文献管理

怎样高效地管理自己阅读过的文献资料？

woshicver 2020-05-09 21:35:22 1178 收藏 3
来源：https://www.zhihu.com/question/29395840

编辑：深度学习与计算机视觉

声明：仅做学术分享，侵删

看过的文献，放在电脑里，回过头再来找的时候就很麻烦，你是怎么高效管理自己阅读过的文献资料的，如果正在苦恼，可以看看其他小伙伴的经验。关于文献方面小编还整理过博士生如何进行文献阅读和文献整理？以及读文献都有哪些技巧？感兴趣的小伙伴可以看看。

作者：王力
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/44280867

由于工作需要，我们同事每天都需要检索、管理、阅读大量的文献（以下的讨论就不局限于医学类文献了，我觉得不管什么学科，管理文献的基本思路是一致，但是仍以医学类文献举例）。在开始介绍主体内容之前，先明确一下用户基本的文献管理“现状”或者说需求：

我觉得对于许多人来说，产生文献管理需求的时候都是手里已经有大量的文献储备了（多数以PDF格式居多）。在收集、积累文献一开始，没有意识到管理文献的需求，也就说没有顶层设计，文献存储不科学、杂乱无章，检索困难，利用困难。

许多现有的文献管理工具（软件）都有外部文献（或者文摘）导入模块，但是大多数只能做到导入和分类存储，不能很好的提取文献（特别是PDF文献）元数据。也就是说，文献即使导入了，在软件内也很难实现高效的检索。这是目前此类软件共有的软肋（这个问题牵涉的技术很多：有的软件厂商选择直接与学术出版商合作，拉取出版商的数据库后台补全文献的元数据；也有的厂商试图通过文摘数据库，例如生物医学领域的Pubmed、Biosis、Web of Science、Embase等等，补全文献信息（最常见！）；也有的技术实力比较强的，直接识别、抽取文献全文中的数据，也就是标题、作者、单位、关键词、基金、参考文献等等信息）

文献管理的目的是为了高效的利用。我见过一些小伙伴即使没有使用文献管理软件，文献的本地存储也做得“井井有条”——为啥子要打引号呢？因为我觉得他们实际是在追求形式上的满足感：文件夹套文件夹，一层又一层，数量够多时，花在思考“该把这篇文献扔在哪呢？”比阅读文献的时间还长。而且，对于涉及话题较多，维度多，信息量大的文献咋办？你很难把它限定在某一个子类下边——一维的、线性的文件夹式存储会直接限制一篇文献能给你带来的价值，因为你在分类的时候就已经下意识的把它切割、打磨，以便塞到你的分类体系中了。如何尽可能完全地榨取一篇文献的价值才是文献管理的最终目的。

（我发现这么写下去没完没了了~以后再补充吧。下边直奔主题，只谈谈我使用过的文献管理软件，当然也是偏医学类的）

Readcube。感兴趣的话，下载下来自己研究一下，目前是试用期30天免费。

Mendeley。之前和readcube一样，是个初创项目，2013年抱到了Elsevier的大腿（当时被骂成open access运动的叛徒），基本的功能是都有的，可以尝试，但是我觉得没什么亮点。

Endnote、Reference Manager、Refworks。Endnote大家都知道的，功能最全，最老牌，背靠汤森路透这棵大树，乘凉很容易啊。这三者都是收费的，而且价格“都对得起出身”~

Zotero。我没有尝试过，只是简略的看过，貌似主要是浏览器插件式的管理方式，对于在线发现、收集文献应该很方便。参照评论区@魚生臣和@chao meng的意见，后来发现Zotero是有Stand alone的版本的，可以安装在本地使用。

以上的软件貌似都有一个问题：对中文文献支持很差（除了土豪Endnote做的稍微好一点儿）。当然，如果你基本不读中文文献，无妨。

国内的医学文献王、Notefirst、Noteexpress等等。推荐第一个！基本版免费，各种功能几乎可以用应有尽有来形容，开发也很活跃。虽然叫医学文献王，但是用这个软件管理其他学科的文献也是可行的。另外，国产的还有CNKI的E-learning，也可以尝试尝试，这个软件似乎在知识管理方面着力较多。

总之，大的原则是：如果你意识到以后要在“阅读文献的道路上一去不复返”，莫不如一开始就对自己需要涉猎的文献进行顶层设计，不要等硬盘里乱成一锅粥了再开始：

检索（订阅）、收集、整理、阅读、标注、再利用等等——这个应该是管理使用文献的完整流程，从这几个角度去考虑如何设计自己的文献体系。

检索阶段，要做到熟悉自己领域常用数据库的检索技巧、数据结构。说的这么复杂，实际就是对数据库文献的元数据、组织形式做到心里有数（例如，文摘数据库一般都会提供标题、作者、期刊、摘要等信息）。实际文献管理软件在管理格式化的文摘（Abstract）方面是强项。直接向软件导入检索结果列表是最为高效的方式！真的需要看全文的话，再去获取全文。

