt
import matplotlib
# 能够显示中文
matplotlib.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
matplotlib.rcParams['font.serif'] = ['SimHei']
# 分叉节点,也就是决策节点
decisionNode = dict(boxstyle="sawtooth", fc="0.8")
# 叶子节点
leafNode = dict(boxstyle="round4", fc="0.8")
# 箭头样式
arrow_args = dict(arrowstyle="<-")
def plotNode(nodeTxt, centerPt, parentPt, nodeType):
"""
绘制一个节点
:param nodeTxt: 描述该节点的文本信息
:param centerPt: 文本的坐标
:param parentPt: 点的坐标,这里也是指父节点的坐标
:param nodeType: 节点类型,分为叶子节点和决策节点
:return:
"""
createPlot.ax1.annotate(nodeTxt, xy=parentPt, xycoords='axes fraction',
xytext=centerPt, textcoords='axes fraction',
va="center", ha="center", bbox=nodeType, arrowprops=arrow_args)
def getNumLeafs(myTree):
"""
获取叶节点的数目
:param myTree:
:return:
"""
# 统计叶子节点的总数
numLeafs = 0
# 得到当前第一个key,也就是根节点
firstStr = list(myTree.keys())[0]
# 得到第一个key对应的内容
secondDict = myTree[firstStr]
# 递归遍历叶子节点
for key in secondDict.keys():
# 如果key对应的是一个字典,就递归调用
if type(secondDict[key]).__name__ == 'dict':
numLeafs += getNumLeafs(secondDict[key])
# 不是的话,说明此时是一个叶子节点
else:
numLeafs += 1
return numLeafs
def getTreeDepth(myTree):
"""
得到数的深度层数
:param myTree:
:return:
"""
# 用来保存最大层数
maxDepth = 0
# 得到根节点
firstStr = list(myTree.keys())[0]
# 得到key对应的内容
secondDic = myTree[firstStr]
# 遍历所有子节点
for key in secondDic.keys():
# 如果该节点是字典,就递归调用
if type(secondDic[key]).__name__ == 'dict':
# 子节点的深度加1
thisDepth = 1 + getTreeDepth(secondDic[key])
# 说明此时是叶子节点
else:
thisDepth = 1
# 替换最大层数
if thisDepth > maxDepth:
maxDepth = thisDepth
return maxDepth
def plotMidText(cntrPt, parentPt, txtString):
"""
计算出父节点和子节点的中间位置,填充信息
:param cntrPt: 子节点坐标
:param parentPt: 父节点坐标
:param txtString: 填充的文本信息
:return:
"""
# 计算x轴的中间位置
xMid = (parentPt[0]-cntrPt[0])/2.0 + cntrPt[0]
# 计算y轴的中间位置
yMid = (parentPt[1]-cntrPt[1])/2.0 + cntrPt[1]
# 进行绘制
createPlot.ax1.text(xMid, yMid, txtString)
def plotTree(myTree, parentPt, nodeTxt):
"""
绘制出树的所有节点,递归绘制
:param myTree: 树
:param parentPt: 父节点的坐标
:param nodeTxt: 节点的文本信息
:return:
"""
# 计算叶子节点数
numLeafs = getNumLeafs(myTree=myTree)
# 计算树的深度
depth = getTreeDepth(myTree=myTree)
# 得到根节点的信息内容
firstStr = list(myTree.keys())[0]
# 计算出当前根节点在所有子节点的中间坐标,也就是当前x轴的偏移量加上计算出来的根节点的中心位置作为x轴(比如说第一次:初始的x偏移量为:-1/2W,计算出来的根节点中心位置为:(1+W)/2W,相加得到:1/2),当前y轴偏移量作为y轴
cntrPt = (plotTree.xOff + (1.0 + float(numLeafs))/2.0/plotTree.totalW, plotTree.yOff)
# 绘制该节点与父节点的联系
plotMidText(cntrPt, parentPt, nodeTxt)
# 绘制该节点
plotNode(firstStr, cntrPt, parentPt, decisionNode)
# 得到当前根节点对应的子树
secondDict = myTree[firstStr]
# 计算出新的y轴偏移量,向下移动1/D,也就是下一层的绘制y轴
plotTree.yOff = plotTree.yOff - 1.0/plotTree.totalD
# 循环遍历所有的key
for key in secondDict.keys():
# 如果当前的key是字典的话,代表还有子树,则递归遍历
if isinstance(secondDict[key], dict):
plotTree(secondDict[key], cntrPt, str(key))
else:
# 计算新的x轴偏移量,也就是下个叶子绘制的x轴坐标向右移动了1/W
plotTree.xOff = plotTree.xOff + 1.0/plotTree.totalW
# 打开注释可以观察叶子节点的坐标变化
# print((plotTree.xOff, plotTree.yOff), secondDict[key])
# 绘制叶子节点
plotNode(secondDict[key], (plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, leafNode)
# 绘制叶子节点和父节点的中间连线内容
plotMidText((plotTree.xOff, plotTree.yOff), cntrPt, str(key))
