集群服务器安装torch_geometric

一. 安装torch_geometric步骤

1.直接在终端输入python，就可以打开python, 并且会显示python的版本

python

2. import torch； print(torch.version) 可以显示torch版本cuda版本

import torch
print(torch.__ version__)

4. 在pytoch-geometric选择对应的版本下载, torch_sparse, torch_cluster, torch_scatter,torch_spline_conv

wget https://data.pyg.org/whl/torch-1.9.0%2Bcu111/torch_cluster-1.5.9-cp38-cp38-linux_x86_64.whl
python -m pip install --user “./torch_cluster-1.5.9-cp38-cp38-linux_x86_64.whl”

5 最后下载torch_geometric

python -m pip install --user torch_geometric

二. 关于集群服务器使用踩坑

1、MobaXterm打开页面和Pychram–Tools–Strat SSH Session打开页面是默认的，不会进入你的设定的python环境，需要导入module来切换

module load anaconda3/py38

2、上面安装torch_geometric只要版本对了就可以了的，出现OSError: libtorch.so: cannot open shared object file: No such file or directory就是因为torch、cuda和torch_cluster等的版本没对上。对于集群服务器就要注意一下，是否你打开的module不对

OSError: libtorch.so: cannot open shared object file: No such file or directory