SCANPY代码部分调试整理1

最近刚刚调通了一个R语言和matlab的源码，相比于现在调的python感觉还是R比较简单，现在只调通了python源码一部分，整理一下
SCANPY代码的核心算法包括：Louvain算法，Louvain算法是一种基于多层次优化Modularity的算法，它的优点是快速、准确，被认为是性能最好的社区发现算法之一。主要调试这个算法算法源码链接：https://github.com/vtraag/louvain-igraph/tree/0.6.1
按照其官网安装方式几次都失败了，特此整理
首先需要windows环境需要gcc和g++环境
为了在 Windows 上安装 GCC，需要到MinGW 的主页 www.mingw.org，进入 MinGW 下载页面，下载最新版本的 MinGW 安装程序。或者到：http://sourceforge.net/projects/mingw/files/，下载 Download mingw-get-setup.exe(86.5kB)

配置环境变量

打开 CMD 在命令提示符下输入 gcc –v, 看到 gcc 版本信息， gcc 安装 OK
如果想安装 g++,gdb,只要输入命令 mingw-get install g++ 和 mingw-get install gdb

由于都是非官方的python程序包需要先下载用于Python扩展包的非官方Windows二进制文件
链接：https://blog.csdn.net/weixin_30929195/article/details/98034987
https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/
需要先下载三个包：但要对应自己当前的python环境，我的环境是python3.5


igraph是免费的复杂网络（graphs）处理包，可以处理百万级节点的网络（取决于机器内存）。igraph提供了R和C语言程序包，以及Python和Ruby语言扩展，它包括的功能包括

对igragh的扩展包
下载后

执行下载命令后报错

原因1：pip命令需要升级，在dos窗口执行上面的指令
原因2：还需要将下载的文件粘贴到对应的目录 C:\User\Administrator

坐等安装

调试成功

服务器anaconda配置有点混乱，等我把服务器配置好再写一篇配置