收集。承接第一条，从大型文摘数据库获取文献是管理起来最为顺手的方式：不管是通过RSS订阅还是主动检索，都可以尝试——这个也可以算是主动、格式化地探究你感兴趣的话题的方式了。

整理。对于收集到的文摘（文献），勤于整理，绝不积压：有价值的保留，无价值的直接舍弃，对保留的文献建立主题属性、文章属性等等的标签云（Readcube支持此功能）。当然，如果你做到了收集的文摘基本都是来源于数据库的，那么这步就可以省略了：再傻的软件也支持对格式明晰的文摘进行检索，随用随查就行。

阅读、标注、再利用就不多说了。（Readcube甚至可以对你在PDF内创建的批注进行检索）

收集文献不要贪大求全，染上囤积癖。对于自己的领域，要清楚核心期刊、核心作者（thought leader)、核心机构，有针对性、有选择性的去收集高质量的文献（这个话题会牵涉文献计量学或科学计量学的内容，有兴趣的可以了解一些基本概念，对于收集文献、储备领域知识、辨别前沿进展的效率是有提升的）

作者：酸菜
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/1132370108

这里再介绍一个可以一键分享，高效在科室内“流通”，并且影响因子一目了然的在线分线管理神器——Pubmed Pro(https://www.pubmed.pro/)

首先第一个功能是查文献：
里面整合了谷歌翻译+IF影响因子两大法器：

有了这2个功能，找文献的效率不要太高哦：老板说，看文献要看5分以上的。木有问题，按IF筛选一下完事儿。看到合适的文章，直接点击“收藏”。

关键是搜索界面还完美适配了手机，不带电脑的时候还可以用手机翻翻文献，简直美翻

前面说的都是如何找到合适的文献，那么找到文献之后怎么办呢，这就要说到网站的

第二个功能：在线文献管理。
1.其实说起来也简单，前面搜索的时候，看到合适的文章可以创建一个收藏夹。

比如找到了6篇EP和miRNA的文章，然后就可以把本地的PDF全部上传到网站上面。所有的PDF都会自动识别，然后和网站上进行匹配，如果没有识别成功，还可以手动匹配。（大概有90%的成功率）

这样我们就有了一个PDF全部存在云端的收藏夹，有点像文献定制版的百度网盘。

2.然后，点击文献夹右面的三个点，选择分享，就会得到一个网址链接，直接把网址发到群里就行啦。

其他人拿到这个链接之后，可以直接在手机上浏览，如果对方想看到PDF附件，就需要点击上面的“关注”，然后在“文献管理”界面就可以看到啦。

这个收藏夹还可以不断更新，我们课题组每个人建了一个收藏夹，这样大家查到的文献就可以及时分享了~

当然这个工具还有很多我不满意的地方。

比如，没办法下载全文，很多时候不在学校，就只好求助scihub了。还有另外一个就是管理功能偏少，参考文献格式啥的统统都木有，和Mendeley功能上还是有很大差距。

不过优势是方便、网速快。

作者：陕西三百六信息科技有限公司
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/322693712

好文献在手，却没有好的文献管理，想引用的时候，突然懵圈，再也想不起来出处在哪，于是只能跑到数据库里大海捞针。周而复始来回于几十篇参考文献之间，最后心力交瘁，看破红尘。

寻求一款靠谱的文件管理软件，虽然word的尾注功能也能管理文献，但是用起来太Low了，高端到爆炸的文献管理软件可以是PubMed，也可以是Endnote、NoteExpress等等。

下面小编以EndNote案例给大家演示一下基本的功能,如何编辑论文的参考文献：

1、安装完Endnote文献管理软件后，word中会自动出现工具条

2、进入中国知网，输入关键词

3、选择好要导入Endnote的文献，然后选择导出。

4、在页面左边的工具选项中选择Endnote,然后选择导出会下载txt格式的文献信息。

5、把刚才下载的txt格式的文献信息导入Endnote

6、把光标放到你想插入参考文献的位置，点击Go to EndNote。

7、选择要插入的参考文献，点击如图所示的按钮即可。

结果如下图所示：

来源 ：西安交通大学研究生教育（ID：xjtu_gsnews） ；学术中国（xueshuzhongguo）

作者：猎人
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/44364190

当然必须是Endnote。

这是界面，左侧是自己建立的分组，根据自己的需要把文献分类到不同的文件夹，方便查找。中间是文献的详细信息，可以自己标注重要程度，对最近要看的关键文献进行标注。

最右是某个文献的预览窗口，可以放大来看，也可以使用adobe打开阅读及修改。

这就是在endnote里面阅读的样子。

最后呢，就是方便与word整合，如下图：

word里可以加入Endnote，在Endnote读完的文献，想要进行引用，直接在这个选项卡下选择Insert Citation， 文献就自动插入了，文章的最后会自动生成References，十分方便。而且也可以从word里面直接选择go to endnote，就可以打开软件。
最后别忘了定期把Endnote保存好，这样你在endnote里面的所有文献都能长期伴随着您，方便查阅。