# 返回递归之前,需要将y轴的偏移量增加,向上移动1/D,也就是返回去绘制上一层的y轴
plotTree.yOff = plotTree.yOff + 1.0/plotTree.totalD
def createPlot(inTree):
"""
需要绘制的决策树
:param inTree: 决策树字典
:return:
"""
# 创建一个图像
fig = plt.figure(1, facecolor='white')
fig.clf()
axprops = dict(xticks=[], yticks=[])
createPlot.ax1 = plt.subplot(111, frameon=False, **axprops)
# 计算出决策树的总宽度
plotTree.totalW = float(getNumLeafs(inTree))
# 计算出决策树的总深度
plotTree.totalD = float(getTreeDepth(inTree))
# 初始的x轴偏移量,也就是-1/2W,每次向右移动1/W,也就是第一个叶子节点绘制的x坐标为:1/2W,第二个:3/2W,第三个:5/2W,最后一个:(W-1)/2W
plotTree.xOff = -0.5/plotTree.totalW
# 初始的y轴偏移量,每次向下或者向上移动1/D
plotTree.yOff = 1.0
# 调用函数进行绘制节点图像
plotTree(inTree, (0.5, 1.0), '')
# 绘制
plt.show()
if __name__ == '__main__':
createPlot(mytree)
def makeTreeFull(myTree, labels_full, default):
"""
将树中的不存在的特征标签进行补全,补全为父节点中出现最多的类别
:param myTree: 生成的树
:param labels_full: 特征的全部标签
:param parentClass: 父节点中所含最多的类别
:param default: 如果缺失标签中父节点无法判断类别则使用该值
:return:
"""
# 这里所说的父节点就是当前根节点,把当前根节点下不存在的特征标签作为子节点
# 拿到当前的根节点
root_key = list(myTree.keys())[0]
# 拿到根节点下的所有分类,可能是子节点(好瓜or坏瓜)也可能不是子节点(再次划分的属性值)
sub_tree = myTree[root_key]
# 如果是叶子节点就结束
if isinstance(sub_tree, str):
return
# 找到使用当前节点分类下最多的种类,该分类结果作为新特征标签的分类,如:色泽下面没有浅白则用色泽中有的青绿分类作为浅白的分类
root_class = []
# 把已经分好类的结果记录下来
for sub_key in sub_tree.keys():
if isinstance(sub_tree[sub_key], str):
root_class.append(sub_tree[sub_key])
# 找到本层出现最多的类别,可能会出现相同的情况取其一
if len(root_class):
most_class = collections.Counter(root_class).most_common(1)[0][0]
else:
most_class = None# 当前节点下没有已经分类好的属性
# print(most_class)
# 循环遍历全部特征标签,将不存在标签添加进去
for label in labels_full[root_key]:
if label not in sub_tree.keys():
if most_class is not None:
sub_tree[label] = most_class
else:
sub_tree[label] = default
# 递归处理
for sub_key in sub_tree.keys():
if isinstance(sub_tree[sub_key], dict):
makeTreeFull(myTree=sub_tree[sub_key], labels_full=labels_full, default=default)
调用并再次绘制树
makeTreeFull(mytree,labels_full,default='未知')
createPlot(mytree)
# 导入包
import pandas as pd
from sklearn import tree
import graphviz
df = pd.read_csv('watermelon.txt')
df.head(10)
df['色泽']=df['色泽'].map({'浅白':1,'青绿':2,'乌黑':3})
df['根蒂']=df['根蒂'].map({'稍蜷':1,'蜷缩':2,'硬挺':3})
df['敲声']=df['敲声'].map({'清脆':1,'浊响':2,'沉闷':3})
df['纹理']=df['纹理'].map({'清晰':1,'稍糊':2,'模糊':3})
df['脐部']=df['脐部'].map({'平坦':1,'稍凹':2,'凹陷':3})
df['触感'] = np.where(df['触感']=="硬滑",1,2)
df['好瓜'] = np.where(df['好瓜']=="是",1,0)
x_train=df[['色泽','根蒂','敲声','纹理','脐部','触感']]
y_train=df['好瓜']
print(df)
id3=tree.DecisionTreeClassifier(criterion='entropy')
id3=id3.fit(x_train,y_train)
print(id3)
id3=tree.DecisionTreeClassifier(criterion='entropy')
id3=id3.fit(x_train,y_train)
labels = ['色泽', '根蒂', '敲击', '纹理', '脐部', '触感']
dot_data = tree.export_graphviz(id3
,feature_names=labels
,class_names=["好瓜","坏瓜"]
,filled=True
,rounded=True
)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
## 实现C4.5算法
def chooseBestFeatureToSplit_4(dataSet, labels):
"""
选择最好的数据集划分特征,根据信息增益值来计算
:param dataSet:
:return:
"""
# 得到数据的特征值总数
numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