作者：益加医
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/1140603729

推荐6个文献管理软件Endnote、NoteExpress、Mendeley、NoteFirst、Zotero、papers，希望对大家有所帮助。

1、Endnote

EndNote是最受欢迎的文献管理软件之一，主要用于记录、管理各种途径获得的引文格式文献，并在撰写文章时方便地生成参考文献列表。

能直接链接上千数据库，大大提高科技文献的检索效率；

能管理至少数十万条参考文献，能管理的数据库没有上限；

它的快捷工具嵌入到Word编辑器中，大家可以边写论文边插入参考文献，不会发生格式错误；

EndNote系统占用资源少，即使是低配电脑也能轻松运行。其应用不仅限于投稿论文的写作，对于毕业论文的写作也起到很好的帮助作用。

2、NoteExpress

NoteExpress 可以说是国内最专业的文献检索与管理系统了。它集题录采集、题录管理、题录使用、笔记功能等于一体，旨在为用提供专业强大的文献检服务。可以通过各种方法途径，进行高效、自动的搜索、下载、管理文献资料和研究论文。相比国外的同类型软件，搜索速度更快、更好管理，内置全新的参考文献样式系统，具有极强的兼容性和实用性

3、Mendeley

Mendeley是一款Elsevier公司旗下的免费文献管理软件，集文献的搜集，管理，搜索，阅读，标注和引用等等功能于一身。并且Mendeley还具备多平台同步和云备份功能。现在不仅很多大学的电脑都已经预装了Mendeley，你更是可以在自己的笔记本电脑，手机，iPad上都安装Mendeley客户端，只要一同步，在任何设备上都可以up-to-date地使用。

4、NoteFirst

NoteFirst 是一款网络版文献管理软件。针对个人用户，它集成了文件管理、文献收集、论文中参考文献的自动形成、参考文献自动校对等功能，支持多种其他软件的文件格式，并集成了多语言系统。还推出了团队科研协作的功能，帮助科研团队收集和管理知识、传承经验、分享和交流，以及更好地管理团队任务。

5、Zotero

Zotero是一款能够有效帮助你进行论文内容管理与修改的文献管理工具，它不仅可以抓取你浏览的文献和图书的标题、作者、年卷期等信息，还能将抓取的信息存储在数据库中，进而方便使用者的文献调用。

6、Papers

Papers是一款专业的文献管理工具，支持文献导入、组织、阅读（注释）、自动匹配参考条目、搜索、在文档中插入引用、评点交流等功能。

作者：杨左使 https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/44410297

用Word 写论文就Endnote，用latex写就用BibDesk. 都很好用

作者：费家小吴
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/44259929

可以用学术引文管理软件，如EndNote, Reference Manager, ProCite 等。大多是收费软件，有的学校实验室会买给学生用。

免费的我最近在用Zotero，感觉很不错，而且有浏览器插件，可以直接从学术网站上抓引文。注意只有引文，一般论文的PDF没登陆是下不来的。解决的方法一是手动下载后添加，而是结合其他工具下载。如果有学校账号和平板电脑（我穷人没有平板，细节不明），我们师兄推荐有平板电脑的同学将Zotero结合Browzine使用，可以将学校账号存在Browzine，查到文献后不仅可以自动登陆看文献，还可以导出到Zotero。Zotero的好处是云存储，你可以在多台设备上同步账号。缺陷是免费云存储空间有限，文献PDF的存储路径最好改为本地的，不然很快就满了。

我的习惯是导入时选择包括摘要和关键词，导入后在“Note”之类的字段下面做简要笔记，并链接或者植入文献PDF。这些软件都支持关键词搜索，当然不会搜索到PDF里面的内容，所以文字格式的摘要、关键词以及我们做的笔记就成为很重要的查询线索。

另外谷歌学术和Elsvier等各大学术出版集团网站提供多种文献导出服务，最常见的是RIS格式的，用各种引文管理软件都能打开。谷歌学术在设置（setting）里面有个Bibiography manager，可以选择是否显示导出链接。如果你想重新整理已经有的文献，可以按文章标题在谷歌学术上搜索，直接点导出链接，用引文管理软件打开完成导入，然后再嵌入搜集的PDF即可。祝顺利~

作者：萨摩耶买买提 https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/44355496

endnote呀，不仅可以分类储存文献，还能在写文章时自动添加参考文献到word中。
ps：可去小木虫下载破解版。

作者：barries cran
https://www.zhihu.com/question/29395840/answer/1133091043

目前只用了师兄推荐的Readcubes，下载地址：https://www.papersapp.com/。付费，年费30刀左右，上手体验简直是爽飞级的。可以多设备云共享（包括做的笔记），分类清晰，从文献里的reference提供直接添加到library的功能（如果你有这篇文献的access的话）。醉后导致的结果就像是看论文跟看维基百科一样，reference看着超好玩点进去一篇又点进去另外几篇，看到停不下来……

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转自：https://blog.csdn.net/woshicver/article/details/106030714