# 计算出基础信息熵
baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
# 基础信息增益为0.0
bestInfoGain = 0.0
# 最好的特征值
bestFeature = -1
# 对每个特征值进行求信息熵
for i in range(numFeatures):
# 得到数据集中所有的当前特征值列表
featList = [example[i] for example in dataSet]
# 将当前特征唯一化,也就是说当前特征值中共有多少种
uniqueVals = set(featList)
# 新的熵,代表当前特征值的熵
newEntropy = 0.0
# 遍历现在有的特征的可能性
for value in uniqueVals:
# 在全部数据集的当前特征位置上,找到该特征值等于当前值的集合
subDataSet = splitDataSet(dataSet=dataSet, axis=i, value=value)
# 计算出权重
prob = len(subDataSet) / float(len(dataSet))
# 计算出当前特征值的熵
newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
# 计算出“信息增益”
infoGain = baseEntropy - newEntropy
infoGain = infoGain/newEntropy
#print('当前特征值为:' + labels[i] + ',对应的信息增益值为:' + str(infoGain)+"i等于"+str(i))
#如果当前的信息增益比原来的大
if infoGain > bestInfoGain:
# 最好的信息增益
bestInfoGain = infoGain
# 新的最好的用来划分的特征值
bestFeature = i
#print('信息增益最大的特征为:' + labels[bestFeature])
return bestFeature
def createTree_4(dataSet, labels):
"""
创建决策树
:param dataSet: 数据集
:param labels: 特征标签
:return:
"""
# 拿到所有数据集的分类标签
classList = [example[-1] for example in dataSet]
# 统计第一个标签出现的次数,与总标签个数比较,如果相等则说明当前列表中全部都是一种标签,此时停止划分
if classList.count(classList[0]) == len(classList):
return classList[0]
# 计算第一行有多少个数据,如果只有一个的话说明所有的特征属性都遍历完了,剩下的一个就是类别标签,或者所有的样本在全部属性上都一致
if len(dataSet[0]) == 1 or judgeEqualLabels(dataSet):
# 返回剩下标签中出现次数较多的那个
return majorityCnt(classList)
# 选择最好的划分特征,得到该特征的下标
bestFeat = chooseBestFeatureToSplit_4(dataSet=dataSet, labels=labels)
print(bestFeat)
# 得到最好特征的名称
bestFeatLabel = labels[bestFeat]
print(bestFeatLabel)
# 使用一个字典来存储树结构,分叉处为划分的特征名称
myTree = {bestFeatLabel: {}}
# 将本次划分的特征值从列表中删除掉
del(labels[bestFeat])
# 得到当前特征标签的所有可能值
featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
# 唯一化,去掉重复的特征值
uniqueVals = set(featValues)
# 遍历所有的特征值
for value in uniqueVals:
# 得到剩下的特征标签
subLabels = labels[:]
subTree = createTree(splitDataSet(dataSet=dataSet, axis=bestFeat, value=value), subLabels)
# 递归调用,将数据集中该特征等于当前特征值的所有数据划分到当前节点下,递归调用时需要先将当前的特征去除掉
myTree[bestFeatLabel][value] = subTree
return myTree
mytree_4=createTree_4(data,labels)
print(mytree_4)
makeTreeFull(mytree_4,labels_full,default='未知')
createPlot(mytree_4)
import pandas as pd
from sklearn import tree
import graphviz
df = pd.read_csv('watermelon.txt')
df.head(10)
df['色泽']=df['色泽'].map({'浅白':1,'青绿':2,'乌黑':3})
df['根蒂']=df['根蒂'].map({'稍蜷':1,'蜷缩':2,'硬挺':3})
df['敲声']=df['敲声'].map({'清脆':1,'浊响':2,'沉闷':3})
df['纹理']=df['纹理'].map({'清晰':1,'稍糊':2,'模糊':3})
df['脐部']=df['脐部'].map({'平坦':1,'稍凹':2,'凹陷':3})
df['触感'] = np.where(df['触感']=="硬滑",1,2)
df['好瓜'] = np.where(df['好瓜']=="是",1,0)
x_train=df[['色泽','根蒂','敲声','纹理','脐部','触感']]
y_train=df['好瓜']
# 构建模型并训练
labels = ['色泽', '根蒂', '敲击', '纹理', '脐部', '触感']
gini=tree.DecisionTreeClassifier()
gini=gini.fit(x_train,y_train)
#实现决策树的可视化
gini_data = tree.export_graphviz(gini
,feature_names=labels
,class_names=["好瓜","坏瓜"]
,filled=True
,rounded=True
)
gini_graph = graphviz.Source(gini_data)
gini_graph
决策树理解还是不难的,就是要清楚每种算法的划分依据,步骤大致是先计算评判标准,后面再根据评判结果排序,最后根据顺序来递归建树。
机器学习笔记(4)——ID3决策树算法及其Python实现
挑选西瓜(决策树实现)